107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3404 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3404  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  890    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34100  hypothetical protein  68.71 
 
 		 443 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000774446  normal  0.0569236 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2899  hypothetical protein  68.22 
 
 		 430 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0914506  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50780  hypothetical protein  63.07 
 
 		 441 aa  539  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357651  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5994  type VI secretion protein  28.44 
 
 		 444 aa  120  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1717  hypothetical protein  28.96 
 
 		 442 aa  117  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.324367  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01968  hypothetical protein  28.03 
 
 		 448 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4910  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.43 
 
 		 448 aa  67  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000188253  hitchhiker  0.00743846 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1524  hypothetical protein  21.27 
 
 		 445 aa  66.6  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02042  hypothetical protein  27.87 
 
 		 433 aa  63.9  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2967  hypothetical protein  26.24 
 
 		 448 aa  62  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1675  type VI secretion protein, VC_A0114 family  24.39 
 
 		 447 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88528  hitchhiker  0.0077822 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0378  hypothetical protein  25.07 
 
 		 448 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.493285  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0399  type VI secretion protein  25.07 
 
 		 448 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2642  hypothetical protein  25.27 
 
 		 448 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0464  hypothetical protein  25.27 
 
 		 448 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3726  hypothetical protein  27.86 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.529361  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3844  type VI secretion protein  26.54 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110826  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2503  type VI secretion protein  29.03 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0442  type VI secretion protein  25.27 
 
 		 448 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236466  normal  0.429573 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3556  hypothetical protein  25.27 
 
 		 448 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0420358  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3639  hypothetical protein  26.1 
 
 		 468 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507255  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2771  type VI secretion protein  27.54 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171251  normal  0.625099 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2522  type VI secretion protein  23.93 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.711445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0150  hypothetical protein  24.38 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112018  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26730  hypothetical protein  33.66 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3648  hypothetical protein  25.14 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119564  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3664  hypothetical protein  25.14 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2629  hypothetical protein  27.54 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0514  type VI secretion protein, VC_A0114 family  25.55 
 
 		 443 aa  59.7  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3093  hypothetical protein  27.54 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.131309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00940  hypothetical protein  23.17 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1203  hypothetical protein  34.91 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.816844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2933  type VI secretion protein  25.84 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2318  hypothetical protein  23.77 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0487552  hitchhiker  0.00103904 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1181  putative type VI secretion protein VasE-1  24.47 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100124  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4960  hypothetical protein  26.67 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1077  type VI secretion protein, VC_A0114 family  23.72 
 
 		 445 aa  57.4  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.414986  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6110  type VI secretion protein  37.5 
 
 		 448 aa  57  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3033  hypothetical protein  26.17 
 
 		 443 aa  56.2  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0153643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3248  type VI secretion protein, VC_A0114 family  23.42 
 
 		 445 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2264  hypothetical protein  25.41 
 
 		 448 aa  55.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1608  hypothetical protein  33.01 
 
 		 480 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25923  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0161  hypothetical protein  33.01 
 
 		 449 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0138  hypothetical protein  33.01 
 
 		 452 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2089  putative temperature-dependent protein secretion, ImpJ  38.89 
 
 		 448 aa  53.9  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1471  hypothetical protein  25.82 
 
 		 444 aa  54.3  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0560986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0936  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.17 
 
 		 447 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5264  hypothetical protein  27.42 
 
 		 448 aa  53.5  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0307  type VI secretion protein  37.5 
 
 		 447 aa  53.5  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300554  normal  0.0525484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0319  type VI secretion protein, family  37.5 
 
 		 447 aa  53.5  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0313  type VI secretion protein, family  37.5 
 
 		 447 aa  53.5  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.471816 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0302  hypothetical protein  37.5 
 
 		 447 aa  53.5  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.392469  normal  0.385972 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3311  hypothetical protein  25.15 
 
 		 463 aa  53.1  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1371  hypothetical protein  35.62 
 
 		 449 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2875  hypothetical protein  35.62 
 
 		 449 aa  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1483  type VI secretion protein  35.62 
 
 		 449 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0429  hypothetical protein  37.88 
 
 		 463 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0397  hypothetical protein  36.94 
 
 		 467 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0991372  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1207  ImpJ  36.94 
 
 		 454 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.740729  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0015  hypothetical protein  23.01 
 
 		 454 aa  51.2  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.947734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1591  hypothetical protein  36.94 
 
 		 467 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1776  hypothetical protein  36.94 
 
 		 467 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2967  hypothetical protein  36.94 
 
 		 467 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2842  hypothetical protein  36.94 
 
 		 467 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0446  hypothetical protein  36.94 
 
 		 467 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3024  type VI secretion protein  30.1 
 
 		 449 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1594  hypothetical protein  37.84 
 
 		 472 aa  51.2  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0252  hypothetical protein  36.94 
 
 		 468 aa  51.2  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000430  uncharacterized protein ImpJ/VasE  21.61 
 
 		 441 aa  51.2  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.959162  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1913  hypothetical protein  36.11 
 
 		 448 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0125  hypothetical protein  31.07 
 
 		 480 aa  50.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0926  hypothetical protein  36.11 
 
 		 448 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1213  hypothetical protein  36.11 
 
 		 448 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2188  hypothetical protein  36.11 
 
 		 448 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05852  hypothetical protein  21.9 
 
 		 441 aa  50.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1691  hypothetical protein  36.11 
 
 		 448 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0329  hypothetical protein  36.11 
 
 		 448 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0238  hypothetical protein  36.11 
 
 		 448 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0052  hypothetical protein  26.71 
 
 		 445 aa  50.1  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.808473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3478  hypothetical protein  35.71 
 
 		 447 aa  50.1  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2914  hypothetical protein  24.85 
 
 		 449 aa  50.1  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.34801 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3648  type VI secretion protein  36.25 
 
 		 449 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6043  hypothetical protein  34.88 
 
 		 446 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0165  hypothetical protein  27.64 
 
 		 450 aa  49.3  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0102  hypothetical protein  23.82 
 
 		 443 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2800  type VI secretion protein, VC_A0114 family  22.29 
 
 		 445 aa  48.9  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0024  hypothetical protein  28.57 
 
 		 301 aa  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.668164  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6677  type VI secretion protein  32.56 
 
 		 449 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0728  hypothetical protein  25.39 
 
 		 450 aa  47.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2617  hypothetical protein  22.22 
 
 		 445 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500578  normal  0.0201893 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2451  hypothetical protein  40.91 
 
 		 444 aa  47  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2120  hypothetical protein  36.11 
 
 		 445 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3231  type VI secretion protein  28.28 
 
 		 445 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00252  ImpJ  34.25 
 
 		 445 aa  46.6  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0239  hypothetical protein  30.14 
 
 		 443 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.892408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4080  hypothetical protein  34.85 
 
 		 445 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365614  hitchhiker  0.000139294 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0984  hypothetical protein  34.29 
 
 		 448 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0231  hypothetical protein  30.14 
 
 		 443 aa  45.8  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0233  hypothetical protein  30.14 
 
 		 443 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>