127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_50780 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_50780  hypothetical protein  100 
 
 
441 aa  864    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357651  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34100  hypothetical protein  65.32 
 
 
443 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000774446  normal  0.0569236 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2899  hypothetical protein  64.97 
 
 
430 aa  524  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0914506  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3404  hypothetical protein  62.61 
 
 
443 aa  514  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1717  hypothetical protein  30.32 
 
 
442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.324367  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5994  type VI secretion protein  29.77 
 
 
444 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00940  hypothetical protein  28.2 
 
 
444 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112579  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0150  hypothetical protein  29.15 
 
 
444 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112018  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1524  hypothetical protein  24.48 
 
 
445 aa  87  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2318  hypothetical protein  26.54 
 
 
444 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0487552  hitchhiker  0.00103904 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2809  hypothetical protein  25.16 
 
 
442 aa  74.3  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0554193  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1608  hypothetical protein  27.25 
 
 
480 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25923  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0161  hypothetical protein  27.25 
 
 
449 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01968  hypothetical protein  26.37 
 
 
448 aa  72  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0138  hypothetical protein  27.25 
 
 
452 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4960  hypothetical protein  31.84 
 
 
447 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286001  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0125  hypothetical protein  27.01 
 
 
480 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3844  type VI secretion protein  26.59 
 
 
444 aa  70.9  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110826  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1203  hypothetical protein  24.2 
 
 
444 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.816844  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000430  uncharacterized protein ImpJ/VasE  22.14 
 
 
441 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.959162  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2522  type VI secretion protein  22.28 
 
 
444 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.711445  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1675  type VI secretion protein, VC_A0114 family  24.76 
 
 
447 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88528  hitchhiker  0.0077822 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2503  type VI secretion protein  31.08 
 
 
447 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2771  type VI secretion protein  29.73 
 
 
447 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171251  normal  0.625099 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2967  hypothetical protein  26.42 
 
 
448 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2090  hypothetical protein  24.56 
 
 
443 aa  66.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612247  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2629  hypothetical protein  30.18 
 
 
447 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253477  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3093  hypothetical protein  30.18 
 
 
447 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.131309  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3639  hypothetical protein  25.95 
 
 
468 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507255  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1371  hypothetical protein  25.06 
 
 
449 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05852  hypothetical protein  21.63 
 
 
441 aa  64.7  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2875  hypothetical protein  25.06 
 
 
449 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1483  type VI secretion protein  25.06 
 
 
449 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4910  type VI secretion protein, VC_A0114 family  25.51 
 
 
448 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000188253  hitchhiker  0.00743846 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3556  hypothetical protein  26.45 
 
 
448 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0420358  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3024  type VI secretion protein  25.78 
 
 
449 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3648  hypothetical protein  25.95 
 
 
448 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119564  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3664  hypothetical protein  25.95 
 
 
448 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2933  type VI secretion protein  29.07 
 
 
448 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159534  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6677  type VI secretion protein  25.62 
 
 
449 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1077  type VI secretion protein, VC_A0114 family  28.4 
 
 
445 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.414986  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2642  hypothetical protein  28.89 
 
 
448 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0378  hypothetical protein  28.89 
 
 
448 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.493285  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0464  hypothetical protein  28.89 
 
 
448 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0442  type VI secretion protein  28.89 
 
 
448 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236466  normal  0.429573 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5264  hypothetical protein  28.52 
 
 
448 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0399  type VI secretion protein  28.89 
 
 
448 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66694  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02042  hypothetical protein  25.42 
 
 
433 aa  60.8  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6043  hypothetical protein  36 
 
 
446 aa  60.1  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0936  type VI secretion protein, VC_A0114 family  25.13 
 
 
447 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3248  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.39 
 
 
445 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2264  hypothetical protein  25.07 
 
 
448 aa  58.9  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0231  hypothetical protein  21.27 
 
 
443 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0233  hypothetical protein  21.23 
 
 
443 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3033  hypothetical protein  36.36 
 
 
443 aa  58.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0153643  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3423  hypothetical protein  30.39 
 
 
451 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3552  type VI secretion protein  30.39 
 
 
451 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0196523  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000014  uncharacterized protein ImpJ/VasE  24.33 
 
 
429 aa  57  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1471  hypothetical protein  27.95 
 
 
444 aa  57  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0560986  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0239  hypothetical protein  24.21 
 
 
443 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.892408 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6110  type VI secretion protein  24.94 
 
 
448 aa  57  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3726  hypothetical protein  24.88 
 
 
444 aa  56.2  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.529361  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0102  hypothetical protein  25.7 
 
 
443 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0024  hypothetical protein  30.97 
 
 
301 aa  55.8  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.668164  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2451  hypothetical protein  42.31 
 
 
444 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187575  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0514  type VI secretion protein, VC_A0114 family  24.62 
 
 
443 aa  55.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26730  hypothetical protein  32.64 
 
 
455 aa  54.7  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2800  type VI secretion protein, VC_A0114 family  28.18 
 
 
445 aa  54.3  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4055  type VI secretion protein  26.47 
 
 
445 aa  53.9  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000569036 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0728  hypothetical protein  25.48 
 
 
450 aa  53.5  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3311  hypothetical protein  39.39 
 
 
463 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0015  hypothetical protein  22.27 
 
 
454 aa  52.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.947734  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3648  type VI secretion protein  25.22 
 
 
449 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0429  hypothetical protein  37.88 
 
 
463 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1594  hypothetical protein  35.48 
 
 
472 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0252  hypothetical protein  33.71 
 
 
468 aa  50.8  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2842  hypothetical protein  33.71 
 
 
467 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0397  hypothetical protein  33.71 
 
 
467 aa  50.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0991372  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1591  hypothetical protein  33.71 
 
 
467 aa  50.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1776  hypothetical protein  33.71 
 
 
467 aa  50.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364892  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1181  putative type VI secretion protein VasE-1  25 
 
 
438 aa  50.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100124  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2967  hypothetical protein  33.71 
 
 
467 aa  50.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0446  hypothetical protein  33.71 
 
 
467 aa  50.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1115  putative type VI secretion protein VasE  22.22 
 
 
440 aa  50.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1207  ImpJ  34.12 
 
 
454 aa  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.740729  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2375  hypothetical protein  23.22 
 
 
442 aa  49.7  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0319  type VI secretion protein, family  33.33 
 
 
447 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0302  hypothetical protein  33.33 
 
 
447 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.392469  normal  0.385972 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0052  hypothetical protein  24.75 
 
 
445 aa  49.7  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.808473  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0313  type VI secretion protein, family  33.33 
 
 
447 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.471816 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00252  ImpJ  30.69 
 
 
445 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0307  type VI secretion protein  33.33 
 
 
447 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300554  normal  0.0525484 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5420  hypothetical protein  22.18 
 
 
443 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957862  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2914  hypothetical protein  31.07 
 
 
449 aa  48.9  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.34801 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0174  hypothetical protein  25.57 
 
 
450 aa  48.5  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000717375 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0800  type VI secretion protein  25.57 
 
 
450 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2089  putative temperature-dependent protein secretion, ImpJ  27.39 
 
 
448 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2466  type VI secretion protein, VC_A0114 family  36.47 
 
 
446 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0211  type VI secretion protein, VC_A0114 family  33.33 
 
 
458 aa  48.5  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2509  hypothetical protein  25.57 
 
 
450 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>