More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_09591 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_09591  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  100 
 
 
383 aa  756    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0900  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  89.56 
 
 
383 aa  655    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.510844  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09611  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  96.34 
 
 
383 aa  707    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09821  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  68.93 
 
 
383 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.557826  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1402  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.42 
 
 
392 aa  268  1e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.484993  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1085  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.93 
 
 
392 aa  267  2e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15231  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.56 
 
 
392 aa  255  9e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.306827 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08611  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.86 
 
 
392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169143 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0307  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.1 
 
 
391 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.114028  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09801  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.1 
 
 
391 aa  242  1e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.37508 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0886  histidyl-tRNA synthetase 2  24.44 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.151754  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0813  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.87 
 
 
420 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.493486  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3900  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.13 
 
 
401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0985  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.8 
 
 
404 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0965259  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1354  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.24 
 
 
407 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1384  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.24 
 
 
407 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0509  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.97 
 
 
408 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2981  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.06 
 
 
392 aa  99.4  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3158  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.49 
 
 
394 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 
427 aa  86.3  9e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2002  Histidine--tRNA ligase  23.87 
 
 
409 aa  82.4  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  25.23 
 
 
409 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0749  histidyl-tRNA synthetase 2  25.15 
 
 
389 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  25.68 
 
 
431 aa  79  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1272  histidyl-tRNA synthetase  23.74 
 
 
408 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0694221  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  25.55 
 
 
418 aa  77  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  23.65 
 
 
426 aa  76.6  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  22.66 
 
 
415 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 
430 aa  76.3  0.0000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4683  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  25.55 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.416531 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  26.5 
 
 
418 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1288  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.13 
 
 
420 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1289  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.13 
 
 
420 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1495  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.61 
 
 
420 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  24.78 
 
 
418 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1563  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.74 
 
 
420 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0675  tRNA synthetase class II (G H P and S)  25 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1315  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.13 
 
 
420 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1424  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.13 
 
 
420 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  24.68 
 
 
421 aa  70.5  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0999  histidine--tRNA ligase  26.89 
 
 
380 aa  70.5  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.357666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3887  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.32 
 
 
420 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1093  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.36 
 
 
389 aa  70.1  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1326  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.51 
 
 
420 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1524  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.51 
 
 
420 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1100  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.47 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  24.52 
 
 
423 aa  68.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  21.24 
 
 
424 aa  68.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1457  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23 
 
 
420 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  22.4 
 
 
408 aa  67.8  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0503  histidyl-tRNA synthetase  19.55 
 
 
500 aa  67.8  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  24.91 
 
 
410 aa  67  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3533  histidyl-tRNA synthetase 2  22.26 
 
 
346 aa  67  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217945  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  25.62 
 
 
419 aa  66.6  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1925  histidyl-tRNA synthetase  20.4 
 
 
494 aa  66.6  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968692  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf392  histidyl-tRNA synthetase  24.92 
 
 
417 aa  66.6  0.0000000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.438879  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0894  histidyl-tRNA synthetase  24.05 
 
 
409 aa  66.2  0.0000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0307852  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1130  histidyl-tRNA synthetase  21.92 
 
 
403 aa  66.2  0.0000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0629126  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  25.39 
 
 
421 aa  66.2  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  25.48 
 
 
418 aa  66.2  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  24.3 
 
 
456 aa  66.2  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0765  histidine--tRNA ligase  24.35 
 
 
412 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0442  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.57 
 
 
393 aa  65.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  24.34 
 
 
377 aa  65.1  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_750  histidyl-tRNA synthetase  24.44 
 
 
412 aa  64.7  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.878399  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0846  histidyl-tRNA synthetase, putative  24.03 
 
 
412 aa  64.3  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  25.16 
 
 
423 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  26.82 
 
 
418 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1946  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.25 
 
 
370 aa  63.9  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  23.34 
 
 
421 aa  63.9  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0786  histidyl-tRNA synthetase  24.79 
 
 
408 aa  64.3  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00313764  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0476  tRNA synthetase class II (G H P and S)  21.75 
 
 
381 aa  64.3  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108226 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  22.19 
 
 
414 aa  63.9  0.000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0566  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.18 
 
 
440 aa  63.5  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1336e-23 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  23.32 
 
 
423 aa  63.5  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5012  histidyl-tRNA synthetase  20.45 
 
 
423 aa  63.5  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0324448 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1770  histidine--tRNA ligase  27.53 
 
 
387 aa  63.2  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0828194  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1247  histidyl-tRNA synthetase  24.79 
 
 
408 aa  63.2  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0392037  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  26.82 
 
 
418 aa  62.8  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0856  histidyl-tRNA synthetase  25.65 
 
 
408 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2880  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.84 
 
 
418 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.164097  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0712  histidyl-tRNA synthetase  26.18 
 
 
413 aa  62.8  0.00000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.666191  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  23.24 
 
 
409 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15290  ATP phosphoribosyltransferase  24.57 
 
 
538 aa  62.8  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0291  histidyl-tRNA synthetase  26.45 
 
 
413 aa  62.4  0.00000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1078  ATP phosphoribosyltransferase  18.91 
 
 
554 aa  62.4  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00640346  hitchhiker  0.0000000000210065 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0925  histidyl-tRNA synthetase  22.96 
 
 
410 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0599  histidyl-tRNA synthetase  21.62 
 
 
492 aa  62.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0139702 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  23.7 
 
 
470 aa  62.4  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  24.62 
 
 
411 aa  62  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  21.76 
 
 
420 aa  62  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3018  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.85 
 
 
376 aa  61.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.559203  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2037  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.42 
 
 
389 aa  61.2  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2715  histidyl-tRNA synthetase  19.13 
 
 
431 aa  61.2  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0979277  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  20.32 
 
 
419 aa  60.8  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0553  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.1 
 
 
440 aa  60.5  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264933  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88696  predicted protein  24.52 
 
 
525 aa  60.5  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2285  histidyl-tRNA synthetase  26.05 
 
 
418 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370181  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2324  histidyl-tRNA synthetase  26.05 
 
 
418 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0514444  normal  0.0262983 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2332  histidyl-tRNA synthetase  26.05 
 
 
418 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.170172 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>