61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2899 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_34100  hypothetical protein  98.6 
 
 		 443 aa  830    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000774446  normal  0.0569236 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2899  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  836    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0914506  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3404  hypothetical protein  68.22 
 
 		 443 aa  558  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50780  hypothetical protein  64.97 
 
 		 441 aa  524  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357651  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5994  type VI secretion protein  30.25 
 
 		 444 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1717  hypothetical protein  29.7 
 
 		 442 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.324367  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1524  hypothetical protein  23.58 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4960  hypothetical protein  28.87 
 
 		 447 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000014  uncharacterized protein ImpJ/VasE  23.56 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3311  hypothetical protein  25.41 
 
 		 463 aa  65.1  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0150  hypothetical protein  24.77 
 
 		 444 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112018  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02042  hypothetical protein  26.47 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2318  hypothetical protein  24.38 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0487552  hitchhiker  0.00103904 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5264  hypothetical protein  28.85 
 
 		 448 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00940  hypothetical protein  24.1 
 
 		 444 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3844  type VI secretion protein  26.92 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110826  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_003296  RS01968  hypothetical protein  29.66 
 
 		 448 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2771  type VI secretion protein  27.49 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171251  normal  0.625099 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2629  hypothetical protein  27.84 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2503  type VI secretion protein  28.18 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3556  hypothetical protein  26.53 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0420358  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2933  type VI secretion protein  26.87 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159534  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3093  hypothetical protein  27.49 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.131309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4910  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.77 
 
 		 448 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000188253  hitchhiker  0.00743846 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1675  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.84 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88528  hitchhiker  0.0077822 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1077  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.16 
 
 		 445 aa  57  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.414986  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0378  hypothetical protein  26.19 
 
 		 448 aa  57  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.493285  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0442  type VI secretion protein  26.19 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236466  normal  0.429573 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0464  hypothetical protein  26.19 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2642  hypothetical protein  26.19 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2451  hypothetical protein  25.91 
 
 		 444 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0399  type VI secretion protein  26.19 
 
 		 448 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3248  type VI secretion protein, VC_A0114 family  25.83 
 
 		 445 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2800  type VI secretion protein, VC_A0114 family  24.38 
 
 		 445 aa  53.9  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3639  hypothetical protein  25.63 
 
 		 468 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507255  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2522  type VI secretion protein  23.61 
 
 		 444 aa  52.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.711445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000430  uncharacterized protein ImpJ/VasE  20.97 
 
 		 441 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.959162  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3648  hypothetical protein  25.63 
 
 		 448 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119564  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3664  hypothetical protein  25.63 
 
 		 448 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2809  hypothetical protein  22.92 
 
 		 442 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0554193  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0429  hypothetical protein  24.35 
 
 		 463 aa  51.6  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2967  hypothetical protein  24.83 
 
 		 448 aa  51.2  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1471  hypothetical protein  27.56 
 
 		 444 aa  50.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0560986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6043  hypothetical protein  33.33 
 
 		 446 aa  50.1  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1181  putative type VI secretion protein VasE-1  28.24 
 
 		 438 aa  50.1  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100124  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2090  hypothetical protein  23.05 
 
 		 443 aa  50.1  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612247  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3033  hypothetical protein  34.52 
 
 		 443 aa  48.9  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0153643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05852  hypothetical protein  20.67 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2264  hypothetical protein  37.5 
 
 		 448 aa  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1483  type VI secretion protein  26.05 
 
 		 449 aa  47.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1371  hypothetical protein  26.05 
 
 		 449 aa  47.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2875  hypothetical protein  26.05 
 
 		 449 aa  47.8  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0211  type VI secretion protein, VC_A0114 family  35.37 
 
 		 458 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0161  hypothetical protein  36.51 
 
 		 449 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0138  hypothetical protein  36.51 
 
 		 452 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1608  hypothetical protein  36.51 
 
 		 480 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25923  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3024  type VI secretion protein  34.92 
 
 		 449 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3726  hypothetical protein  25.41 
 
 		 444 aa  44.3  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.529361  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26730  hypothetical protein  33.33 
 
 		 455 aa  44.3  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6677  type VI secretion protein  34.33 
 
 		 449 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0252  hypothetical protein  33.33 
 
 		 468 aa  43.5  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>