More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1402 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1402  Silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 277 aa  571  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472225 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2808  Silent information regulator protein Sir2  92.34 
 
 		 280 aa  526  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0484605  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0397  silent information regulator protein Sir2  68 
 
 		 279 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3087  Sir2 family transcriptional regulator  66.42 
 
 		 275 aa  385  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0913  silent information regulator protein Sir2  66.06 
 
 		 274 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186981  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2770  Silent information regulator protein Sir2  62.83 
 
 		 278 aa  358  6e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2043  silent information regulator protein Sir2  62.08 
 
 		 272 aa  352  4e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000115379  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4302  silent information regulator protein Sir2  63.95 
 
 		 289 aa  352  5e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.421117 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35400  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  56.41 
 
 		 273 aa  293  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1312  Silent information regulator protein Sir2  50.94 
 
 		 274 aa  280  1e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3520  silent information regulator protein Sir2  52.69 
 
 		 280 aa  268  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0919  Silent information regulator protein Sir2  46.01 
 
 		 283 aa  265  5.999999999999999e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2049  Silent information regulator protein Sir2  53.53 
 
 		 276 aa  261  8.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044542  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0825  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuA  45.93 
 
 		 272 aa  260  1e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000209586  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0338  Silent information regulator protein Sir2  55.43 
 
 		 256 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227897  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0006  silent information regulator protein Sir2  54.15 
 
 		 271 aa  258  6e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.030337 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2765  silent information regulator protein Sir2  54.03 
 
 		 285 aa  255  6e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1518  Sir2 family transcriptional regulator  49.64 
 
 		 343 aa  251  7e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000624517  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3035  NAD-dependent deacetylase  49.82 
 
 		 343 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2035  Sir2 family transcriptional regulator  49.82 
 
 		 416 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3116  Sir2 family transcriptional regulator  49.82 
 
 		 351 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0745  Sir2 family transcriptional regulator  49.82 
 
 		 416 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2578  Sir2 family transcriptional regulator  49.82 
 
 		 416 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2165  Sir2 family transcriptional regulator  49.82 
 
 		 450 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0813  silent information regulator protein Sir2  50.56 
 
 		 297 aa  248  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0803  silent information regulator protein Sir2  50.56 
 
 		 273 aa  244  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5523  silent information regulator protein Sir2  49.28 
 
 		 273 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0448394  normal  0.0436843 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3089  NAD-dependent deacetylase  48.72 
 
 		 416 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0890  NAD-dependent protein deacetylase (SIR2 family), putative  42.54 
 
 		 275 aa  242  3.9999999999999997e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0094897  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4831  silent information regulator protein Sir2  51.78 
 
 		 269 aa  242  6e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2452  silent information regulator protein Sir2  51.17 
 
 		 290 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0465  silent information regulator protein Sir2  49.62 
 
 		 289 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0944  silent information regulator protein Sir2  49.62 
 
 		 289 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0906  silent information regulator protein Sir2  49.25 
 
 		 288 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.737005 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2799  silent information regulator protein Sir2  50.37 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0024  Sir2 family transcriptional regulator  49.8 
 
 		 255 aa  233  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361903 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4046  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  51.39 
 
 		 290 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0817  silent information regulator protein Sir2  39.27 
 
 		 350 aa  183  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2432  hypothetical protein  28.21 
 
 		 274 aa  99.8  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928742 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  36 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  29.51 
 
 		 246 aa  96.7  4e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  28.74 
 
 		 245 aa  95.9  6e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  31.87 
 
 		 242 aa  91.3  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0689  NAD-dependent deacetylase  29.01 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  30.85 
 
 		 249 aa  89.4  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  29.27 
 
 		 251 aa  89.4  7e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1847  NAD-dependent deacetylase  28.11 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.54805e-22  decreased coverage  0.00894214 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  28 
 
 		 249 aa  87.8  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  29.79 
 
 		 249 aa  85.9  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0675  hypothetical protein  25.4 
 
 		 285 aa  85.5  8e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35457  transcriptional regulatory protein  27.51 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0738163  normal  0.450522 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  32.39 
 
 		 244 aa  85.1  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  30.11 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  28.75 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  31.64 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  27.4 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  28.33 
 
 		 247 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1359  silent information regulator protein Sir2  25.98 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  30.68 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1313  phosphatase  29.32 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703264 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  30.39 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  32.96 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33190  NAD-dependent deacetylase  27.62 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  31.64 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  27.87 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0653  hypothetical protein  25.6 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0671  hypothetical protein  23.79 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.40153e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  30.68 
 
 		 306 aa  79  0.00000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  29.41 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3082  NAD-dependent deacetylase  26.09 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  29.78 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  31.95 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  30.77 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  29.57 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  27.54 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0397  silent information regulator protein Sir2  30.89 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.470368  hitchhiker  0.0010644 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  30.43 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3115  NAD-dependent deacetylase  25.54 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2804  NAD-dependent deacetylase  25.53 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  31.98 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3114  NAD-dependent deacetylase  25.54 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0364073  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  26.6 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2866  NAD-dependent deacetylase  25.82 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0601022  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  30.64 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2277  Sir2 family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.256222  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2874  NAD-dependent deacetylase  25.53 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.84237  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  30.39 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3089  NAD-dependent deacetylase  25.53 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152226  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  30.99 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2201  hypothetical protein  29.12 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.446593  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  32.79 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2154  NAD-dependent deacetylase  25.54 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  31.64 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48810  NAD-dependent deacetylase  26.63 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.831332  hitchhiker  0.00000000423039 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01782  SIR2 family histone deacetylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09210)  31.29 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0364048 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  29.28 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  29.21 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3095  NAD-dependent deacetylase  25.82 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4088  silent information regulator protein Sir2  30.05 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000992713  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1872  NAD-dependent deacetylase  29.35 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.747627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>