123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5994 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5994  type VI secretion protein  100 
 
 		 444 aa  881    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1717  hypothetical protein  73.58 
 
 		 442 aa  627  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.324367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34100  hypothetical protein  30.39 
 
 		 443 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000774446  normal  0.0569236 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2899  hypothetical protein  30.25 
 
 		 430 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0914506  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3404  hypothetical protein  28.44 
 
 		 443 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50780  hypothetical protein  29.77 
 
 		 441 aa  125  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357651  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2318  hypothetical protein  29.39 
 
 		 444 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0487552  hitchhiker  0.00103904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0150  hypothetical protein  29.36 
 
 		 444 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112018  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00940  hypothetical protein  28.74 
 
 		 444 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0239  hypothetical protein  26.01 
 
 		 443 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.892408 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0231  hypothetical protein  25.7 
 
 		 443 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2375  hypothetical protein  27.02 
 
 		 442 aa  84  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0233  hypothetical protein  25.7 
 
 		 443 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3726  hypothetical protein  27.11 
 
 		 444 aa  80.5  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.529361  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3033  hypothetical protein  28.93 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0153643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2090  hypothetical protein  25.99 
 
 		 443 aa  78.6  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612247  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1471  hypothetical protein  29.59 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0560986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0211  type VI secretion protein, VC_A0114 family  28.7 
 
 		 458 aa  76.6  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2809  hypothetical protein  23.78 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0554193  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1104  hypothetical protein  26.69 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1223  hypothetical protein  26.69 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.629455 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1524  hypothetical protein  24.02 
 
 		 445 aa  73.6  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4960  hypothetical protein  27.01 
 
 		 447 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5579  hypothetical protein  24.24 
 
 		 443 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3639  hypothetical protein  26.52 
 
 		 468 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507255  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3648  hypothetical protein  26.48 
 
 		 448 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119564  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2264  hypothetical protein  24.94 
 
 		 448 aa  71.2  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3664  hypothetical protein  26.48 
 
 		 448 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2967  hypothetical protein  26.3 
 
 		 448 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4910  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.61 
 
 		 448 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000188253  hitchhiker  0.00743846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3046  type VI secretion protein, VC_A0114 family  25.38 
 
 		 445 aa  70.1  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00998983  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6043  hypothetical protein  26.25 
 
 		 446 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1608  hypothetical protein  26.83 
 
 		 480 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25923  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0161  hypothetical protein  26.83 
 
 		 449 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3844  type VI secretion protein  25.9 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110826  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2933  type VI secretion protein  26.25 
 
 		 448 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0138  hypothetical protein  26.83 
 
 		 452 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0378  hypothetical protein  25.96 
 
 		 448 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.493285  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26730  hypothetical protein  28.96 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2771  type VI secretion protein  26.23 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171251  normal  0.625099 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0399  type VI secretion protein  25.96 
 
 		 448 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2522  type VI secretion protein  22.98 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.711445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3556  hypothetical protein  25.96 
 
 		 448 aa  67  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0420358  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2642  hypothetical protein  25.96 
 
 		 448 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0464  hypothetical protein  25.96 
 
 		 448 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3231  type VI secretion protein  25.38 
 
 		 445 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0442  type VI secretion protein  25.96 
 
 		 448 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236466  normal  0.429573 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2503  type VI secretion protein  26.71 
 
 		 447 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2617  hypothetical protein  25.68 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500578  normal  0.0201893 
 
 
-
 
NC_003296  RS01968  hypothetical protein  25.38 
 
 		 448 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0125  hypothetical protein  26.52 
 
 		 480 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2466  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.44 
 
 		 446 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0320  hypothetical protein  24.46 
 
 		 448 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0393  type VI secretion protein  24.46 
 
 		 448 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3093  hypothetical protein  26.23 
 
 		 447 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.131309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02042  hypothetical protein  23.95 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2629  hypothetical protein  25.76 
 
 		 447 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0052  hypothetical protein  24.62 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.808473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2120  hypothetical protein  25.38 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5420  hypothetical protein  23.94 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957862  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1203  hypothetical protein  22.8 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.816844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1115  putative type VI secretion protein VasE  25.36 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2354  type VI secretion protein, VC_A0114 family  24.78 
 
 		 446 aa  63.5  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2800  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.49 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3248  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.3 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1371  hypothetical protein  22.53 
 
 		 449 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2875  hypothetical protein  22.53 
 
 		 449 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1483  type VI secretion protein  22.53 
 
 		 449 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1077  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.3 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.414986  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4055  type VI secretion protein  25.88 
 
 		 445 aa  60.5  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000569036 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3024  type VI secretion protein  25.52 
 
 		 449 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0102  hypothetical protein  24.62 
 
 		 443 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2552  hypothetical protein  25.59 
 
 		 432 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0100062  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6677  type VI secretion protein  25.46 
 
 		 449 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1181  putative type VI secretion protein VasE-1  25.63 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100124  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2180  hypothetical protein  26.83 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000744464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0514  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.67 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42920  hypothetical protein  23.48 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3605  hypothetical protein  23.78 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0165  hypothetical protein  29.65 
 
 		 450 aa  57.4  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3423  hypothetical protein  34.25 
 
 		 451 aa  57  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3552  type VI secretion protein  34.25 
 
 		 451 aa  57  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0196523  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0857  hypothetical protein  26.73 
 
 		 464 aa  56.2  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.109106  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000014  uncharacterized protein ImpJ/VasE  23.25 
 
 		 429 aa  56.2  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000430  uncharacterized protein ImpJ/VasE  21.54 
 
 		 441 aa  55.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.959162  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4080  hypothetical protein  25.62 
 
 		 445 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365614  hitchhiker  0.000139294 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0313  type VI secretion protein, family  36.99 
 
 		 447 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.471816 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2914  hypothetical protein  24.53 
 
 		 449 aa  55.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.34801 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1675  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.59 
 
 		 447 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88528  hitchhiker  0.0077822 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0302  hypothetical protein  36.99 
 
 		 447 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.392469  normal  0.385972 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0307  type VI secretion protein  36.99 
 
 		 447 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300554  normal  0.0525484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0319  type VI secretion protein, family  36.99 
 
 		 447 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0397  hypothetical protein  37.66 
 
 		 467 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0991372  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1591  hypothetical protein  37.66 
 
 		 467 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1776  hypothetical protein  37.66 
 
 		 467 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2967  hypothetical protein  37.66 
 
 		 467 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2842  hypothetical protein  37.66 
 
 		 467 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0446  hypothetical protein  37.66 
 
 		 467 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0252  hypothetical protein  37.66 
 
 		 468 aa  54.3  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05852  hypothetical protein  22.19 
 
 		 441 aa  53.9  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>