More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0397 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0397  silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 279 aa  579  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3087  Sir2 family transcriptional regulator  79.2 
 
 		 275 aa  475  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0913  silent information regulator protein Sir2  68.25 
 
 		 274 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186981  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1402  Silent information regulator protein Sir2  68 
 
 		 277 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472225 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2808  Silent information regulator protein Sir2  67.52 
 
 		 280 aa  395  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0484605  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2770  Silent information regulator protein Sir2  63.53 
 
 		 278 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4302  silent information regulator protein Sir2  65.77 
 
 		 289 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.421117 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2043  silent information regulator protein Sir2  61.11 
 
 		 272 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000115379  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35400  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  56.13 
 
 		 273 aa  288  8e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0919  Silent information regulator protein Sir2  48.55 
 
 		 283 aa  279  3e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1312  Silent information regulator protein Sir2  45.59 
 
 		 274 aa  271  1e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2049  Silent information regulator protein Sir2  52.81 
 
 		 276 aa  267  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0906  silent information regulator protein Sir2  55.38 
 
 		 288 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.737005 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2452  silent information regulator protein Sir2  54.65 
 
 		 290 aa  264  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0465  silent information regulator protein Sir2  52.96 
 
 		 289 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0944  silent information regulator protein Sir2  52.96 
 
 		 289 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3520  silent information regulator protein Sir2  52.69 
 
 		 280 aa  263  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0825  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuA  47.41 
 
 		 272 aa  260  1e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000209586  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0813  silent information regulator protein Sir2  54.47 
 
 		 297 aa  258  8e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4046  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  54.94 
 
 		 290 aa  257  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0803  silent information regulator protein Sir2  53.41 
 
 		 273 aa  255  7e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0338  Silent information regulator protein Sir2  56.2 
 
 		 256 aa  254  8e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227897  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5523  silent information regulator protein Sir2  48.57 
 
 		 273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0448394  normal  0.0436843 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3035  NAD-dependent deacetylase  49.45 
 
 		 343 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365939  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2165  Sir2 family transcriptional regulator  49.26 
 
 		 450 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3116  Sir2 family transcriptional regulator  49.45 
 
 		 351 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2035  Sir2 family transcriptional regulator  49.45 
 
 		 416 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0745  Sir2 family transcriptional regulator  49.45 
 
 		 416 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2578  Sir2 family transcriptional regulator  49.45 
 
 		 416 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2799  silent information regulator protein Sir2  51.79 
 
 		 282 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1518  Sir2 family transcriptional regulator  49.26 
 
 		 343 aa  251  6e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000624517  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0006  silent information regulator protein Sir2  51.6 
 
 		 271 aa  249  4e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.030337 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3089  NAD-dependent deacetylase  48.34 
 
 		 416 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2765  silent information regulator protein Sir2  52.48 
 
 		 285 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4831  silent information regulator protein Sir2  51.6 
 
 		 269 aa  243  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0024  Sir2 family transcriptional regulator  50.59 
 
 		 255 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361903 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0890  NAD-dependent protein deacetylase (SIR2 family), putative  41.22 
 
 		 275 aa  237  2e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0094897  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0817  silent information regulator protein Sir2  40.79 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  34.05 
 
 		 244 aa  105  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  28.57 
 
 		 245 aa  99  7e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  29.22 
 
 		 251 aa  97.8  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33190  NAD-dependent deacetylase  31.28 
 
 		 254 aa  96.7  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  27.95 
 
 		 247 aa  95.5  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  30.17 
 
 		 246 aa  95.1  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  34.34 
 
 		 269 aa  93.2  4e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4181  NAD-dependent deacetylase  26.87 
 
 		 256 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000834887  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  32.64 
 
 		 242 aa  92.4  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  33.91 
 
 		 258 aa  92  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  30.65 
 
 		 242 aa  91.3  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35457  transcriptional regulatory protein  26.89 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0738163  normal  0.450522 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  31.61 
 
 		 249 aa  90.1  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48810  NAD-dependent deacetylase  26.43 
 
 		 256 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.831332  hitchhiker  0.00000000423039 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  34.27 
 
 		 251 aa  89.7  4e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  32.37 
 
 		 251 aa  89.7  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  30.93 
 
 		 266 aa  89.7  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0671  hypothetical protein  25.85 
 
 		 287 aa  89.7  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.40153e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  30.11 
 
 		 257 aa  89.4  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  33.15 
 
 		 256 aa  89  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  31.18 
 
 		 245 aa  89.4  7e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2432  hypothetical protein  26.71 
 
 		 274 aa  88.6  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928742 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5036  Silent information regulator protein Sir2  28.52 
 
 		 295 aa  88.6  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  27.82 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  32.95 
 
 		 244 aa  86.7  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  32.18 
 
 		 260 aa  86.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  29.55 
 
 		 247 aa  86.3  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  32.18 
 
 		 260 aa  85.9  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1872  NAD-dependent deacetylase  30.43 
 
 		 244 aa  85.5  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.747627  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1847  NAD-dependent deacetylase  27.44 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.54805e-22  decreased coverage  0.00894214 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  29.38 
 
 		 248 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  31.28 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  33.73 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  32.2 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  32.43 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  29.35 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0653  hypothetical protein  27.97 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  29.78 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11190  conserved hypothetical protein  25.98 
 
 		 612 aa  80.9  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.650799  normal  0.436192 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  29.89 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21050  hypothetical protein  28.1 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  28.99 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62714  conserved hypothetical protein  24.8 
 
 		 583 aa  81.3  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.424323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4145  Silent information regulator protein Sir2  28.5 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4029  silent information regulator protein Sir2  29.02 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0118269  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  28.74 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  28.65 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0675  hypothetical protein  26.51 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4171  Silent information regulator protein Sir2  28.5 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0151723  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  28.26 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  29.37 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  28.42 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01782  SIR2 family histone deacetylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09210)  27.78 
 
 		 320 aa  78.6  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0364048 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0362  Silent information regulator protein Sir2  29.85 
 
 		 246 aa  78.6  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2493  NAD-dependent deacetylase  25.68 
 
 		 247 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1313  phosphatase  27.75 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703264 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1359  silent information regulator protein Sir2  27.89 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0397  silent information regulator protein Sir2  27.92 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.470368  hitchhiker  0.0010644 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  31.74 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1071  Silent information regulator protein Sir2  30.47 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  27.11 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  29.44 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>