More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2043 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2043  silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 272 aa  564  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000115379  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2770  Silent information regulator protein Sir2  64.44 
 
 		 278 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3087  Sir2 family transcriptional regulator  63.16 
 
 		 275 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0397  silent information regulator protein Sir2  61.11 
 
 		 279 aa  355  3.9999999999999996e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0913  silent information regulator protein Sir2  65.41 
 
 		 274 aa  354  8.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186981  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1402  Silent information regulator protein Sir2  62.08 
 
 		 277 aa  352  2.9999999999999997e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472225 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2808  Silent information regulator protein Sir2  61.71 
 
 		 280 aa  349  2e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0484605  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4302  silent information regulator protein Sir2  62.85 
 
 		 289 aa  337  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.421117 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1312  Silent information regulator protein Sir2  50.74 
 
 		 274 aa  286  4e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35400  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  53.7 
 
 		 273 aa  280  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0919  Silent information regulator protein Sir2  50.19 
 
 		 283 aa  276  2e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0338  Silent information regulator protein Sir2  54.14 
 
 		 256 aa  271  6e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227897  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0813  silent information regulator protein Sir2  51.84 
 
 		 297 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0803  silent information regulator protein Sir2  51.1 
 
 		 273 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0825  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuA  49.03 
 
 		 272 aa  261  8e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000209586  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0465  silent information regulator protein Sir2  50 
 
 		 289 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0944  silent information regulator protein Sir2  50 
 
 		 289 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0906  silent information regulator protein Sir2  50.37 
 
 		 288 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.737005 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2578  Sir2 family transcriptional regulator  50.74 
 
 		 416 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3035  NAD-dependent deacetylase  50.74 
 
 		 343 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2035  Sir2 family transcriptional regulator  50.74 
 
 		 416 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0745  Sir2 family transcriptional regulator  50.74 
 
 		 416 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3116  Sir2 family transcriptional regulator  50.74 
 
 		 351 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2165  Sir2 family transcriptional regulator  50.74 
 
 		 450 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2049  Silent information regulator protein Sir2  52.12 
 
 		 276 aa  258  7e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044542  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2799  silent information regulator protein Sir2  52.42 
 
 		 282 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3089  NAD-dependent deacetylase  50 
 
 		 416 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1518  Sir2 family transcriptional regulator  48.52 
 
 		 343 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000624517  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2452  silent information regulator protein Sir2  52.53 
 
 		 290 aa  251  7e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5523  silent information regulator protein Sir2  49.26 
 
 		 273 aa  251  7e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0448394  normal  0.0436843 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0890  NAD-dependent protein deacetylase (SIR2 family), putative  44.4 
 
 		 275 aa  251  8.000000000000001e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0094897  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4046  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  52.57 
 
 		 290 aa  249  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3520  silent information regulator protein Sir2  52.21 
 
 		 280 aa  248  7e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0024  Sir2 family transcriptional regulator  50.59 
 
 		 255 aa  247  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361903 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2765  silent information regulator protein Sir2  53.09 
 
 		 285 aa  246  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4831  silent information regulator protein Sir2  51.03 
 
 		 269 aa  237  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0006  silent information regulator protein Sir2  48.81 
 
 		 271 aa  235  6e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.030337 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0817  silent information regulator protein Sir2  38.06 
 
 		 350 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2432  hypothetical protein  28.47 
 
 		 274 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928742 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  27.57 
 
 		 246 aa  99.4  5e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  31.64 
 
 		 251 aa  96.3  5e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  29.38 
 
 		 251 aa  94.4  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  33.7 
 
 		 244 aa  94  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  30.39 
 
 		 269 aa  93.6  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  32.22 
 
 		 249 aa  93.2  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0671  hypothetical protein  27.31 
 
 		 287 aa  92.8  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.40153e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  32.18 
 
 		 244 aa  92.8  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  31.03 
 
 		 247 aa  92.4  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1313  phosphatase  27.8 
 
 		 287 aa  92  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703264 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  27.27 
 
 		 249 aa  92  9e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  29.83 
 
 		 245 aa  90.9  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  30.68 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  28.89 
 
 		 247 aa  90.5  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  30.04 
 
 		 256 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  31.46 
 
 		 248 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  32.53 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  26.61 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  31.32 
 
 		 252 aa  88.6  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0653  hypothetical protein  27.53 
 
 		 279 aa  87.8  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0689  NAD-dependent deacetylase  26.32 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2201  hypothetical protein  26.98 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.446593  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1847  NAD-dependent deacetylase  25.09 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.54805e-22  decreased coverage  0.00894214 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  28.4 
 
 		 258 aa  85.1  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0397  silent information regulator protein Sir2  31.55 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.470368  hitchhiker  0.0010644 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  28 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  31.52 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  28.49 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5036  Silent information regulator protein Sir2  28.57 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33190  NAD-dependent deacetylase  28.49 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  28.88 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  29.48 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  26.52 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0390  Silent information regulator protein Sir2  27.4 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  28.33 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1872  NAD-dependent deacetylase  25.43 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.747627  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4181  NAD-dependent deacetylase  28.33 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000834887  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2493  NAD-dependent deacetylase  27.59 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  25.28 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48810  NAD-dependent deacetylase  27.78 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.831332  hitchhiker  0.00000000423039 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  28.98 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11190  conserved hypothetical protein  26.81 
 
 		 612 aa  79  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.650799  normal  0.436192 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  29.19 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  29.63 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  31.43 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  32.29 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1398  Silent information regulator protein Sir2  27.47 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00225806  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1359  silent information regulator protein Sir2  29.78 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1704  transcriptional regulator, Sir2 family  25.6 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3685  NAD-dependent deacetylase  24.49 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209228  decreased coverage  0.000299877 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  28.49 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3082  NAD-dependent deacetylase  25.54 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2154  NAD-dependent deacetylase  25 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35457  transcriptional regulatory protein  24.09 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0738163  normal  0.450522 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  29.31 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2055  NAD-dependent deacetylase  25 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0387901  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0362  Silent information regulator protein Sir2  27.22 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2866  NAD-dependent deacetylase  25 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0601022  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  28.16 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  28.33 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3114  NAD-dependent deacetylase  25 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0364073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>