More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0519 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0519  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  100 
 
 
445 aa  890    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227641  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3307  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  68.87 
 
 
438 aa  560  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0661  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  67.34 
 
 
438 aa  550  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0588271  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3259  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  63.21 
 
 
434 aa  535  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0331239  hitchhiker  0.000000000000235665 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0553  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  61.65 
 
 
440 aa  533  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264933  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0566  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  64.5 
 
 
440 aa  529  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1336e-23 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3252  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  57.64 
 
 
429 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000291491  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0202  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  52.54 
 
 
428 aa  442  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000325703  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2880  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.9 
 
 
418 aa  268  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.164097  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0380  histidyl-tRNA synthetase 2  35.57 
 
 
419 aa  258  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0999  histidine--tRNA ligase  37.82 
 
 
380 aa  249  8e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.357666  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2037  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  42.16 
 
 
389 aa  244  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  37.64 
 
 
418 aa  241  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2002  Histidine--tRNA ligase  32.56 
 
 
409 aa  232  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0749  histidyl-tRNA synthetase 2  35.81 
 
 
389 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2359  histidine--tRNA ligase  38.81 
 
 
401 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1502  Histidine--tRNA ligase  32.27 
 
 
415 aa  216  9e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3887  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.05 
 
 
420 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1524  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.51 
 
 
420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1457  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.05 
 
 
420 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1563  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.26 
 
 
420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4470  histidyl-tRNA synthetase 2  37.31 
 
 
449 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1288  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.26 
 
 
420 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1326  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.64 
 
 
420 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1289  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30 
 
 
420 aa  210  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1315  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30 
 
 
420 aa  210  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1424  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30 
 
 
420 aa  210  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1495  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.74 
 
 
420 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1489  Histidine--tRNA ligase  36.11 
 
 
383 aa  208  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00266166  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1770  histidine--tRNA ligase  34.82 
 
 
387 aa  207  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0828194  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2787  histidine--tRNA ligase  32.75 
 
 
418 aa  206  6e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07590  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.25 
 
 
395 aa  194  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0576  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  37.85 
 
 
395 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4938  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit, putative  38.01 
 
 
395 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0640  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.91 
 
 
395 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65250  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.59 
 
 
394 aa  190  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4681  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  37.22 
 
 
395 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0527  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.59 
 
 
395 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558326  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0577  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.59 
 
 
401 aa  187  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000998206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4890  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  37.22 
 
 
395 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625991  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5668  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.16 
 
 
394 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863885  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4942  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  37.11 
 
 
395 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052087 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4766  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  37.22 
 
 
395 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2692  histidyl-tRNA synthetase 2  38.39 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2505  histidine--tRNA ligase  37.15 
 
 
343 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000404758 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2599  Histidine--tRNA ligase  38.39 
 
 
349 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  30.63 
 
 
418 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1264  histidyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 
349 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0508371  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  29.52 
 
 
418 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2586  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.8 
 
 
397 aa  178  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.368474  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  29.62 
 
 
418 aa  178  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1100  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  37.22 
 
 
413 aa  177  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 
418 aa  176  6e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0606  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.16 
 
 
321 aa  173  6.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2627  tRNA synthetase class II (G H P and S)  31.84 
 
 
392 aa  170  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000799306 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  29.59 
 
 
409 aa  169  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1281  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.33 
 
 
393 aa  169  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.679748  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0661  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.12 
 
 
392 aa  167  4e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3533  histidyl-tRNA synthetase 2  34.48 
 
 
346 aa  167  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217945  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1563  tRNA synthetase class II (G H P and S)  31.63 
 
 
400 aa  167  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1888  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.63 
 
 
400 aa  167  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  29.23 
 
 
377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2765  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  32.92 
 
 
393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466804  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1584  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  32.78 
 
 
387 aa  164  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.495225  unclonable  0.000000222283 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  30.85 
 
 
421 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1078  ATP phosphoribosyltransferase  36.08 
 
 
554 aa  163  5.0000000000000005e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00640346  hitchhiker  0.0000000000210065 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2662  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit, putative  30.7 
 
 
394 aa  163  6e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 
431 aa  163  7e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  31.19 
 
 
434 aa  162  8.000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  32.25 
 
 
421 aa  162  9e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  31.27 
 
 
417 aa  161  2e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0747  Histidine--tRNA ligase  34.69 
 
 
386 aa  159  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000807665  hitchhiker  0.00573832 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2834  histidyl-tRNA synthetase 2  32.71 
 
 
368 aa  159  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0476  tRNA synthetase class II (G H P and S)  35.16 
 
 
381 aa  159  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108226 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15290  ATP phosphoribosyltransferase  31.8 
 
 
538 aa  159  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1940  tRNA synthetase class II (G H P and S)  31.47 
 
 
394 aa  158  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2077  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.59 
 
 
383 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1522  histidyl-tRNA synthetase  31.5 
 
 
432 aa  157  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  26.52 
 
 
418 aa  155  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0783  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.43 
 
 
395 aa  154  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  31.48 
 
 
419 aa  153  5e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1302  histidyl-tRNA synthetase  29.81 
 
 
436 aa  153  5e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.194766  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1480  tRNA synthetase class II (G H P and S)  30.36 
 
 
393 aa  153  7e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2975  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.23 
 
 
384 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2981  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.63 
 
 
392 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1225  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.23 
 
 
386 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00306433  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0442  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.22 
 
 
393 aa  150  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2097  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.12 
 
 
383 aa  151  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0834258 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1161  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.5 
 
 
387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.365246 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0902  histidyl-tRNA synthetase 2  30.19 
 
 
395 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.188473  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  25.65 
 
 
421 aa  148  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  26.74 
 
 
419 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3489  histidyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 
434 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  28.24 
 
 
470 aa  147  5e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1069  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.19 
 
 
387 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1979  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.8 
 
 
406 aa  145  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.495499  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5010  tRNA synthetase class II (G H P and S)  31.89 
 
 
382 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  29.56 
 
 
410 aa  145  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  28.26 
 
 
424 aa  145  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1093  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.33 
 
 
389 aa  145  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>