More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0188 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0188  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  100 
 
 
376 aa  746    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3018  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  85.11 
 
 
376 aa  642    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.559203  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0170  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  99.73 
 
 
376 aa  744    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.135886  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0420  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  56.1 
 
 
373 aa  391  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.019387  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0510  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  52.92 
 
 
373 aa  362  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0121409 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0465  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  52.79 
 
 
373 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238845  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5795  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  54.04 
 
 
372 aa  348  8e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831254  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0404  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  51.5 
 
 
377 aa  342  5.999999999999999e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133547  normal  0.0561317 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4117  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  40.87 
 
 
385 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1846  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  40.58 
 
 
385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000726333 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4746  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  42.2 
 
 
392 aa  232  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.934073 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1341  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  40.82 
 
 
382 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.354944  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2565  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  39.31 
 
 
390 aa  224  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.461378  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1681  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  39.33 
 
 
386 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3187  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  40.06 
 
 
395 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4717  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  41.71 
 
 
388 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.413844  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0599  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  38.27 
 
 
392 aa  209  4e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38894  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1775  tRNA synthetase class II (G H P and S)  37.23 
 
 
379 aa  199  7e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349459  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4292  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  37.29 
 
 
380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  0.0362525 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2646  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  37.75 
 
 
378 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0804  tRNA synthetase class II (G H P and S)  38.57 
 
 
371 aa  194  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0821563 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4934  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.36 
 
 
379 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1777  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.49 
 
 
387 aa  180  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253476  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1499  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.02 
 
 
387 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.355503  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1498  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.49 
 
 
387 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.694394  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2954  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.88 
 
 
368 aa  133  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.826684  normal  0.0199101 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4680  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.18 
 
 
380 aa  129  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.843824 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0946  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.42 
 
 
369 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0504  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30 
 
 
363 aa  124  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.483735  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3952  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.73 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0242262 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3550  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.65 
 
 
365 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.370469  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1924  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.73 
 
 
360 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0724806 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3835  histidine--tRNA ligase  31.22 
 
 
466 aa  109  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000618349  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3187  histidyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 
484 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2187  histidyl-tRNA synthetase 2  30.94 
 
 
479 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2915  histidyl-tRNA synthetase  31.22 
 
 
484 aa  100  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0577  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.11 
 
 
517 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  26.86 
 
 
431 aa  77.8  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  23.37 
 
 
418 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3154  histidyl-tRNA synthetase  27.32 
 
 
526 aa  71.2  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.447073  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  23.26 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  24.44 
 
 
427 aa  69.3  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  26.76 
 
 
419 aa  69.3  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  22.53 
 
 
456 aa  68.9  0.0000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  24.23 
 
 
421 aa  69.3  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  24.36 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0749  histidyl-tRNA synthetase 2  27.33 
 
 
389 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70094  histidine tRNA synthetase  21.16 
 
 
536 aa  67.4  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.768048  normal  0.208592 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  24.79 
 
 
421 aa  67.4  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1289  histidyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 
531 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0599  histidyl-tRNA synthetase  27.91 
 
 
492 aa  65.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0139702 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  24.65 
 
 
470 aa  65.5  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  23.08 
 
 
442 aa  65.1  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0894  histidyl-tRNA synthetase  22.25 
 
 
409 aa  63.9  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0307852  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1740  histidyl-tRNA synthetase  24.42 
 
 
544 aa  63.5  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.965854  normal  0.114975 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00046  histidyl-tRNA synthetase, mitochondrial precursor (AFU_orthologue; AFUA_4G12920)  23.68 
 
 
549 aa  63.2  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361819  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0893  histidyl-tRNA synthetase  25.07 
 
 
519 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200439  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02980  histidyl-tRNA synthetase  24.79 
 
 
427 aa  62.4  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651371  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0503  histidyl-tRNA synthetase  27.73 
 
 
500 aa  62.4  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1369  histidyl-tRNA synthetase  25.89 
 
 
509 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0999423  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2533  histidyl-tRNA synthetase  24.59 
 
 
547 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1185  histidyl-tRNA synthetase  26.27 
 
 
526 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445744  normal  0.165943 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1489  Histidine--tRNA ligase  33.86 
 
 
383 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00266166  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1770  histidine--tRNA ligase  26.84 
 
 
387 aa  61.2  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0828194  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2880  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.14 
 
 
418 aa  60.8  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.164097  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  22.75 
 
 
421 aa  60.8  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  26.27 
 
 
439 aa  60.5  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  23.05 
 
 
430 aa  60.5  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  30 
 
 
418 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3234  histidyl-tRNA synthetase  27.91 
 
 
543 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1457  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  21.45 
 
 
420 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1686  histidyl-tRNA synthetase  25.61 
 
 
503 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685076  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1335  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.28 
 
 
318 aa  60.1  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1169  histidyl-tRNA synthetase  24.43 
 
 
448 aa  60.1  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0566185  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1143  histidyl-tRNA synthetase  30 
 
 
453 aa  59.7  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.8111  normal  0.0102442 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1289  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  21.72 
 
 
420 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  23.88 
 
 
444 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1288  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  21.72 
 
 
420 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1555  histidyl-tRNA synthetase  25 
 
 
503 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.84291 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0380  histidyl-tRNA synthetase 2  30 
 
 
419 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3551  histidyl-tRNA synthetase  27.62 
 
 
494 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340591  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1834  histidyl-tRNA synthetase  25 
 
 
503 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.848692 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4935  histidyl-tRNA synthetase  26.99 
 
 
508 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158251  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0509  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.05 
 
 
408 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1009  histidine--tRNA ligase  30 
 
 
413 aa  57.8  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1315  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  21.45 
 
 
420 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1495  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  21.45 
 
 
420 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1424  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  21.45 
 
 
420 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09591  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.8 
 
 
383 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3887  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  20.91 
 
 
420 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0758  histidyl-tRNA synthetase  32.48 
 
 
467 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0886  histidyl-tRNA synthetase 2  43.84 
 
 
404 aa  57.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.151754  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1563  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  21.45 
 
 
420 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1753  histidyl-tRNA synthetase  26.39 
 
 
465 aa  57  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.058114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0985  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  43.84 
 
 
404 aa  57  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0965259  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3951  histidyl-tRNA synthetase  26.72 
 
 
494 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0501682 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0805  histidyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 
501 aa  56.2  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0510234 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  48 
 
 
448 aa  56.2  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 
454 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2647  histidyl-tRNA synthetase  27.2 
 
 
532 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.708997  normal  0.141234 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>