More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4181 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4181  NAD-dependent deacetylase  100 
 
 
256 aa  518  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000834887  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48810  NAD-dependent deacetylase  95.7 
 
 
256 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.831332  hitchhiker  0.00000000423039 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3685  NAD-dependent deacetylase  69.8 
 
 
247 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209228  decreased coverage  0.000299877 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1704  transcriptional regulator, Sir2 family  70.08 
 
 
248 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33190  NAD-dependent deacetylase  72.66 
 
 
254 aa  362  2e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0689  NAD-dependent deacetylase  47.27 
 
 
263 aa  224  9e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1847  NAD-dependent deacetylase  46.34 
 
 
267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.54805e-22  decreased coverage  0.00894214 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  38.71 
 
 
245 aa  154  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  39.52 
 
 
269 aa  151  8.999999999999999e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  39.37 
 
 
243 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  38.75 
 
 
244 aa  149  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  40.35 
 
 
249 aa  148  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  38.52 
 
 
251 aa  144  1e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  36.69 
 
 
246 aa  143  3e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  37.96 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  37.02 
 
 
306 aa  136  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  32.66 
 
 
242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  35.86 
 
 
251 aa  128  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  37.31 
 
 
251 aa  128  9.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  36.67 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  33.33 
 
 
248 aa  123  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  35.37 
 
 
250 aa  123  3e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  35.46 
 
 
257 aa  122  4e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  33.98 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  33.87 
 
 
245 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  33.33 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  33.59 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  34.29 
 
 
248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0687  silent information regulator protein Sir2  33.2 
 
 
243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  38.68 
 
 
249 aa  118  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  34.96 
 
 
233 aa  118  7.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  40.11 
 
 
248 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  38.75 
 
 
249 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  34.45 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2055  NAD-dependent deacetylase  33.76 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0387901  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2866  NAD-dependent deacetylase  32.92 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0601022  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  35.1 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0098  silent information regulator protein Sir2  37.56 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  34.04 
 
 
242 aa  116  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3082  NAD-dependent deacetylase  32.92 
 
 
242 aa  116  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2154  NAD-dependent deacetylase  32.92 
 
 
242 aa  116  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  38.15 
 
 
245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3115  NAD-dependent deacetylase  32.51 
 
 
242 aa  115  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3114  NAD-dependent deacetylase  32.51 
 
 
242 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0364073  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  31.68 
 
 
259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  36.95 
 
 
252 aa  115  7.999999999999999e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2804  NAD-dependent deacetylase  32.22 
 
 
245 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2874  NAD-dependent deacetylase  32.51 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.84237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3089  NAD-dependent deacetylase  32.51 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152226  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  35.95 
 
 
241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3095  NAD-dependent deacetylase  32.51 
 
 
241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  33.33 
 
 
230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  32.07 
 
 
242 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2718  Silent information regulator protein Sir2  41.08 
 
 
251 aa  113  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  38.52 
 
 
246 aa  113  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2843  NAD-dependent deacetylase  32.22 
 
 
245 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0506229  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  31.47 
 
 
264 aa  113  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  33.61 
 
 
256 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  33.33 
 
 
249 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  31.95 
 
 
252 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2228  NAD-dependent deacetylase  36.69 
 
 
243 aa  112  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2267  NAD-dependent deacetylase  36.69 
 
 
243 aa  112  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  36.97 
 
 
244 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  32.05 
 
 
258 aa  112  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  30.43 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  32.49 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  28.85 
 
 
252 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1797  NAD-dependent deacetylase  31.78 
 
 
246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  33.33 
 
 
262 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  30.23 
 
 
253 aa  108  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4088  silent information regulator protein Sir2  33.73 
 
 
244 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000992713  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2158  Silent information regulator protein Sir2  28.12 
 
 
237 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647526  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1872  NAD-dependent deacetylase  33 
 
 
244 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.747627  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  36.55 
 
 
264 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  32.83 
 
 
247 aa  107  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  32.53 
 
 
284 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  31.54 
 
 
242 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  36.36 
 
 
260 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2682  Silent information regulator protein Sir2  31.37 
 
 
271 aa  106  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  34.36 
 
 
248 aa  105  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  32.28 
 
 
262 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  36.11 
 
 
250 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  32.81 
 
 
256 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3172  silent information regulator protein Sir2  30.8 
 
 
244 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3073  Silent information regulator protein Sir2  40.72 
 
 
236 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224532  decreased coverage  0.0000000244595 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  32.74 
 
 
273 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1071  Silent information regulator protein Sir2  29.52 
 
 
275 aa  103  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  30.92 
 
 
246 aa  103  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1359  silent information regulator protein Sir2  32.14 
 
 
256 aa  103  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  32.92 
 
 
244 aa  102  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  36.41 
 
 
241 aa  103  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  29.88 
 
 
244 aa  102  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  29.88 
 
 
244 aa  102  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  32.89 
 
 
259 aa  102  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0627  silent information regulator protein Sir2  30.53 
 
 
245 aa  102  8e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208993  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1913  silent information regulator protein Sir2  29.54 
 
 
234 aa  102  8e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  27.87 
 
 
243 aa  101  9e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0397  silent information regulator protein Sir2  38.51 
 
 
270 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.470368  hitchhiker  0.0010644 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4029  silent information regulator protein Sir2  32.42 
 
 
279 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0118269  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0509  Silent information regulator protein Sir2  33.64 
 
 
294 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.529427  normal  0.390034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>