More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_750 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0846  histidyl-tRNA synthetase, putative  98.54 
 
 		 412 aa  838    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0765  histidine--tRNA ligase  93.45 
 
 		 412 aa  799    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_750  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 412 aa  844    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.878399  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  34.76 
 
 		 409 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  30.29 
 
 		 420 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  34.76 
 
 		 377 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  31 
 
 		 408 aa  144  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  30.1 
 
 		 418 aa  143  6e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  29.77 
 
 		 418 aa  140  6e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  29.58 
 
 		 418 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  31.13 
 
 		 410 aa  137  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  27.96 
 
 		 421 aa  138  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  30.24 
 
 		 409 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  28.42 
 
 		 418 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3307  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.23 
 
 		 438 aa  133  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0295  histidyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 		 430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000190773  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3887  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.84 
 
 		 420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0999  histidine--tRNA ligase  29.47 
 
 		 380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.357666  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  28.68 
 
 		 418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1524  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.4 
 
 		 420 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  28.61 
 
 		 470 aa  130  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0380  histidyl-tRNA synthetase 2  28.09 
 
 		 419 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0364  histidyl-tRNA synthetase  28.08 
 
 		 429 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00780967  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1326  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.21 
 
 		 420 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0393  histidyl-tRNA synthetase  27.8 
 
 		 429 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  29.26 
 
 		 430 aa  129  9.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1457  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.84 
 
 		 420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  27.25 
 
 		 419 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0749  histidyl-tRNA synthetase 2  30.03 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1501  histidyl-tRNA synthetase  27.2 
 
 		 426 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3259  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.75 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0331239  hitchhiker  0.000000000000235665 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1315  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.27 
 
 		 420 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1288  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.27 
 
 		 420 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1482  histidyl-tRNA synthetase  27.14 
 
 		 426 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 		 423 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1424  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.27 
 
 		 420 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1563  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.91 
 
 		 420 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  29.4 
 
 		 422 aa  127  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  29 
 
 		 417 aa  126  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1788  histidyl-tRNA synthetase  30.47 
 
 		 423 aa  127  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  26.53 
 
 		 419 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  28.84 
 
 		 410 aa  126  6e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1289  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.27 
 
 		 420 aa  126  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1495  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.27 
 
 		 420 aa  126  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  28.24 
 
 		 429 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  28.07 
 
 		 419 aa  125  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  27.96 
 
 		 421 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06881  histidyl-tRNA synthetase  28.81 
 
 		 429 aa  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  28.16 
 
 		 423 aa  123  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2037  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.36 
 
 		 389 aa  123  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  26.82 
 
 		 426 aa  123  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  29.91 
 
 		 418 aa  122  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  27.69 
 
 		 426 aa  122  8e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  28.87 
 
 		 429 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  28.87 
 
 		 429 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  27.82 
 
 		 429 aa  122  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0595  histidyl-tRNA synthetase  30.41 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1786  histidyl-tRNA synthetase  26.9 
 
 		 430 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736899 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2880  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.17 
 
 		 418 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.164097  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  27.89 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  28.61 
 
 		 423 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  28.61 
 
 		 423 aa  121  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  30.35 
 
 		 410 aa  121  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  28.69 
 
 		 415 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  27.56 
 
 		 419 aa  121  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  27.64 
 
 		 419 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 		 424 aa  120  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  28.61 
 
 		 423 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06791  histidyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 		 426 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  28.61 
 
 		 423 aa  120  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2105  histidyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 		 447 aa  119  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  26.3 
 
 		 424 aa  119  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  28.27 
 
 		 413 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  28.35 
 
 		 423 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  28.35 
 
 		 423 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  28.35 
 
 		 423 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  30.3 
 
 		 424 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  28.35 
 
 		 423 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  30.3 
 
 		 424 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  28.35 
 
 		 423 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2085  histidyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 456 aa  119  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253683  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  30.3 
 
 		 424 aa  119  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06491  histidyl-tRNA synthetase  28.19 
 
 		 426 aa  119  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 		 431 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1252  histidyl-tRNA synthetase  30.33 
 
 		 429 aa  119  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.723955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  27.42 
 
 		 421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  28.34 
 
 		 421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0623  histidyl-tRNA synthetase  28.61 
 
 		 426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 		 423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  27.43 
 
 		 423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0397  histidyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 		 434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00425435  normal  0.748396 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0519  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.69 
 
 		 445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227641  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  28.88 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1433  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  28.65 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.239376  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65250  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.22 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  27.6 
 
 		 418 aa  117  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  27.32 
 
 		 411 aa  117  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3389  histidyl-tRNA synthetase  30.72 
 
 		 431 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  28.4 
 
 		 421 aa  117  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1467  histidyl-tRNA synthetase  26.75 
 
 		 425 aa  117  5e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.162943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>