More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4746 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4746  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  100 
 
 
392 aa  758    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.934073 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1846  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  54.44 
 
 
385 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000726333 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2565  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  53.87 
 
 
390 aa  360  3e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.461378  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1681  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  53.66 
 
 
386 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4117  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  53.06 
 
 
385 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3187  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  51.46 
 
 
395 aa  344  1e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1341  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  53.89 
 
 
382 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.354944  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4717  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  54.95 
 
 
388 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.413844  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1775  tRNA synthetase class II (G H P and S)  48.24 
 
 
379 aa  310  2.9999999999999997e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349459  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0804  tRNA synthetase class II (G H P and S)  49.73 
 
 
371 aa  306  3e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0821563 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4934  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  46.07 
 
 
379 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4292  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  49.45 
 
 
380 aa  288  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  0.0362525 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2646  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  46.22 
 
 
378 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1499  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  47.53 
 
 
387 aa  278  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.355503  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1777  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  48.35 
 
 
387 aa  272  7e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253476  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1498  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  47.93 
 
 
387 aa  271  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.694394  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0599  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  43.27 
 
 
392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38894  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0188  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  42.74 
 
 
376 aa  248  1e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0170  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  42.74 
 
 
376 aa  248  1e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.135886  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3018  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  38.46 
 
 
376 aa  231  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.559203  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0420  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  40.17 
 
 
373 aa  215  9e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.019387  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5795  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  39.28 
 
 
372 aa  206  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831254  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0510  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.12 
 
 
373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0121409 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0404  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  37.12 
 
 
377 aa  197  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133547  normal  0.0561317 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0465  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.77 
 
 
373 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238845  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4680  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  38.29 
 
 
380 aa  157  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.843824 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0577  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.01 
 
 
517 aa  147  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0504  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.34 
 
 
363 aa  133  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.483735  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1924  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.15 
 
 
360 aa  129  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0724806 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3187  histidyl-tRNA synthetase  32.05 
 
 
484 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2187  histidyl-tRNA synthetase 2  33.5 
 
 
479 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2915  histidyl-tRNA synthetase  32.11 
 
 
484 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3550  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.84 
 
 
365 aa  120  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.370469  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3835  histidine--tRNA ligase  30.45 
 
 
466 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000618349  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3952  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.52 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0242262 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0946  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.58 
 
 
369 aa  104  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2954  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.6 
 
 
368 aa  100  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.826684  normal  0.0199101 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  24.8 
 
 
418 aa  94.4  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0236  histidyl-tRNA synthetase  24.87 
 
 
427 aa  92.4  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  26.08 
 
 
448 aa  91.3  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  25.46 
 
 
418 aa  91.3  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  25.6 
 
 
421 aa  90.1  7e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  25.2 
 
 
418 aa  89  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2880  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.81 
 
 
418 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.164097  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0999  histidine--tRNA ligase  25.53 
 
 
380 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.357666  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  24.67 
 
 
418 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  24.06 
 
 
417 aa  86.3  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  23.87 
 
 
418 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0380  histidyl-tRNA synthetase 2  34.9 
 
 
419 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  25.41 
 
 
430 aa  82.8  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  29.01 
 
 
431 aa  82.4  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  25.91 
 
 
439 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  29.27 
 
 
421 aa  81.6  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0519  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.89 
 
 
445 aa  80.5  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227641  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  31.29 
 
 
426 aa  80.1  0.00000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2359  histidine--tRNA ligase  27.52 
 
 
401 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2219  histidyl-tRNA synthetase  26.29 
 
 
442 aa  77.8  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.911192  normal  0.722289 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0661  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.14 
 
 
438 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0588271  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1522  histidyl-tRNA synthetase  26.93 
 
 
432 aa  78.2  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  26.4 
 
 
423 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3551  histidyl-tRNA synthetase  28.11 
 
 
494 aa  77  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340591  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  23.24 
 
 
456 aa  75.5  0.000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  32.19 
 
 
427 aa  75.9  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  26.09 
 
 
444 aa  75.5  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0985  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.53 
 
 
404 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0965259  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0566  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.37 
 
 
440 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1336e-23 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 
470 aa  75.1  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0476  tRNA synthetase class II (G H P and S)  36.53 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108226 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  25.21 
 
 
416 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  26.06 
 
 
409 aa  73.6  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3951  histidyl-tRNA synthetase  27.19 
 
 
494 aa  73.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0501682 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  29.37 
 
 
439 aa  73.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  29.85 
 
 
419 aa  73.2  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  20.31 
 
 
442 aa  72.8  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3887  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.4 
 
 
420 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2855  histidyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 
428 aa  72.4  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983012  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1326  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.4 
 
 
420 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15290  ATP phosphoribosyltransferase  27.25 
 
 
538 aa  71.6  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0553  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.1 
 
 
440 aa  72  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264933  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  29.11 
 
 
418 aa  72  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1457  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.4 
 
 
420 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0765  histidine--tRNA ligase  26.09 
 
 
412 aa  70.9  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1288  histidyl-tRNA synthetase  25.61 
 
 
402 aa  71.2  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.373559  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0577  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.91 
 
 
401 aa  70.9  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000998206 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0599  histidyl-tRNA synthetase  29.94 
 
 
492 aa  70.9  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0139702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0598  histidyl-tRNA synthetase  26.52 
 
 
506 aa  70.5  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.569659 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  27.07 
 
 
424 aa  70.1  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1776  histidyl-tRNA synthetase  26.89 
 
 
500 aa  70.1  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.375411  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  31.25 
 
 
420 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3389  histidyl-tRNA synthetase  25.85 
 
 
431 aa  69.7  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0595  histidyl-tRNA synthetase  26.8 
 
 
419 aa  69.7  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3259  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.29 
 
 
434 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0331239  hitchhiker  0.000000000000235665 
 
 
-
 
NC_002936  DET0846  histidyl-tRNA synthetase, putative  25.8 
 
 
412 aa  69.3  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3307  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.57 
 
 
438 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1495  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28 
 
 
420 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  26.63 
 
 
424 aa  69.3  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0661  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.6 
 
 
392 aa  68.2  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1555  histidyl-tRNA synthetase  27.18 
 
 
503 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.84291 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  28.67 
 
 
421 aa  68.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>