More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1704 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1704  transcriptional regulator, Sir2 family  100 
 
 		 248 aa  508  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3685  NAD-dependent deacetylase  93.12 
 
 		 247 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209228  decreased coverage  0.000299877 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48810  NAD-dependent deacetylase  70.49 
 
 		 256 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.831332  hitchhiker  0.00000000423039 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4181  NAD-dependent deacetylase  70.08 
 
 		 256 aa  363  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000834887  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33190  NAD-dependent deacetylase  66.8 
 
 		 254 aa  338  7e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1847  NAD-dependent deacetylase  48.98 
 
 		 267 aa  228  7e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.54805e-22  decreased coverage  0.00894214 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0689  NAD-dependent deacetylase  52.28 
 
 		 263 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  39.2 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  38.62 
 
 		 249 aa  149  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  36.63 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  37.3 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  32.22 
 
 		 242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  37.45 
 
 		 256 aa  136  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  36.11 
 
 		 251 aa  136  4e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  35.46 
 
 		 246 aa  136  4e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  34.01 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  40.08 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  33.6 
 
 		 257 aa  131  7.999999999999999e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  35.37 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  33.61 
 
 		 250 aa  122  4e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  32.8 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  36.84 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  35.66 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  34.45 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2055  NAD-dependent deacetylase  33.75 
 
 		 238 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0387901  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  33.97 
 
 		 265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  35.42 
 
 		 245 aa  118  7e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  34.58 
 
 		 233 aa  116  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  31.73 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  31.73 
 
 		 254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  34.18 
 
 		 230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  33.47 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  29.34 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  38.83 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2154  NAD-dependent deacetylase  32 
 
 		 242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  35.48 
 
 		 258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3082  NAD-dependent deacetylase  32 
 
 		 242 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  34.73 
 
 		 247 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2866  NAD-dependent deacetylase  32 
 
 		 241 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0601022  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2228  NAD-dependent deacetylase  36.32 
 
 		 243 aa  112  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2267  NAD-dependent deacetylase  36.32 
 
 		 243 aa  112  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3115  NAD-dependent deacetylase  32 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2874  NAD-dependent deacetylase  30.95 
 
 		 245 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.84237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3089  NAD-dependent deacetylase  30.95 
 
 		 245 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152226  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  30.08 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2804  NAD-dependent deacetylase  31.84 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  31.06 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3114  NAD-dependent deacetylase  31.6 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0364073  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2718  Silent information regulator protein Sir2  41.9 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  33.87 
 
 		 256 aa  109  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  35.22 
 
 		 249 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3095  NAD-dependent deacetylase  30.8 
 
 		 241 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  33.33 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  33.2 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  36 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1797  NAD-dependent deacetylase  27.92 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  32.83 
 
 		 247 aa  107  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2843  NAD-dependent deacetylase  31.43 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0506229  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  35.56 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  31.8 
 
 		 266 aa  106  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  36.67 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  32.95 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  34.8 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  35.5 
 
 		 262 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2748  NAD-dependent deacetylase  34.55 
 
 		 233 aa  105  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.608759 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  31.98 
 
 		 248 aa  105  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  32.19 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  29.41 
 
 		 246 aa  105  9e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  31.03 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  32.79 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  30.38 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1336  Sir2 family regulator  30.83 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.690541  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0003  NAD-dependent deacetylase  34.06 
 
 		 239 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  33.62 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  29.88 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2134  NAD-dependent deacetylase  31.67 
 
 		 236 aa  102  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.626555  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2158  Silent information regulator protein Sir2  29.24 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647526  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  32.68 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  30.87 
 
 		 249 aa  102  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1398  Silent information regulator protein Sir2  29.1 
 
 		 243 aa  102  7e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00225806  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  31.66 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  33.2 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  33.77 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  29.55 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3172  silent information regulator protein Sir2  30.71 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0747  silent information regulator protein Sir2  28.29 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00199209  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  30.56 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  30.56 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  27.98 
 
 		 243 aa  99.8  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2493  NAD-dependent deacetylase  34.36 
 
 		 247 aa  99.4  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  33.47 
 
 		 242 aa  99.4  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  34.8 
 
 		 246 aa  98.6  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  28.86 
 
 		 248 aa  99  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  29.61 
 
 		 241 aa  98.6  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1662  NAD-dependent deacetylase  32.92 
 
 		 248 aa  98.6  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00629212  normal  0.0795648 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1406  5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  30.12 
 
 		 251 aa  98.6  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01782  SIR2 family histone deacetylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09210)  42.4 
 
 		 320 aa  98.2  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0364048 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0687  silent information regulator protein Sir2  32.26 
 
 		 243 aa  97.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0098  silent information regulator protein Sir2  33.07 
 
 		 249 aa  97.8  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4088  silent information regulator protein Sir2  33.33 
 
 		 244 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000992713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>