More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4831 on replicon NC_008759
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008759  Pnap_4831  silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 269 aa  555  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2765  silent information regulator protein Sir2  73.17 
 
 		 285 aa  382  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0813  silent information regulator protein Sir2  61.16 
 
 		 297 aa  299  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0803  silent information regulator protein Sir2  58.08 
 
 		 273 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2799  silent information regulator protein Sir2  56.91 
 
 		 282 aa  295  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0024  Sir2 family transcriptional regulator  61.71 
 
 		 255 aa  292  3e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361903 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0906  silent information regulator protein Sir2  57.59 
 
 		 288 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.737005 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5523  silent information regulator protein Sir2  55.24 
 
 		 273 aa  285  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0448394  normal  0.0436843 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0465  silent information regulator protein Sir2  57.59 
 
 		 289 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0944  silent information regulator protein Sir2  57.59 
 
 		 289 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0006  silent information regulator protein Sir2  59.09 
 
 		 271 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.030337 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2452  silent information regulator protein Sir2  58.94 
 
 		 290 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2049  Silent information regulator protein Sir2  58.2 
 
 		 276 aa  276  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044542  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1312  Silent information regulator protein Sir2  52.02 
 
 		 274 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3089  NAD-dependent deacetylase  55.28 
 
 		 416 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2578  Sir2 family transcriptional regulator  55.28 
 
 		 416 aa  272  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3035  NAD-dependent deacetylase  55.28 
 
 		 343 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365939  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3116  Sir2 family transcriptional regulator  55.28 
 
 		 351 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2035  Sir2 family transcriptional regulator  55.28 
 
 		 416 aa  272  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0745  Sir2 family transcriptional regulator  55.28 
 
 		 416 aa  272  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2165  Sir2 family transcriptional regulator  55.28 
 
 		 450 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4046  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  58.09 
 
 		 290 aa  271  7e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1518  Sir2 family transcriptional regulator  55.51 
 
 		 343 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000624517  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35400  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  56.13 
 
 		 273 aa  266  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2808  Silent information regulator protein Sir2  53.6 
 
 		 280 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0484605  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0919  Silent information regulator protein Sir2  47.57 
 
 		 283 aa  248  6e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0397  silent information regulator protein Sir2  51.6 
 
 		 279 aa  243  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1402  Silent information regulator protein Sir2  51.78 
 
 		 277 aa  242  6e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472225 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2043  silent information regulator protein Sir2  51.03 
 
 		 272 aa  237  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000115379  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0338  Silent information regulator protein Sir2  52.74 
 
 		 256 aa  234  8e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227897  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3087  Sir2 family transcriptional regulator  49.6 
 
 		 275 aa  233  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0913  silent information regulator protein Sir2  49.6 
 
 		 274 aa  232  5e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186981  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2770  Silent information regulator protein Sir2  50.2 
 
 		 278 aa  231  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3520  silent information regulator protein Sir2  50.79 
 
 		 280 aa  229  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4302  silent information regulator protein Sir2  53.25 
 
 		 289 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.421117 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0825  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuA  45.75 
 
 		 272 aa  224  2e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000209586  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0890  NAD-dependent protein deacetylase (SIR2 family), putative  44.35 
 
 		 275 aa  218  6e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0094897  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0817  silent information regulator protein Sir2  45 
 
 		 350 aa  216  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  35.39 
 
 		 244 aa  92  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1313  phosphatase  32.31 
 
 		 287 aa  90.5  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703264 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  29.24 
 
 		 246 aa  89.7  5e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  34.24 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  32.62 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5036  Silent information regulator protein Sir2  27.24 
 
 		 295 aa  86.3  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2432  hypothetical protein  27.37 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928742 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  29.15 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  29.12 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11190  conserved hypothetical protein  30.42 
 
 		 612 aa  82  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.650799  normal  0.436192 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  30.48 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  27.49 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  34.43 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  31.79 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  31.03 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0689  NAD-dependent deacetylase  28.57 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  29.41 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4145  Silent information regulator protein Sir2  26.67 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  28.08 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  31.52 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0397  silent information regulator protein Sir2  27.02 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.470368  hitchhiker  0.0010644 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  29.14 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33190  NAD-dependent deacetylase  27.09 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  27.09 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4171  Silent information regulator protein Sir2  26.25 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0151723  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62714  conserved hypothetical protein  26.58 
 
 		 583 aa  75.1  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.424323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  26.46 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1872  NAD-dependent deacetylase  26.64 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.747627  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3073  Silent information regulator protein Sir2  32.74 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224532  decreased coverage  0.0000000244595 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  25.96 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  25.96 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  25.3 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  32.76 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  26.46 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  32.42 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4029  silent information regulator protein Sir2  26.41 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0118269  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35457  transcriptional regulatory protein  30.99 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0738163  normal  0.450522 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  28.96 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  26.69 
 
 		 245 aa  72  0.000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  27.2 
 
 		 257 aa  72  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  29.94 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  26.11 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  32.93 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  28.89 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  26.38 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  24.59 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  28.15 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  31.87 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1033  Sir2 family regulatory protein  25.95 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  30.77 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2201  hypothetical protein  25.97 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.446593  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01782  SIR2 family histone deacetylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09210)  28.29 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0364048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1847  NAD-dependent deacetylase  27.52 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.54805e-22  decreased coverage  0.00894214 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  25.82 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  26.89 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12340  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  31.18 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.63712  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  32.43 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  29.89 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  29.31 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  28.65 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0362  Silent information regulator protein Sir2  32.42 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  30.34 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>