298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0465 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0465  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  100 
 
 
373 aa  743    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238845  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0510  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  92.74 
 
 
373 aa  697    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0121409 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0404  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  68.38 
 
 
377 aa  498  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133547  normal  0.0561317 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5795  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  72.51 
 
 
372 aa  494  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831254  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0420  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  58.24 
 
 
373 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.019387  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3018  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  53.2 
 
 
376 aa  368  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.559203  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0188  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  52.94 
 
 
376 aa  363  4e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0170  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  52.94 
 
 
376 aa  362  7.0000000000000005e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.135886  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2646  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  38.8 
 
 
378 aa  219  6e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4934  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  39.73 
 
 
379 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1341  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.99 
 
 
382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.354944  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1681  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.49 
 
 
386 aa  199  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4117  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.11 
 
 
385 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1846  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.28 
 
 
385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000726333 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0599  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.52 
 
 
392 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38894  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3187  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.33 
 
 
395 aa  186  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1775  tRNA synthetase class II (G H P and S)  35.03 
 
 
379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349459  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2565  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.14 
 
 
390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.461378  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4292  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.52 
 
 
380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  0.0362525 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4746  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.87 
 
 
392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.934073 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1499  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.59 
 
 
387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.355503  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4717  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.36 
 
 
388 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.413844  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1777  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.33 
 
 
387 aa  176  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253476  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1498  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.77 
 
 
387 aa  176  9e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.694394  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0804  tRNA synthetase class II (G H P and S)  34.36 
 
 
371 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0821563 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0946  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.81 
 
 
369 aa  116  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4680  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.97 
 
 
380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.843824 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0504  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.73 
 
 
363 aa  109  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.483735  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1924  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.45 
 
 
360 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0724806 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3550  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.92 
 
 
365 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.370469  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3835  histidine--tRNA ligase  32 
 
 
466 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000618349  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3952  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.53 
 
 
360 aa  97.1  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0242262 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3187  histidyl-tRNA synthetase  30.79 
 
 
484 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2915  histidyl-tRNA synthetase  30.75 
 
 
484 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2954  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.54 
 
 
368 aa  92  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.826684  normal  0.0199101 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2187  histidyl-tRNA synthetase 2  28.8 
 
 
479 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  27.02 
 
 
418 aa  87.8  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  25.94 
 
 
426 aa  83.2  0.000000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0577  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.19 
 
 
517 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  26.44 
 
 
430 aa  75.5  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  24.86 
 
 
421 aa  73.6  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  25.57 
 
 
427 aa  72  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  24.66 
 
 
377 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  25.27 
 
 
419 aa  70.1  0.00000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 
409 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  25.63 
 
 
418 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  23.89 
 
 
420 aa  67  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  25.63 
 
 
418 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0765  histidine--tRNA ligase  29.5 
 
 
412 aa  64.7  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  25.36 
 
 
408 aa  64.3  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  23.97 
 
 
419 aa  62  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_750  histidyl-tRNA synthetase  30.63 
 
 
412 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.878399  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0923  Histidine--tRNA ligase  46.25 
 
 
370 aa  61.6  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00438339  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0846  histidyl-tRNA synthetase, putative  30.16 
 
 
412 aa  61.2  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1489  Histidine--tRNA ligase  31.48 
 
 
383 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00266166  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3158  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.5 
 
 
394 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23400  histidyl-tRNA synthetase  27.12 
 
 
432 aa  60.8  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.879527  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70094  histidine tRNA synthetase  22.11 
 
 
536 aa  60.8  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.768048  normal  0.208592 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  23.18 
 
 
426 aa  59.7  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16944  predicted protein  23.78 
 
 
438 aa  59.7  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.994947  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1502  Histidine--tRNA ligase  20.75 
 
 
415 aa  59.3  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  26.15 
 
 
439 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  24.23 
 
 
456 aa  58.5  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  29.61 
 
 
418 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  24.5 
 
 
410 aa  57.8  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  26.15 
 
 
429 aa  57.8  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 
418 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5018  histidyl-tRNA synthetase  25.82 
 
 
431 aa  56.6  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303821  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0749  histidyl-tRNA synthetase 2  31.68 
 
 
389 aa  56.2  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2984  histidyl-tRNA synthetase  23.73 
 
 
429 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1786  histidyl-tRNA synthetase  32.28 
 
 
430 aa  55.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736899 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  30.63 
 
 
423 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1326  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24 
 
 
420 aa  53.9  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2655  histidyl-tRNA synthetase  25.5 
 
 
437 aa  54.3  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234034  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5052  histidyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
475 aa  54.3  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.504123  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0380  histidyl-tRNA synthetase 2  24.73 
 
 
419 aa  53.9  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0813  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.8 
 
 
420 aa  53.5  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.493486  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  30.91 
 
 
420 aa  53.9  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1171  histidyl-tRNA synthetase  26.42 
 
 
429 aa  53.5  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2981  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.2 
 
 
392 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3887  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.06 
 
 
420 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 
418 aa  53.1  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  23.95 
 
 
470 aa  53.1  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  35.25 
 
 
419 aa  52.8  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  28.87 
 
 
421 aa  52.8  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 
439 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  31.58 
 
 
421 aa  52.4  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1995  histidyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 
443 aa  52.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0995167 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
423 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1289  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  21.69 
 
 
420 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  28.92 
 
 
417 aa  51.6  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06881  histidyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 
429 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 
421 aa  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  21.88 
 
 
444 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1288  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  21.69 
 
 
420 aa  51.2  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88696  predicted protein  45.61 
 
 
525 aa  51.2  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  24.86 
 
 
457 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
429 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1091  histidyl-tRNA synthetase  26.42 
 
 
429 aa  51.2  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1363  histidyl-tRNA synthetase  23.73 
 
 
428 aa  51.2  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000622801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>