More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_35457 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_35457  transcriptional regulatory protein  100 
 
 		 311 aa  644    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0738163  normal  0.450522 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01782  SIR2 family histone deacetylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09210)  44.95 
 
 		 320 aa  281  9e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0364048 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  34.85 
 
 		 251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  36.81 
 
 		 251 aa  166  5e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  35.55 
 
 		 242 aa  161  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  34.46 
 
 		 246 aa  161  2e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  35.86 
 
 		 269 aa  161  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  35.87 
 
 		 244 aa  159  7e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  36.36 
 
 		 245 aa  150  4e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  33.11 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  33.68 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  35.79 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  36.8 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  36.06 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  33.9 
 
 		 306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  33.6 
 
 		 251 aa  140  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  33.57 
 
 		 258 aa  139  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  35.32 
 
 		 246 aa  139  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  32.54 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  32.24 
 
 		 248 aa  138  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2032  Silent information regulator protein Sir2  34.78 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375007  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  35.34 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  31.36 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  33.56 
 
 		 258 aa  136  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  34.53 
 
 		 243 aa  135  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  33.94 
 
 		 244 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  34.7 
 
 		 273 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  32.03 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  32.17 
 
 		 245 aa  134  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  35.48 
 
 		 247 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  32.2 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  31.94 
 
 		 249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  31.42 
 
 		 241 aa  129  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  33.58 
 
 		 260 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  31.83 
 
 		 284 aa  129  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  32.96 
 
 		 247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0674  NAD-dependent deacetylase  32.64 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0243774  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  30.13 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0264  Silent information regulator protein Sir2  33.2 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  30.31 
 
 		 237 aa  125  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  31.72 
 
 		 262 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  32.88 
 
 		 244 aa  125  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1843  NAD-dependent deacetylase  31.6 
 
 		 254 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000086586  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  33.9 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  31.6 
 
 		 235 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  33.33 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  31.64 
 
 		 252 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2345  NAD-dependent deacetylase  32.39 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.870282 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  30.72 
 
 		 245 aa  122  6e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0003  NAD-dependent deacetylase  33.2 
 
 		 239 aa  122  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2748  NAD-dependent deacetylase  32.08 
 
 		 233 aa  122  7e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.608759 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2337  NAD-dependent deacetylase  31.25 
 
 		 240 aa  122  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1627  Sir2 family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 255 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2173  Silent information regulator protein Sir2  33.86 
 
 		 239 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  33.58 
 
 		 257 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  32.96 
 
 		 243 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1406  5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  31.32 
 
 		 251 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  30.58 
 
 		 256 aa  119  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2203  NAD-dependent deacetylase  30.19 
 
 		 273 aa  119  7.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  30.04 
 
 		 259 aa  119  9e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2809  NAD-dependent deacetylase  29.49 
 
 		 258 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.713265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5854  silent information regulator protein Sir2  34.66 
 
 		 241 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3938  silent information regulator protein Sir2  32.41 
 
 		 237 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02072  NAD-dependent deacetylase  29.76 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01118  NAD-dependent deacetylase  29.81 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2527  Silent information regulator protein Sir2  29.81 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000048723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2006  NAD-dependent deacetylase  29.17 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.423996  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2481  NAD-dependent deacetylase  29.81 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1500  NAD-dependent deacetylase  29.17 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000250063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01126  hypothetical protein  29.81 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1242  NAD-dependent deacetylase  29.81 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00135045  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1211  Silent information regulator protein Sir2  32.14 
 
 		 230 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000184843  hitchhiker  0.000443834 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  35.48 
 
 		 250 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  31.7 
 
 		 237 aa  116  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1635  NAD-dependent deacetylase  30.15 
 
 		 273 aa  116  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2621  NAD-dependent deacetylase  29.05 
 
 		 243 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000617513  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08031  hypothetical protein  30.65 
 
 		 233 aa  115  7.999999999999999e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.580054  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1298  NAD-dependent deacetylase  29.39 
 
 		 273 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1622  NAD-dependent deacetylase  30.89 
 
 		 276 aa  115  7.999999999999999e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1321  NAD-dependent deacetylase  29.39 
 
 		 273 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0350313  hitchhiker  0.00447864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2147  NAD-dependent deacetylase  29.39 
 
 		 273 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.180937  hitchhiker  0.00193472 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1963  NAD-dependent deacetylase  29.39 
 
 		 273 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.696827  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1336  NAD-dependent deacetylase  29.39 
 
 		 273 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0564369 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3213  NAD-dependent deacetylase  29.72 
 
 		 230 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  30.13 
 
 		 245 aa  115  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2781  NAD-dependent deacetylase  30.15 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0690424  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1843  NAD-dependent deacetylase  28.72 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000585877  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2508  NAD-dependent deacetylase  28.72 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000926732  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  28.82 
 
 		 230 aa  113  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2501  NAD-dependent deacetylase  29.51 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000275677  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0687  silent information regulator protein Sir2  29.45 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4088  silent information regulator protein Sir2  29.63 
 
 		 244 aa  113  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000992713  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2892  silent information regulator protein Sir2  31.6 
 
 		 242 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  31.42 
 
 		 242 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1435  NAD-dependent deacetylase  29.49 
 
 		 248 aa  113  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000823864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  30.08 
 
 		 259 aa  112  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  31.6 
 
 		 250 aa  112  6e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  29.89 
 
 		 237 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0531  Silent information regulator protein Sir2  32.68 
 
 		 227 aa  112  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000137862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>