252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1775 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1775  tRNA synthetase class II (G H P and S)  100 
 
 		 379 aa  751    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0804  tRNA synthetase class II (G H P and S)  66.2 
 
 		 371 aa  442  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0821563 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4117  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  53.26 
 
 		 385 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2565  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  53.42 
 
 		 390 aa  340  4e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.461378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3187  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  54.3 
 
 		 395 aa  340  4e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1846  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  53.69 
 
 		 385 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000726333 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1341  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  53.87 
 
 		 382 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.354944  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1681  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  53.12 
 
 		 386 aa  325  9e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4717  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  52.78 
 
 		 388 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.413844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4934  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  50.42 
 
 		 379 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4746  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  48.35 
 
 		 392 aa  291  9e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.934073 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2646  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  48.89 
 
 		 378 aa  290  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1499  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  46.28 
 
 		 387 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.355503  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4292  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  47.35 
 
 		 380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  0.0362525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1498  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  47.41 
 
 		 387 aa  278  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.694394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1777  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  47.14 
 
 		 387 aa  276  4e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253476  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0599  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  40.93 
 
 		 392 aa  226  6e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38894  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0170  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  37.23 
 
 		 376 aa  199  5e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.135886  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0188  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  37.23 
 
 		 376 aa  199  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3018  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.39 
 
 		 376 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.559203  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0420  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  38.11 
 
 		 373 aa  188  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.019387  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0404  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.96 
 
 		 377 aa  182  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133547  normal  0.0561317 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0465  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.03 
 
 		 373 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5795  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.95 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831254  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0510  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.87 
 
 		 373 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0121409 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4680  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.77 
 
 		 380 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.843824 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3952  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.81 
 
 		 360 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0242262 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0504  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.36 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.483735  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0577  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.23 
 
 		 517 aa  120  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3550  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.33 
 
 		 365 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.370469  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2915  histidyl-tRNA synthetase  33.79 
 
 		 484 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2954  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.79 
 
 		 368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.826684  normal  0.0199101 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2187  histidyl-tRNA synthetase 2  32.07 
 
 		 479 aa  109  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3187  histidyl-tRNA synthetase  32.07 
 
 		 484 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1924  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.17 
 
 		 360 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0724806 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0946  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.95 
 
 		 369 aa  98.2  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3835  histidine--tRNA ligase  28.61 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000618349  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  24.77 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  28.34 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  25.23 
 
 		 418 aa  76.6  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  26.54 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  23.71 
 
 		 418 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  28.08 
 
 		 427 aa  73.2  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  24.93 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  23.71 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  26.63 
 
 		 448 aa  68.9  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  26.27 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  25.34 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0846  histidyl-tRNA synthetase, putative  25.83 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  28.45 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1288  histidyl-tRNA synthetase  26.61 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.373559  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  27.05 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  26.8 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  26.2 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_750  histidyl-tRNA synthetase  25.28 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.878399  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88696  predicted protein  25.8 
 
 		 525 aa  64.3  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0765  histidine--tRNA ligase  27.22 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0236  histidyl-tRNA synthetase  23.78 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  26.74 
 
 		 410 aa  62.8  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  26.19 
 
 		 470 aa  62.8  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3489  histidyl-tRNA synthetase  27.79 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  23.53 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  24.32 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0749  histidyl-tRNA synthetase 2  26.37 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1522  histidyl-tRNA synthetase  27.08 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0894  histidyl-tRNA synthetase  32.91 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0307852  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  30.42 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0999  histidine--tRNA ligase  23.16 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.357666  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  26.33 
 
 		 503 aa  58.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2219  histidyl-tRNA synthetase  26.16 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.911192  normal  0.722289 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  25.69 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2002  Histidine--tRNA ligase  21.83 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15290  ATP phosphoribosyltransferase  28.02 
 
 		 538 aa  58.2  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  25.07 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  32.37 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  31.09 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2655  histidyl-tRNA synthetase  26.7 
 
 		 437 aa  57  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2880  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.37 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.164097  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1786  histidyl-tRNA synthetase  39.77 
 
 		 430 aa  56.2  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736899 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1206  ATP phosphoribosyltransferase  23.56 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  28.71 
 
 		 436 aa  55.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0925  histidyl-tRNA synthetase  32.69 
 
 		 410 aa  55.5  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  32.84 
 
 		 421 aa  55.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 456 aa  55.1  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  26.4 
 
 		 421 aa  53.9  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  25.68 
 
 		 423 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29417  predicted protein  26.53 
 
 		 405 aa  54.3  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.024328  hitchhiker  0.00343587 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  36.8 
 
 		 457 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 		 420 aa  53.9  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 419 aa  53.5  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  31.93 
 
 		 423 aa  53.1  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2673  histidyl-tRNA synthetase  32.17 
 
 		 453 aa  53.1  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  27.25 
 
 		 410 aa  53.1  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  25.38 
 
 		 419 aa  52.8  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  31.93 
 
 		 423 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  31.93 
 
 		 423 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1489  Histidine--tRNA ligase  30.16 
 
 		 383 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00266166  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  31.93 
 
 		 423 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  24.23 
 
 		 421 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>