More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0747 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0747  Histidine--tRNA ligase  100 
 
 
386 aa  758    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000807665  hitchhiker  0.00573832 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2834  histidyl-tRNA synthetase 2  67.79 
 
 
368 aa  485  1e-136  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0783  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  45.07 
 
 
395 aa  267  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0999  histidine--tRNA ligase  31.71 
 
 
380 aa  176  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.357666  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2880  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.28 
 
 
418 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.164097  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0749  histidyl-tRNA synthetase 2  37.77 
 
 
389 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0380  histidyl-tRNA synthetase 2  28.21 
 
 
419 aa  160  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0519  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.69 
 
 
445 aa  159  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227641  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0661  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.79 
 
 
438 aa  156  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0588271  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3307  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.44 
 
 
438 aa  155  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0553  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.73 
 
 
440 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264933  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3259  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.66 
 
 
434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0331239  hitchhiker  0.000000000000235665 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0566  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.43 
 
 
440 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1336e-23 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  27.43 
 
 
418 aa  145  9e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3252  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.5 
 
 
429 aa  142  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000291491  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1524  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.32 
 
 
420 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2037  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.15 
 
 
389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2002  Histidine--tRNA ligase  29.73 
 
 
409 aa  139  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1563  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.57 
 
 
420 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2586  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.59 
 
 
397 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.368474  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1457  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.14 
 
 
420 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1288  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.82 
 
 
420 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1495  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.52 
 
 
420 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1315  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.82 
 
 
420 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1289  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.57 
 
 
420 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1424  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.82 
 
 
420 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0577  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.06 
 
 
401 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000998206 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1480  tRNA synthetase class II (G H P and S)  31.37 
 
 
393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0202  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.4 
 
 
428 aa  137  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000325703  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1489  Histidine--tRNA ligase  31.52 
 
 
383 aa  137  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00266166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3887  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.64 
 
 
420 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1326  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.15 
 
 
420 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2787  histidine--tRNA ligase  27.18 
 
 
418 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2359  histidine--tRNA ligase  33.33 
 
 
401 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4681  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.78 
 
 
395 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4470  histidyl-tRNA synthetase 2  35.38 
 
 
449 aa  132  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1770  histidine--tRNA ligase  31.27 
 
 
387 aa  130  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0828194  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0527  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.7 
 
 
395 aa  129  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558326  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0661  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.83 
 
 
392 aa  129  7.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4890  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.7 
 
 
395 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625991  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4766  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.7 
 
 
395 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4942  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.43 
 
 
395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052087 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  26.75 
 
 
418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0576  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.32 
 
 
395 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15290  ATP phosphoribosyltransferase  32.72 
 
 
538 aa  127  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1078  ATP phosphoribosyltransferase  33.76 
 
 
554 aa  126  7e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00640346  hitchhiker  0.0000000000210065 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4938  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit, putative  33.16 
 
 
395 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  26.5 
 
 
418 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 
421 aa  125  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  25.76 
 
 
418 aa  124  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3158  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.6 
 
 
394 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  25.5 
 
 
418 aa  122  7e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  28.88 
 
 
417 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2662  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit, putative  30.37 
 
 
394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1281  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33 
 
 
393 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.679748  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2981  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.93 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0640  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.15 
 
 
395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226727 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  31.78 
 
 
421 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 
431 aa  116  6e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5668  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.65 
 
 
394 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863885  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2077  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.45 
 
 
383 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07590  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.97 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  30.84 
 
 
427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0902  histidyl-tRNA synthetase 2  31.44 
 
 
395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.188473  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65250  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.9 
 
 
394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  28.1 
 
 
410 aa  114  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1584  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  31.32 
 
 
387 aa  113  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.495225  unclonable  0.000000222283 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3533  histidyl-tRNA synthetase 2  33.02 
 
 
346 aa  113  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217945  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  30.51 
 
 
419 aa  112  8.000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1940  tRNA synthetase class II (G H P and S)  30.65 
 
 
394 aa  112  9e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2097  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.82 
 
 
383 aa  112  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0834258 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1979  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.16 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.495499  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1605  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.23 
 
 
383 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.344405  normal  0.350031 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  30.15 
 
 
409 aa  110  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2531  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.5 
 
 
383 aa  110  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.020462  hitchhiker  0.00000966794 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3900  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.91 
 
 
401 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0606  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.38 
 
 
321 aa  109  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1502  Histidine--tRNA ligase  31.42 
 
 
415 aa  109  9.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  31.28 
 
 
454 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3380  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.04 
 
 
385 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1180  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  31.5 
 
 
382 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.869352  normal  0.414984 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0985  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.86 
 
 
404 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0965259  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1100  histidyl-tRNA synthetase 2  31.5 
 
 
382 aa  107  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175534  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5010  tRNA synthetase class II (G H P and S)  31.27 
 
 
382 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2627  tRNA synthetase class II (G H P and S)  29.63 
 
 
392 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000799306 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1986  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.49 
 
 
387 aa  103  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0587615  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1264  histidyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 
349 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0508371  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2692  histidyl-tRNA synthetase 2  35.28 
 
 
349 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  27.43 
 
 
439 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2765  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  30.27 
 
 
393 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466804  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2599  Histidine--tRNA ligase  35.28 
 
 
349 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2197  histidyl-tRNA synthetase 2  31.55 
 
 
386 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5103  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.17 
 
 
382 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.480937  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  31.14 
 
 
457 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1096  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.35 
 
 
382 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.35877  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0072  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.35 
 
 
382 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1335  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.35 
 
 
382 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128033  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2345  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.35 
 
 
382 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1826  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.89 
 
 
382 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.551052 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1824  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.35 
 
 
382 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>