More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1100 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1100  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  100 
 
 
413 aa  795    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2359  histidine--tRNA ligase  35.71 
 
 
401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2880  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.38 
 
 
418 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.164097  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0380  histidyl-tRNA synthetase 2  31.59 
 
 
419 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0749  histidyl-tRNA synthetase 2  36.87 
 
 
389 aa  192  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  32.4 
 
 
418 aa  192  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2037  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  39.73 
 
 
389 aa  186  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1489  Histidine--tRNA ligase  37.96 
 
 
383 aa  186  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00266166  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0661  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.03 
 
 
438 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0588271  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0519  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  37.22 
 
 
445 aa  177  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227641  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3307  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.2 
 
 
438 aa  176  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2981  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.78 
 
 
392 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0999  histidine--tRNA ligase  32.5 
 
 
380 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.357666  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2787  histidine--tRNA ligase  31.69 
 
 
418 aa  169  8e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3259  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.81 
 
 
434 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0331239  hitchhiker  0.000000000000235665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3533  histidyl-tRNA synthetase 2  39.13 
 
 
346 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217945  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1770  histidine--tRNA ligase  35.68 
 
 
387 aa  164  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0828194  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0202  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.13 
 
 
428 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000325703  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3252  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.81 
 
 
429 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000291491  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0566  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.52 
 
 
440 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1336e-23 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3158  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.25 
 
 
394 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0553  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.24 
 
 
440 aa  158  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264933  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2002  Histidine--tRNA ligase  29.91 
 
 
409 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15290  ATP phosphoribosyltransferase  33.44 
 
 
538 aa  153  5e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1288  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.54 
 
 
420 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3887  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.3 
 
 
420 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1563  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29 
 
 
420 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1495  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.43 
 
 
420 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1289  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.27 
 
 
420 aa  150  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1457  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.3 
 
 
420 aa  150  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1524  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.73 
 
 
420 aa  149  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1315  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.54 
 
 
420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1424  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.54 
 
 
420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1326  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.4 
 
 
420 aa  146  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1078  ATP phosphoribosyltransferase  33.44 
 
 
554 aa  142  8e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00640346  hitchhiker  0.0000000000210065 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0783  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  37.1 
 
 
395 aa  139  7.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  28.43 
 
 
418 aa  138  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  31.11 
 
 
417 aa  137  4e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0985  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.74 
 
 
404 aa  137  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0965259  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3900  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.83 
 
 
401 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  31.25 
 
 
409 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  28.91 
 
 
418 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  28.84 
 
 
418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  28.84 
 
 
418 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0576  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.56 
 
 
395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  29.51 
 
 
377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0527  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.23 
 
 
395 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558326  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  28.76 
 
 
421 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  31.51 
 
 
427 aa  127  5e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4938  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit, putative  31.2 
 
 
395 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0886  histidyl-tRNA synthetase 2  30.63 
 
 
404 aa  126  8.000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.151754  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4470  histidyl-tRNA synthetase 2  32.87 
 
 
449 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07590  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.86 
 
 
395 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  28.73 
 
 
418 aa  125  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0640  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.49 
 
 
395 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226727 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1480  tRNA synthetase class II (G H P and S)  30.25 
 
 
393 aa  123  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4681  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.33 
 
 
395 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 
419 aa  123  6e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4890  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.33 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625991  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4766  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.33 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  32.4 
 
 
431 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  30.96 
 
 
421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  29.03 
 
 
426 aa  121  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5668  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.19 
 
 
394 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863885  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4942  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.39 
 
 
395 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052087 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0675  tRNA synthetase class II (G H P and S)  32.24 
 
 
387 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65250  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.25 
 
 
394 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1605  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.01 
 
 
383 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.344405  normal  0.350031 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0509  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.54 
 
 
408 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  25.7 
 
 
421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2077  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.45 
 
 
383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2505  histidine--tRNA ligase  35.62 
 
 
343 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000404758 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2531  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.73 
 
 
383 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.020462  hitchhiker  0.00000966794 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  25.82 
 
 
417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  29.58 
 
 
439 aa  113  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1264  histidyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 
349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0508371  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0923  Histidine--tRNA ligase  31.49 
 
 
370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00438339  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  29.33 
 
 
420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1096  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.21 
 
 
382 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.35877  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1824  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.21 
 
 
382 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1335  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.21 
 
 
382 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128033  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2217  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.21 
 
 
382 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00641952  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2179  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.21 
 
 
382 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2345  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.21 
 
 
382 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  29.34 
 
 
419 aa  111  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1302  histidyl-tRNA synthetase  29.11 
 
 
436 aa  110  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.194766  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  27.47 
 
 
421 aa  111  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2244  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.21 
 
 
382 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.682852  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0422  histidyl-tRNA synthetase  27.56 
 
 
503 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00502968  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2692  histidyl-tRNA synthetase 2  36.76 
 
 
349 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0072  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.21 
 
 
382 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  29.97 
 
 
430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2599  Histidine--tRNA ligase  36.76 
 
 
349 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  30.88 
 
 
429 aa  110  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  26 
 
 
418 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  28.29 
 
 
470 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  29.67 
 
 
423 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1584  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  29.46 
 
 
387 aa  109  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.495225  unclonable  0.000000222283 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2097  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.82 
 
 
383 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0834258 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2955  histidyl-tRNA synthetase  28.65 
 
 
497 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48972  normal  0.0224984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>