58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_21050 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_21050  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  647    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0675  hypothetical protein  55.7 
 
 		 285 aa  340  2e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0671  hypothetical protein  41.05 
 
 		 287 aa  262  4e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.40153e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0653  hypothetical protein  43.46 
 
 		 279 aa  252  7e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1057  hypothetical protein  37.63 
 
 		 292 aa  227  2e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0375  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase-like protein  37.37 
 
 		 314 aa  202  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0385  hypothetical protein  37.37 
 
 		 314 aa  202  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00950  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  30.19 
 
 		 321 aa  149  7e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0748135  normal  0.482885 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0448  hypothetical protein  25.68 
 
 		 283 aa  129  6e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0392926  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2201  hypothetical protein  33.22 
 
 		 289 aa  123  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.446593  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2432  hypothetical protein  32.32 
 
 		 274 aa  123  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928742 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00960  hypothetical protein  29.15 
 
 		 280 aa  115  7.999999999999999e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0293493  normal  0.617405 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62714  conserved hypothetical protein  28.35 
 
 		 583 aa  113  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.424323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1313  phosphatase  27.66 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703264 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11190  conserved hypothetical protein  29.96 
 
 		 612 aa  90.5  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.650799  normal  0.436192 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3035  NAD-dependent deacetylase  28.52 
 
 		 343 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365939  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0397  silent information regulator protein Sir2  28.1 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0745  Sir2 family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 416 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2578  Sir2 family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 416 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2035  Sir2 family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 416 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3116  Sir2 family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2165  Sir2 family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 450 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1518  Sir2 family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000624517  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3089  NAD-dependent deacetylase  27.76 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1312  Silent information regulator protein Sir2  29.2 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0825  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuA  25.56 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000209586  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2808  Silent information regulator protein Sir2  26.67 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0484605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1402  Silent information regulator protein Sir2  26.02 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472225 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0813  silent information regulator protein Sir2  27.2 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2770  Silent information regulator protein Sir2  25.55 
 
 		 278 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3087  Sir2 family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 275 aa  72  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0919  Silent information regulator protein Sir2  25.32 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0890  NAD-dependent protein deacetylase (SIR2 family), putative  26.4 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0094897  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1648  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  25.82 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2765  silent information regulator protein Sir2  25.84 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0465  silent information regulator protein Sir2  26.67 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0944  silent information regulator protein Sir2  26.67 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0803  silent information regulator protein Sir2  26.4 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0906  silent information regulator protein Sir2  26.97 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.737005 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0913  silent information regulator protein Sir2  24.7 
 
 		 274 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186981  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2452  silent information regulator protein Sir2  25.71 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2043  silent information regulator protein Sir2  24.51 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000115379  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2799  silent information regulator protein Sir2  26.64 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2049  Silent information regulator protein Sir2  24.62 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044542  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4046  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  26.56 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0006  silent information regulator protein Sir2  23.37 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.030337 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3520  silent information regulator protein Sir2  30.81 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0338  Silent information regulator protein Sir2  25.81 
 
 		 256 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227897  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0817  silent information regulator protein Sir2  24.9 
 
 		 350 aa  53.1  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4302  silent information regulator protein Sir2  23.23 
 
 		 289 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.421117 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4831  silent information regulator protein Sir2  23.97 
 
 		 269 aa  52.4  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35400  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  24.61 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  27.54 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0024  Sir2 family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361903 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5523  silent information regulator protein Sir2  22.76 
 
 		 273 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0448394  normal  0.0436843 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  26.67 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5036  Silent information regulator protein Sir2  21.71 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0362  Silent information regulator protein Sir2  27.59 
 
 		 246 aa  43.5  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>