More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3252 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3252  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  100 
 
 
429 aa  870    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000291491  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3307  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  55.95 
 
 
438 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3259  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  56.32 
 
 
434 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0331239  hitchhiker  0.000000000000235665 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0519  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  57.64 
 
 
445 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227641  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0661  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  53.63 
 
 
438 aa  457  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0588271  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0553  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  53.83 
 
 
440 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264933  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0566  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  53.59 
 
 
440 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1336e-23 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0202  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  48.92 
 
 
428 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000325703  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0380  histidyl-tRNA synthetase 2  34.85 
 
 
419 aa  258  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2880  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.78 
 
 
418 aa  250  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.164097  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0749  histidyl-tRNA synthetase 2  37.26 
 
 
389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0999  histidine--tRNA ligase  38.32 
 
 
380 aa  227  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.357666  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  33.58 
 
 
418 aa  227  4e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2037  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  38.07 
 
 
389 aa  219  7e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2002  Histidine--tRNA ligase  31.01 
 
 
409 aa  212  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2359  histidine--tRNA ligase  37.6 
 
 
401 aa  206  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1489  Histidine--tRNA ligase  33.59 
 
 
383 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00266166  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2787  histidine--tRNA ligase  33.44 
 
 
418 aa  192  9e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0527  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  37.54 
 
 
395 aa  192  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558326  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4470  histidyl-tRNA synthetase 2  35.61 
 
 
449 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1770  histidine--tRNA ligase  32.6 
 
 
387 aa  191  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0828194  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1502  Histidine--tRNA ligase  28.43 
 
 
415 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1457  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.62 
 
 
420 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3887  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.34 
 
 
420 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1563  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.87 
 
 
420 aa  190  5e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07590  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  37.22 
 
 
395 aa  189  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1288  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.17 
 
 
420 aa  189  7e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4681  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  37.62 
 
 
395 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1524  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.95 
 
 
420 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1315  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.65 
 
 
420 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1289  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.91 
 
 
420 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1424  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.65 
 
 
420 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0640  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  38.2 
 
 
395 aa  188  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65250  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  37.22 
 
 
394 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1495  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.65 
 
 
420 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0576  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  37.89 
 
 
395 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4890  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  37.62 
 
 
395 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625991  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4766  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  37.62 
 
 
395 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5668  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.48 
 
 
394 aa  186  7e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863885  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4942  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.99 
 
 
395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052087 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1326  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.65 
 
 
420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4938  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit, putative  36.91 
 
 
395 aa  183  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0577  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.53 
 
 
401 aa  182  8.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000998206 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  29.77 
 
 
418 aa  179  7e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  29.77 
 
 
418 aa  179  8e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  28.27 
 
 
418 aa  179  8e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  29.01 
 
 
418 aa  176  9e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2765  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  34.91 
 
 
393 aa  173  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466804  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2627  tRNA synthetase class II (G H P and S)  31.68 
 
 
392 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000799306 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1281  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.65 
 
 
393 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.679748  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2586  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.02 
 
 
397 aa  170  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.368474  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2505  histidine--tRNA ligase  37.96 
 
 
343 aa  170  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000404758 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2662  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit, putative  31.96 
 
 
394 aa  170  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1563  tRNA synthetase class II (G H P and S)  32.55 
 
 
400 aa  166  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1888  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.55 
 
 
400 aa  166  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0902  histidyl-tRNA synthetase 2  32.09 
 
 
395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.188473  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2981  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.92 
 
 
392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0606  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.53 
 
 
321 aa  164  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2692  histidyl-tRNA synthetase 2  36.81 
 
 
349 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  29.74 
 
 
409 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2599  Histidine--tRNA ligase  36.81 
 
 
349 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  28.35 
 
 
418 aa  163  6e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1264  histidyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 
349 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0508371  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1100  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.81 
 
 
413 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0661  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.81 
 
 
392 aa  162  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3158  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.21 
 
 
394 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2008  tRNA synthetase class II (G H P and S)  32.83 
 
 
399 aa  157  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00513827  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  29.77 
 
 
431 aa  157  4e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1940  tRNA synthetase class II (G H P and S)  32.92 
 
 
394 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5010  tRNA synthetase class II (G H P and S)  32.91 
 
 
382 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15290  ATP phosphoribosyltransferase  31.03 
 
 
538 aa  155  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2834  histidyl-tRNA synthetase 2  32.72 
 
 
368 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2197  histidyl-tRNA synthetase 2  33.33 
 
 
386 aa  153  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5103  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.05 
 
 
382 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.480937  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  26.72 
 
 
377 aa  152  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6277  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.05 
 
 
382 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.621674  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1826  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.05 
 
 
382 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.551052 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1802  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.05 
 
 
382 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184149  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  29.26 
 
 
417 aa  151  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1584  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  30.33 
 
 
387 aa  151  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.495225  unclonable  0.000000222283 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  28.93 
 
 
421 aa  151  2e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  30.3 
 
 
434 aa  150  4e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1979  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.96 
 
 
406 aa  150  5e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.495499  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2097  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.54 
 
 
383 aa  149  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0834258 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1282  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  30.68 
 
 
387 aa  149  8e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2077  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.91 
 
 
383 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1740  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.05 
 
 
382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1713  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.05 
 
 
382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740694  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2244  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.2 
 
 
382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.682852  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1078  ATP phosphoribosyltransferase  35.09 
 
 
554 aa  148  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00640346  hitchhiker  0.0000000000210065 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  30.75 
 
 
421 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1180  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  32.59 
 
 
382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.869352  normal  0.414984 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0072  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.89 
 
 
382 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3489  histidyl-tRNA synthetase  28.64 
 
 
434 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1335  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.89 
 
 
382 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128033  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2975  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.08 
 
 
384 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2345  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.89 
 
 
382 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2297  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  30.91 
 
 
382 aa  147  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.526463  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1824  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.89 
 
 
382 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1096  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.89 
 
 
382 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.35877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>