149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0024 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0024  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  620  1e-176  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.668164  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2522  type VI secretion protein  70.74 
 
 
444 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.711445  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1203  hypothetical protein  69.26 
 
 
444 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.816844  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3726  hypothetical protein  62.22 
 
 
444 aa  360  2e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.529361  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2800  type VI secretion protein, VC_A0114 family  57.78 
 
 
445 aa  332  4e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1077  type VI secretion protein, VC_A0114 family  57.41 
 
 
445 aa  329  3e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.414986  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3248  type VI secretion protein, VC_A0114 family  57.04 
 
 
445 aa  329  4e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0052  hypothetical protein  52.77 
 
 
445 aa  285  5.999999999999999e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.808473  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2617  hypothetical protein  47.04 
 
 
445 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500578  normal  0.0201893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2120  hypothetical protein  46.3 
 
 
445 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3231  type VI secretion protein  46.3 
 
 
445 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4080  hypothetical protein  45.19 
 
 
445 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365614  hitchhiker  0.000139294 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0393  type VI secretion protein  43.59 
 
 
448 aa  229  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0320  hypothetical protein  43.59 
 
 
448 aa  229  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0231  hypothetical protein  41.64 
 
 
443 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0233  hypothetical protein  41.64 
 
 
443 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0239  hypothetical protein  41.38 
 
 
443 aa  210  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.892408 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1104  hypothetical protein  40.52 
 
 
443 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1223  hypothetical protein  40.52 
 
 
443 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.629455 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1471  hypothetical protein  35.21 
 
 
444 aa  192  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0560986  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00940  hypothetical protein  36.9 
 
 
444 aa  191  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112579  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2318  hypothetical protein  37.88 
 
 
444 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0487552  hitchhiker  0.00103904 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2090  hypothetical protein  37.22 
 
 
443 aa  191  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612247  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0150  hypothetical protein  36.9 
 
 
444 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112018  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000430  uncharacterized protein ImpJ/VasE  40.45 
 
 
441 aa  189  5e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.959162  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05852  hypothetical protein  40.07 
 
 
441 aa  187  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3844  type VI secretion protein  36.7 
 
 
444 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110826  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6043  hypothetical protein  37.37 
 
 
446 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00252  ImpJ  36.98 
 
 
445 aa  172  7.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0161  hypothetical protein  35.04 
 
 
449 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0138  hypothetical protein  35.04 
 
 
452 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1608  hypothetical protein  35.04 
 
 
480 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25923  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0514  type VI secretion protein, VC_A0114 family  32.95 
 
 
443 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26730  hypothetical protein  35.74 
 
 
455 aa  169  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0397  hypothetical protein  33.8 
 
 
467 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0991372  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6110  type VI secretion protein  34.94 
 
 
448 aa  169  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1591  hypothetical protein  33.8 
 
 
467 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1776  hypothetical protein  33.8 
 
 
467 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2967  hypothetical protein  33.8 
 
 
467 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0446  hypothetical protein  33.8 
 
 
467 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1207  ImpJ  33.8 
 
 
454 aa  168  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.740729  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1675  type VI secretion protein, VC_A0114 family  34.07 
 
 
447 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88528  hitchhiker  0.0077822 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0125  hypothetical protein  35.27 
 
 
480 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2842  hypothetical protein  33.45 
 
 
467 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1594  hypothetical protein  33.22 
 
 
472 aa  165  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3033  hypothetical protein  35.79 
 
 
443 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0153643  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0252  hypothetical protein  33.11 
 
 
468 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0102  hypothetical protein  31.58 
 
 
443 aa  162  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1691  hypothetical protein  34.57 
 
 
448 aa  162  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2875  hypothetical protein  32.09 
 
 
449 aa  162  9e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1483  type VI secretion protein  32.09 
 
 
449 aa  162  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1371  hypothetical protein  32.09 
 
 
449 aa  162  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1524  hypothetical protein  32.07 
 
 
445 aa  161  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0329  hypothetical protein  34.57 
 
 
448 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0238  hypothetical protein  34.57 
 
 
448 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5420  hypothetical protein  33.46 
 
 
443 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957862  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2089  putative temperature-dependent protein secretion, ImpJ  34.57 
 
 
448 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6677  type VI secretion protein  33.95 
 
 
449 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3605  hypothetical protein  33.83 
 
 
443 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5579  hypothetical protein  33.83 
 
 
443 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1913  hypothetical protein  34.2 
 
 
448 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0926  hypothetical protein  34.2 
 
 
448 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1213  hypothetical protein  34.2 
 
 
448 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2188  hypothetical protein  34.2 
 
 
448 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42920  hypothetical protein  33.46 
 
 
443 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2998  hypothetical protein  34.29 
 
 
448 aa  156  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3024  type VI secretion protein  33.58 
 
 
449 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2375  hypothetical protein  31.92 
 
 
442 aa  155  6e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0211  type VI secretion protein, VC_A0114 family  32.09 
 
 
458 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3046  type VI secretion protein, VC_A0114 family  32.31 
 
 
445 aa  152  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00998983  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0936  type VI secretion protein, VC_A0114 family  33.58 
 
 
447 aa  152  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3478  hypothetical protein  32.58 
 
 
447 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0307  type VI secretion protein  34.56 
 
 
447 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300554  normal  0.0525484 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0302  hypothetical protein  34.56 
 
 
447 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.392469  normal  0.385972 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0319  type VI secretion protein, family  34.56 
 
 
447 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0313  type VI secretion protein, family  34.56 
 
 
447 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.471816 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4055  type VI secretion protein  33.81 
 
 
445 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000569036 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2354  type VI secretion protein, VC_A0114 family  32.43 
 
 
446 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1115  putative type VI secretion protein VasE  31.48 
 
 
440 aa  145  9e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0984  hypothetical protein  31.44 
 
 
448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2466  type VI secretion protein, VC_A0114 family  31.41 
 
 
446 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2552  hypothetical protein  30.4 
 
 
432 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0100062  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2933  type VI secretion protein  30.32 
 
 
448 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159534  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3093  hypothetical protein  29.43 
 
 
447 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.131309  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3552  type VI secretion protein  28.68 
 
 
451 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0196523  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3423  hypothetical protein  28.68 
 
 
451 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2503  type VI secretion protein  29.37 
 
 
447 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2629  hypothetical protein  29.08 
 
 
447 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253477  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2451  hypothetical protein  29.63 
 
 
444 aa  109  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187575  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2771  type VI secretion protein  26.62 
 
 
447 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171251  normal  0.625099 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4960  hypothetical protein  30.04 
 
 
447 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286001  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3556  hypothetical protein  28.88 
 
 
448 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0420358  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2642  hypothetical protein  28.52 
 
 
448 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0378  hypothetical protein  28.88 
 
 
448 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.493285  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0464  hypothetical protein  28.52 
 
 
448 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0442  type VI secretion protein  28.52 
 
 
448 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236466  normal  0.429573 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0399  type VI secretion protein  28.88 
 
 
448 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66694  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3913  type VI secretion protein  28.39 
 
 
416 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5264  hypothetical protein  29.3 
 
 
448 aa  105  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2967  hypothetical protein  29.86 
 
 
448 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>