More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0307 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0307  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  100 
 
 
391 aa  792    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.114028  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09801  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  98.72 
 
 
391 aa  783    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.37508 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1402  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  41.69 
 
 
392 aa  362  6e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.484993  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1085  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  41.18 
 
 
392 aa  356  2.9999999999999997e-97  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08611  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  43.22 
 
 
392 aa  341  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169143 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15231  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  42.46 
 
 
392 aa  336  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.306827 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09821  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.95 
 
 
383 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.557826  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0900  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.94 
 
 
383 aa  256  5e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.510844  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09611  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.11 
 
 
383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09591  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.11 
 
 
383 aa  253  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0813  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.22 
 
 
420 aa  178  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.493486  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0886  histidyl-tRNA synthetase 2  30.09 
 
 
404 aa  178  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.151754  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0509  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.7 
 
 
408 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0985  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.66 
 
 
404 aa  156  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0965259  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1384  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.82 
 
 
407 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1354  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.57 
 
 
407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3900  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.01 
 
 
401 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2002  Histidine--tRNA ligase  26.88 
 
 
409 aa  113  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2787  histidine--tRNA ligase  25.26 
 
 
418 aa  107  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3158  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.33 
 
 
394 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4470  histidyl-tRNA synthetase 2  22.97 
 
 
449 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0749  histidyl-tRNA synthetase 2  25.89 
 
 
389 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  26.01 
 
 
418 aa  103  5e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2981  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.07 
 
 
392 aa  97.8  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  26.44 
 
 
418 aa  97.4  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3533  histidyl-tRNA synthetase 2  27.38 
 
 
346 aa  95.9  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217945  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  24.01 
 
 
418 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  23.85 
 
 
418 aa  95.1  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  23.71 
 
 
418 aa  94.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  26.69 
 
 
427 aa  93.2  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  24.1 
 
 
418 aa  93.6  6e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0999  histidine--tRNA ligase  24.18 
 
 
380 aa  92.8  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.357666  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  22.29 
 
 
409 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2359  histidine--tRNA ligase  24.55 
 
 
401 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  23.68 
 
 
431 aa  89.4  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2037  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.24 
 
 
389 aa  87.8  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1770  histidine--tRNA ligase  24.92 
 
 
387 aa  87.4  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0828194  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1282  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  26.79 
 
 
387 aa  85.9  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15290  ATP phosphoribosyltransferase  26.05 
 
 
538 aa  85.9  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  25.19 
 
 
419 aa  84.7  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0661  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.2 
 
 
392 aa  84.3  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0405  histidyl-tRNA synthetase  25.84 
 
 
425 aa  84  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  23.02 
 
 
421 aa  83.6  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  25.44 
 
 
456 aa  83.6  0.000000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2880  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.35 
 
 
418 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.164097  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  26.74 
 
 
430 aa  83.2  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1009  histidine--tRNA ligase  25.33 
 
 
413 aa  82.8  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0257  histidyl-tRNA synthetase  22.4 
 
 
458 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.828616 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4683  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  27.36 
 
 
382 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.416531 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0054  histidyl-tRNA synthetase  23.8 
 
 
415 aa  81.6  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  22.99 
 
 
377 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  24.77 
 
 
410 aa  82  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0675  tRNA synthetase class II (G H P and S)  24.86 
 
 
387 aa  81.3  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1093  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.85 
 
 
389 aa  81.3  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  25.29 
 
 
421 aa  81.3  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10378  histidyl-tRNA synthetase  23.67 
 
 
456 aa  80.9  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.549064  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0519  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.55 
 
 
445 aa  80.5  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227641  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  24.23 
 
 
430 aa  79.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  24.85 
 
 
424 aa  79  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_750  histidyl-tRNA synthetase  22.99 
 
 
412 aa  79.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.878399  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0173  histidyl-tRNA synthetase  23.38 
 
 
462 aa  79.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65250  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.91 
 
 
394 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0846  histidyl-tRNA synthetase, putative  22.73 
 
 
412 aa  79  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1288  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.06 
 
 
420 aa  79  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1289  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.06 
 
 
420 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  23.53 
 
 
415 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  25.86 
 
 
421 aa  78.6  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0783  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.7 
 
 
395 aa  78.6  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0661  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.1 
 
 
438 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0588271  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0765  histidine--tRNA ligase  22.87 
 
 
412 aa  78.2  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1457  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.06 
 
 
420 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  21.5 
 
 
408 aa  77.8  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0566  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.48 
 
 
440 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1336e-23 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3307  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.1 
 
 
438 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1495  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.8 
 
 
420 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  25.58 
 
 
426 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  23.38 
 
 
417 aa  77.4  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3887  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.8 
 
 
420 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  25.58 
 
 
426 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  25.58 
 
 
426 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  21.64 
 
 
470 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1315  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.03 
 
 
420 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1424  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.03 
 
 
420 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1264  histidyl-tRNA synthetase  25.15 
 
 
349 aa  77.4  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0508371  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0380  histidyl-tRNA synthetase 2  22.75 
 
 
419 aa  77  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2599  Histidine--tRNA ligase  24.4 
 
 
349 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  23.49 
 
 
421 aa  77  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0553  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.93 
 
 
440 aa  77  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264933  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2077  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.85 
 
 
383 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1826  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.01 
 
 
382 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.551052 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1106  histidyl-tRNA synthetase  24.74 
 
 
446 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1344  histidyl-tRNA synthetase  24.74 
 
 
446 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2353  histidyl-tRNA synthetase  24.74 
 
 
446 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0063  histidyl-tRNA synthetase  24.74 
 
 
446 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00160741  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  25.58 
 
 
426 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1834  histidyl-tRNA synthetase  24.74 
 
 
446 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  23.29 
 
 
410 aa  76.3  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  25.46 
 
 
424 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6277  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.01 
 
 
382 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.621674  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1946  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.18 
 
 
370 aa  76.3  0.0000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>