More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0509 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0509  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  100 
 
 
408 aa  830    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1354  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  70.76 
 
 
407 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1384  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  70.52 
 
 
407 aa  595  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0985  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  58.72 
 
 
404 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0965259  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0886  histidyl-tRNA synthetase 2  58.92 
 
 
404 aa  464  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.151754  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3900  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  55.12 
 
 
401 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0813  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  50.97 
 
 
420 aa  356  3.9999999999999996e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.493486  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1402  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.71 
 
 
392 aa  169  9e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.484993  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1085  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.06 
 
 
392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15231  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.47 
 
 
392 aa  156  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.306827 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  30.46 
 
 
418 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 
418 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3158  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.62 
 
 
394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 
418 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09801  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.99 
 
 
391 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.37508 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2880  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.89 
 
 
418 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.164097  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  25.74 
 
 
418 aa  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0307  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.7 
 
 
391 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.114028  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4470  histidyl-tRNA synthetase 2  32.32 
 
 
449 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3533  histidyl-tRNA synthetase 2  31.86 
 
 
346 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217945  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2359  histidine--tRNA ligase  30.02 
 
 
401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  26.35 
 
 
418 aa  138  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08611  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.41 
 
 
392 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169143 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  25.12 
 
 
418 aa  137  4e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2037  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.6 
 
 
389 aa  135  9e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0202  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.25 
 
 
428 aa  134  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000325703  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3307  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.75 
 
 
438 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0749  histidyl-tRNA synthetase 2  29.62 
 
 
389 aa  133  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1770  histidine--tRNA ligase  28.72 
 
 
387 aa  129  7.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0828194  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2981  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.2 
 
 
392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  27.57 
 
 
426 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3259  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.86 
 
 
434 aa  126  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0331239  hitchhiker  0.000000000000235665 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1489  Histidine--tRNA ligase  28.65 
 
 
383 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00266166  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  26.46 
 
 
457 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0999  histidine--tRNA ligase  24.67 
 
 
380 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.357666  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  26.03 
 
 
454 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0566  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.81 
 
 
440 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1336e-23 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  29.39 
 
 
431 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  27.88 
 
 
470 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0519  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.67 
 
 
445 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227641  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  27.76 
 
 
409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  28.53 
 
 
409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  28.02 
 
 
410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  26.4 
 
 
439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1100  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.54 
 
 
413 aa  116  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0380  histidyl-tRNA synthetase 2  25.06 
 
 
419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  26.4 
 
 
419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  26.57 
 
 
421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  27.71 
 
 
427 aa  114  3e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  26.42 
 
 
377 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1078  ATP phosphoribosyltransferase  29.75 
 
 
554 aa  114  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00640346  hitchhiker  0.0000000000210065 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  26.7 
 
 
421 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  25.7 
 
 
417 aa  113  5e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0553  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.93 
 
 
440 aa  112  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264933  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15290  ATP phosphoribosyltransferase  30.89 
 
 
538 aa  112  9e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  29.66 
 
 
430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09821  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.78 
 
 
383 aa  110  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.557826  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0661  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.44 
 
 
438 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0588271  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  26.42 
 
 
419 aa  109  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2599  Histidine--tRNA ligase  30.09 
 
 
349 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2692  histidyl-tRNA synthetase 2  30.09 
 
 
349 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  26.09 
 
 
429 aa  109  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3252  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.45 
 
 
429 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000291491  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06881  histidyl-tRNA synthetase  26.62 
 
 
429 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2187  histidyl-tRNA synthetase 2  28.35 
 
 
479 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0900  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25 
 
 
383 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.510844  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  28.33 
 
 
415 aa  106  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  25.98 
 
 
421 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0783  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.82 
 
 
395 aa  106  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  28.46 
 
 
410 aa  105  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09591  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.66 
 
 
383 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1264  histidyl-tRNA synthetase  29.45 
 
 
349 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0508371  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  27.09 
 
 
426 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1502  Histidine--tRNA ligase  26.83 
 
 
415 aa  103  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2787  histidine--tRNA ligase  25.75 
 
 
418 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  28.01 
 
 
408 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  26.85 
 
 
423 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  29.02 
 
 
429 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  25.54 
 
 
423 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  25.54 
 
 
423 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  25.54 
 
 
423 aa  101  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  25.54 
 
 
423 aa  101  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  25.54 
 
 
423 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  25.49 
 
 
423 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  25.54 
 
 
423 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0054  histidyl-tRNA synthetase  26.5 
 
 
415 aa  100  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  25.54 
 
 
423 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  25.54 
 
 
423 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  25.54 
 
 
423 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  26.87 
 
 
428 aa  100  5e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  24.46 
 
 
421 aa  100  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0295  histidyl-tRNA synthetase  25.37 
 
 
430 aa  99.8  8e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000190773  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06791  histidyl-tRNA synthetase  26.47 
 
 
426 aa  99.8  9e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09611  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.32 
 
 
383 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2008  histidyl-tRNA synthetase  25.12 
 
 
454 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10378  histidyl-tRNA synthetase  26.52 
 
 
456 aa  98.6  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.549064  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  26.28 
 
 
434 aa  98.6  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  26.89 
 
 
400 aa  98.2  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  27.63 
 
 
423 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06491  histidyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 
426 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>