294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0510 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0510  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  100 
 
 
373 aa  740    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0121409 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0465  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  92.74 
 
 
373 aa  677    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238845  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0404  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  68.38 
 
 
377 aa  498  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133547  normal  0.0561317 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5795  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  71.97 
 
 
372 aa  494  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831254  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0420  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  57.14 
 
 
373 aa  402  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.019387  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3018  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  53.76 
 
 
376 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.559203  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0188  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  52.92 
 
 
376 aa  362  6e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0170  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  52.92 
 
 
376 aa  362  8e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.135886  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2646  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  39.34 
 
 
378 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4934  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  39.47 
 
 
379 aa  216  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1341  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.99 
 
 
382 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.354944  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4117  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.11 
 
 
385 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1846  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.28 
 
 
385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000726333 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1681  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.93 
 
 
386 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0599  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.52 
 
 
392 aa  190  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38894  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4746  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.22 
 
 
392 aa  188  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.934073 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3187  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.06 
 
 
395 aa  188  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1499  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  37.5 
 
 
387 aa  187  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.355503  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2565  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.05 
 
 
390 aa  186  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.461378  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4717  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.91 
 
 
388 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.413844  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4292  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.52 
 
 
380 aa  182  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  0.0362525 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1775  tRNA synthetase class II (G H P and S)  33.87 
 
 
379 aa  180  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349459  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1777  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.91 
 
 
387 aa  179  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253476  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1498  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.39 
 
 
387 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.694394  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0804  tRNA synthetase class II (G H P and S)  34.08 
 
 
371 aa  164  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0821563 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0946  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.61 
 
 
369 aa  119  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0504  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.62 
 
 
363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.483735  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4680  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.51 
 
 
380 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.843824 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1924  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.07 
 
 
360 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0724806 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3550  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.82 
 
 
365 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.370469  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3952  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.6 
 
 
360 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0242262 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3835  histidine--tRNA ligase  32.9 
 
 
466 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000618349  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  27.3 
 
 
418 aa  92.4  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3187  histidyl-tRNA synthetase  29.78 
 
 
484 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2915  histidyl-tRNA synthetase  31.64 
 
 
484 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2187  histidyl-tRNA synthetase 2  29 
 
 
479 aa  86.3  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2954  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.81 
 
 
368 aa  84.3  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.826684  normal  0.0199101 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  27.15 
 
 
418 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  26.92 
 
 
418 aa  79.7  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  25.07 
 
 
426 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0577  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.52 
 
 
517 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  25.29 
 
 
430 aa  73.2  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  26.21 
 
 
427 aa  70.5  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  23.68 
 
 
420 aa  69.7  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  24.12 
 
 
377 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  25.41 
 
 
418 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  25.5 
 
 
419 aa  66.6  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  24.44 
 
 
418 aa  65.9  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  25.93 
 
 
410 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  26.63 
 
 
408 aa  65.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  26.5 
 
 
409 aa  63.9  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  22.93 
 
 
456 aa  63.2  0.000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  25.41 
 
 
419 aa  62  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0894  histidyl-tRNA synthetase  24.23 
 
 
409 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0307852  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5012  histidyl-tRNA synthetase  26.85 
 
 
423 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0324448 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  22.63 
 
 
421 aa  60.8  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0923  Histidine--tRNA ligase  29.32 
 
 
370 aa  60.5  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00438339  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3158  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.26 
 
 
394 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_750  histidyl-tRNA synthetase  30 
 
 
412 aa  60.1  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.878399  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0846  histidyl-tRNA synthetase, putative  29.52 
 
 
412 aa  59.7  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3887  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.32 
 
 
420 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  29.01 
 
 
430 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0765  histidine--tRNA ligase  28.88 
 
 
412 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16944  predicted protein  23.24 
 
 
438 aa  59.3  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.994947  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2002  Histidine--tRNA ligase  23.76 
 
 
409 aa  58.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5018  histidyl-tRNA synthetase  26.7 
 
 
431 aa  57.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303821  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  25.07 
 
 
470 aa  57.8  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1272  histidyl-tRNA synthetase  24.51 
 
 
408 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0694221  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1524  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.08 
 
 
420 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0749  histidyl-tRNA synthetase 2  27.44 
 
 
389 aa  57  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1457  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.52 
 
 
420 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0813  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.52 
 
 
420 aa  56.6  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.493486  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1563  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.99 
 
 
420 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  25.94 
 
 
439 aa  56.2  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1489  Histidine--tRNA ligase  30.86 
 
 
383 aa  56.2  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00266166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1495  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  21.96 
 
 
420 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1289  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  21.96 
 
 
420 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  29.61 
 
 
418 aa  55.5  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1171  histidyl-tRNA synthetase  26.34 
 
 
429 aa  55.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3307  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.43 
 
 
438 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1288  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  21.96 
 
 
420 aa  55.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1326  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.06 
 
 
420 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1786  histidyl-tRNA synthetase  32.28 
 
 
430 aa  54.7  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736899 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
439 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2855  histidyl-tRNA synthetase  25.93 
 
 
428 aa  54.7  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983012  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1315  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  21.96 
 
 
420 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1424  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  21.96 
 
 
420 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1091  histidyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 
429 aa  54.3  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1100  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.22 
 
 
413 aa  53.9  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 
419 aa  54.3  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1995  histidyl-tRNA synthetase  27.25 
 
 
443 aa  53.1  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0995167 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  24.4 
 
 
429 aa  53.1  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0380  histidyl-tRNA synthetase 2  31.97 
 
 
419 aa  52.8  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  34.31 
 
 
418 aa  52.8  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  31.14 
 
 
410 aa  52.8  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23400  histidyl-tRNA synthetase  26.22 
 
 
432 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.879527  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
423 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  22.64 
 
 
444 aa  52.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  31.58 
 
 
421 aa  52.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88696  predicted protein  47.37 
 
 
525 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>