More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4292 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4292  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  100 
 
 
380 aa  734    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  0.0362525 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1499  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  76.72 
 
 
387 aa  533  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.355503  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1777  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  76.32 
 
 
387 aa  518  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253476  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1498  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  76.32 
 
 
387 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.694394  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4934  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  70.41 
 
 
379 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2646  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  69.78 
 
 
378 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1775  tRNA synthetase class II (G H P and S)  47.63 
 
 
379 aa  305  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349459  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0804  tRNA synthetase class II (G H P and S)  48.32 
 
 
371 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0821563 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4746  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  49.72 
 
 
392 aa  294  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.934073 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4117  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  43.81 
 
 
385 aa  285  8e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1846  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  43.9 
 
 
385 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000726333 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2565  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  44.84 
 
 
390 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.461378  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1681  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  46.03 
 
 
386 aa  279  7e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3187  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  45.98 
 
 
395 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1341  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  46.01 
 
 
382 aa  266  7e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.354944  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4717  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  46.13 
 
 
388 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.413844  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0599  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  41.32 
 
 
392 aa  212  7e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38894  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0188  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  38.19 
 
 
376 aa  207  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0170  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  38.19 
 
 
376 aa  207  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.135886  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3018  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  37.39 
 
 
376 aa  203  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.559203  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0420  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  40.57 
 
 
373 aa  202  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.019387  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0465  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.07 
 
 
373 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238845  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0510  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.07 
 
 
373 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0121409 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0404  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  37.43 
 
 
377 aa  182  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133547  normal  0.0561317 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5795  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.84 
 
 
372 aa  179  7e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831254  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4680  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  37.22 
 
 
380 aa  142  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.843824 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0504  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.02 
 
 
363 aa  130  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.483735  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0577  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.84 
 
 
517 aa  129  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3835  histidine--tRNA ligase  33.07 
 
 
466 aa  129  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000618349  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3550  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.14 
 
 
365 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.370469  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2915  histidyl-tRNA synthetase  33.15 
 
 
484 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2187  histidyl-tRNA synthetase 2  33.69 
 
 
479 aa  122  9e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3952  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.43 
 
 
360 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0242262 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3187  histidyl-tRNA synthetase  30.63 
 
 
484 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2954  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.63 
 
 
368 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.826684  normal  0.0199101 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0946  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.94 
 
 
369 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1924  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.51 
 
 
360 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0724806 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  24.59 
 
 
418 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  26.3 
 
 
430 aa  81.6  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  28.53 
 
 
457 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 
439 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2246  histidyl-tRNA synthetase  27.58 
 
 
434 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000301109  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 
410 aa  76.6  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  35.33 
 
 
421 aa  76.3  0.0000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  27.25 
 
 
454 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  29.31 
 
 
418 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1422  histidyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 
466 aa  75.5  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0999  histidine--tRNA ligase  25 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.357666  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  24.8 
 
 
418 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1355  histidyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 
466 aa  74.7  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  27.01 
 
 
470 aa  73.6  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  32.6 
 
 
417 aa  73.2  0.000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  33.16 
 
 
409 aa  73.2  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1489  Histidine--tRNA ligase  34.16 
 
 
383 aa  72.8  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00266166  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  24.27 
 
 
448 aa  71.6  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  24.23 
 
 
439 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  32.75 
 
 
408 aa  72  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2219  histidyl-tRNA synthetase  27.61 
 
 
442 aa  71.6  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.911192  normal  0.722289 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  33.78 
 
 
419 aa  71.2  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  31.91 
 
 
418 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  31.1 
 
 
427 aa  70.1  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  33.89 
 
 
410 aa  69.7  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  30.26 
 
 
431 aa  68.2  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
421 aa  68.6  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  29.33 
 
 
418 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  24.76 
 
 
426 aa  67.4  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  33.58 
 
 
419 aa  67  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00827  histidyl-tRNA synthetase  26.23 
 
 
470 aa  66.6  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00186389  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  28.67 
 
 
418 aa  66.2  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0923  Histidine--tRNA ligase  28.91 
 
 
370 aa  66.2  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00438339  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  32.72 
 
 
410 aa  65.5  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 
417 aa  64.7  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  33.58 
 
 
426 aa  64.3  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  31.88 
 
 
420 aa  63.5  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0236  histidyl-tRNA synthetase  23.5 
 
 
427 aa  63.5  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 
420 aa  62.8  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3163  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  35.9 
 
 
382 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0902374  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0566  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.12 
 
 
440 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1336e-23 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 
423 aa  62.4  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15290  ATP phosphoribosyltransferase  28.89 
 
 
538 aa  62.4  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0749  histidyl-tRNA synthetase 2  30.95 
 
 
389 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2880  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.52 
 
 
418 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.164097  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1753  histidyl-tRNA synthetase  25.26 
 
 
465 aa  60.8  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.058114 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0553  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.12 
 
 
440 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264933  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 
435 aa  61.2  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  33.11 
 
 
409 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 
423 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2834  histidyl-tRNA synthetase 2  33.33 
 
 
368 aa  60.1  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 
423 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 
423 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 
423 aa  60.1  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 
423 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 
423 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 
423 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 
423 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 
423 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2598  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  34.65 
 
 
392 aa  59.7  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.983634  normal  0.632855 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 
423 aa  59.7  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2655  histidyl-tRNA synthetase  30 
 
 
437 aa  59.7  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234034  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 
423 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>