More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3520 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3520  silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 280 aa  578  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1312  Silent information regulator protein Sir2  54.21 
 
 		 274 aa  323  1e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0919  Silent information regulator protein Sir2  51.6 
 
 		 283 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2770  Silent information regulator protein Sir2  54.15 
 
 		 278 aa  290  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0825  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuA  52.38 
 
 		 272 aa  289  4e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000209586  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1402  Silent information regulator protein Sir2  52.69 
 
 		 277 aa  285  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472225 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35400  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  54.55 
 
 		 273 aa  284  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2808  Silent information regulator protein Sir2  52.33 
 
 		 280 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0484605  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0397  silent information regulator protein Sir2  52.69 
 
 		 279 aa  278  8e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3087  Sir2 family transcriptional regulator  52.69 
 
 		 275 aa  272  6e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2765  silent information regulator protein Sir2  53.08 
 
 		 285 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4302  silent information regulator protein Sir2  55 
 
 		 289 aa  268  5e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.421117 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2049  Silent information regulator protein Sir2  51.27 
 
 		 276 aa  266  4e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044542  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0913  silent information regulator protein Sir2  50.9 
 
 		 274 aa  264  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186981  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2043  silent information regulator protein Sir2  51.48 
 
 		 272 aa  264  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000115379  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5523  silent information regulator protein Sir2  49.64 
 
 		 273 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0448394  normal  0.0436843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0338  Silent information regulator protein Sir2  51.88 
 
 		 256 aa  258  8e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227897  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3035  NAD-dependent deacetylase  50.93 
 
 		 343 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365939  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2799  silent information regulator protein Sir2  51.13 
 
 		 282 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2165  Sir2 family transcriptional regulator  50.93 
 
 		 450 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3116  Sir2 family transcriptional regulator  50.93 
 
 		 351 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1518  Sir2 family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 343 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000624517  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2035  Sir2 family transcriptional regulator  50.93 
 
 		 416 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0745  Sir2 family transcriptional regulator  50.93 
 
 		 416 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2578  Sir2 family transcriptional regulator  50.93 
 
 		 416 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0006  silent information regulator protein Sir2  51.38 
 
 		 271 aa  249  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.030337 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0890  NAD-dependent protein deacetylase (SIR2 family), putative  44.8 
 
 		 275 aa  246  4e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0094897  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4831  silent information regulator protein Sir2  50.79 
 
 		 269 aa  245  4.9999999999999997e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3089  NAD-dependent deacetylase  50.19 
 
 		 416 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0813  silent information regulator protein Sir2  51.42 
 
 		 297 aa  235  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0024  Sir2 family transcriptional regulator  49 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361903 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2452  silent information regulator protein Sir2  52.77 
 
 		 290 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0906  silent information regulator protein Sir2  51.01 
 
 		 288 aa  231  9e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.737005 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0465  silent information regulator protein Sir2  51.42 
 
 		 289 aa  231  9e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0944  silent information regulator protein Sir2  51.42 
 
 		 289 aa  231  9e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0803  silent information regulator protein Sir2  50.2 
 
 		 273 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4046  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  52.17 
 
 		 290 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0817  silent information regulator protein Sir2  41.88 
 
 		 350 aa  212  7e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2432  hypothetical protein  28.83 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928742 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  33.71 
 
 		 244 aa  102  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5036  Silent information regulator protein Sir2  27.4 
 
 		 295 aa  95.9  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2201  hypothetical protein  32.32 
 
 		 289 aa  95.5  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.446593  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  30.73 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33190  NAD-dependent deacetylase  31.52 
 
 		 254 aa  89.7  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  25.91 
 
 		 245 aa  89.7  5e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  28.8 
 
 		 251 aa  89.4  7e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  35.29 
 
 		 246 aa  89  8e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  30.71 
 
 		 269 aa  87  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0671  hypothetical protein  26.72 
 
 		 287 aa  87  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.40153e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  33.52 
 
 		 251 aa  86.7  4e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4145  Silent information regulator protein Sir2  26.69 
 
 		 279 aa  86.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  34.43 
 
 		 243 aa  86.3  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62714  conserved hypothetical protein  24.41 
 
 		 583 aa  86.3  5e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.424323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0689  NAD-dependent deacetylase  29.07 
 
 		 263 aa  85.9  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4171  Silent information regulator protein Sir2  27.09 
 
 		 279 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0151723  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0397  silent information regulator protein Sir2  30.11 
 
 		 270 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.470368  hitchhiker  0.0010644 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  31.76 
 
 		 248 aa  85.9  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0653  hypothetical protein  28.4 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  30.68 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  28 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  31.87 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1847  NAD-dependent deacetylase  26.98 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.54805e-22  decreased coverage  0.00894214 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4029  silent information regulator protein Sir2  27.09 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0118269  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  31.46 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1313  phosphatase  28.63 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703264 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35457  transcriptional regulatory protein  26.89 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0738163  normal  0.450522 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  33.94 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  26.62 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  31.55 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1872  NAD-dependent deacetylase  27.74 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.747627  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  32.57 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  25.1 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11190  conserved hypothetical protein  29.08 
 
 		 612 aa  80.1  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.650799  normal  0.436192 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  27.34 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  24.91 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01782  SIR2 family histone deacetylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09210)  27.81 
 
 		 320 aa  79  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0364048 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  26.81 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  31.79 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  30.81 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  28.15 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48810  NAD-dependent deacetylase  28.89 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.831332  hitchhiker  0.00000000423039 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  30.43 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  30.05 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  27.91 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1336  Sir2 family regulator  30.86 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.690541  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1033  Sir2 family regulatory protein  25.52 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0675  hypothetical protein  25.32 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4181  NAD-dependent deacetylase  28.89 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000834887  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  30.18 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3685  NAD-dependent deacetylase  30.48 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209228  decreased coverage  0.000299877 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  29.96 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  30.73 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  32.12 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  26.6 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  30 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3073  Silent information regulator protein Sir2  34.3 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224532  decreased coverage  0.0000000244595 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  28.49 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21050  hypothetical protein  30.81 
 
 		 311 aa  72  0.000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  28.42 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  29.19 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>