More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1502 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1502  Histidine--tRNA ligase  100 
 
 
415 aa  816    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0553  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.06 
 
 
440 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264933  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0566  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.06 
 
 
440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1336e-23 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3259  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.33 
 
 
434 aa  241  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0331239  hitchhiker  0.000000000000235665 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0661  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.9 
 
 
438 aa  240  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0588271  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0519  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.27 
 
 
445 aa  235  9e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227641  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0202  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.01 
 
 
428 aa  228  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000325703  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3307  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32 
 
 
438 aa  226  8e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3252  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.43 
 
 
429 aa  210  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000291491  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2880  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.59 
 
 
418 aa  196  8.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.164097  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  32.52 
 
 
418 aa  193  6e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1489  Histidine--tRNA ligase  31.44 
 
 
383 aa  190  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00266166  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0999  histidine--tRNA ligase  33.17 
 
 
380 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.357666  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0749  histidyl-tRNA synthetase 2  33.06 
 
 
389 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2002  Histidine--tRNA ligase  30.16 
 
 
409 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2662  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit, putative  31.01 
 
 
394 aa  174  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0577  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.62 
 
 
401 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000998206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4942  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.98 
 
 
395 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052087 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2787  histidine--tRNA ligase  31.19 
 
 
418 aa  164  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1770  histidine--tRNA ligase  30.85 
 
 
387 aa  162  7e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0828194  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0380  histidyl-tRNA synthetase 2  28.12 
 
 
419 aa  162  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4470  histidyl-tRNA synthetase 2  28.35 
 
 
449 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4681  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.34 
 
 
395 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4890  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.03 
 
 
395 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625991  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4766  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.03 
 
 
395 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2627  tRNA synthetase class II (G H P and S)  26.58 
 
 
392 aa  158  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000799306 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3380  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.33 
 
 
385 aa  157  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2037  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.84 
 
 
389 aa  156  7e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65250  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.32 
 
 
394 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2586  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.62 
 
 
397 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.368474  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0527  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.29 
 
 
395 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558326  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2359  histidine--tRNA ligase  31.13 
 
 
401 aa  151  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1584  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  27.15 
 
 
387 aa  150  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.495225  unclonable  0.000000222283 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2915  histidyl-tRNA synthetase  25.32 
 
 
484 aa  149  9e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3158  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.67 
 
 
394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0606  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.34 
 
 
321 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0902  histidyl-tRNA synthetase 2  26.76 
 
 
395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.188473  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  30.03 
 
 
418 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5668  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.16 
 
 
394 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863885  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0576  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.92 
 
 
395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1605  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.4 
 
 
383 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.344405  normal  0.350031 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2975  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.45 
 
 
384 aa  147  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0661  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.34 
 
 
392 aa  147  5e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  30.31 
 
 
418 aa  146  5e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1979  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.72 
 
 
406 aa  146  6e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.495499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1524  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.32 
 
 
420 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1315  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.34 
 
 
420 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1424  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.34 
 
 
420 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2531  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.11 
 
 
383 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.020462  hitchhiker  0.00000966794 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1495  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.21 
 
 
420 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  29.02 
 
 
418 aa  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1288  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.34 
 
 
420 aa  145  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0640  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.03 
 
 
395 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4938  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit, putative  25.53 
 
 
395 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1289  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.34 
 
 
420 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2981  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30 
 
 
392 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  32.38 
 
 
430 aa  144  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0675  tRNA synthetase class II (G H P and S)  27.78 
 
 
387 aa  143  5e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  28.05 
 
 
421 aa  142  8e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1563  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.23 
 
 
420 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  25.94 
 
 
427 aa  142  9.999999999999999e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1326  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.86 
 
 
420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2244  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.53 
 
 
382 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.682852  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07590  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.8 
 
 
395 aa  140  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1281  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.64 
 
 
393 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.679748  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  26.81 
 
 
431 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2179  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.21 
 
 
382 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  27.75 
 
 
421 aa  140  6e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0577  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.29 
 
 
517 aa  139  7e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0765  histidine--tRNA ligase  28.12 
 
 
412 aa  139  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1940  tRNA synthetase class II (G H P and S)  25.75 
 
 
394 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6277  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.38 
 
 
382 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.621674  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1802  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.38 
 
 
382 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184149  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1335  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.21 
 
 
382 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128033  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1824  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.21 
 
 
382 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2345  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.21 
 
 
382 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1096  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.21 
 
 
382 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.35877  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0072  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.21 
 
 
382 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1826  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.38 
 
 
382 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.551052 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3887  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.22 
 
 
420 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1713  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.38 
 
 
382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740694  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2217  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.21 
 
 
382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00641952  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1225  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.74 
 
 
386 aa  137  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00306433  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5103  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.08 
 
 
382 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.480937  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  29 
 
 
418 aa  137  4e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1472  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.33 
 
 
382 aa  136  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.573457  normal  0.256348 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  26.94 
 
 
417 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1740  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.85 
 
 
382 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1902  histidyl-tRNA synthetase  26.68 
 
 
425 aa  136  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1457  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.22 
 
 
420 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2077  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.6 
 
 
383 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1161  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.27 
 
 
387 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.365246 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2765  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  25.86 
 
 
393 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466804  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3024  histidyl-tRNA synthetase  26.92 
 
 
425 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.49218  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1264  histidyl-tRNA synthetase  27.93 
 
 
349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0508371  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  27.43 
 
 
419 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3835  histidine--tRNA ligase  24.61 
 
 
466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000618349  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3130  histidyl-tRNA synthetase  26.54 
 
 
425 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3376  histidyl-tRNA synthetase  26.54 
 
 
425 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0442  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.3 
 
 
393 aa  134  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>