More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_41190 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_41190  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  100 
 
 
796 aa  1583    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 
773 aa  189  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.28125 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 
721 aa  183  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.08 
 
 
989 aa  173  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.01 
 
 
939 aa  169  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
777 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0739074  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.95 
 
 
989 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7378  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 
782 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.875574  normal  0.554031 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3065  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 
1128 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3498  two component sensor kinase  31.44 
 
 
1125 aa  164  7e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.02 
 
 
1788 aa  164  8.000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3320  histidine kinase  31.38 
 
 
1128 aa  163  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.515444 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1586  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.35 
 
 
1178 aa  163  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.830805  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6197  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 
782 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350252  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 
720 aa  161  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.646619 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  32.06 
 
 
1322 aa  161  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3975  Cache sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 
811 aa  159  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000222358  hitchhiker  0.00723661 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5622  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 
780 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0297293  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5987  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 
780 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46293  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  33.7 
 
 
800 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3119  Signal transduction histidine kinase-like  29.34 
 
 
861 aa  157  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4180  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.25 
 
 
1126 aa  157  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0796198 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3542  PAS sensor protein  30.38 
 
 
656 aa  157  9e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.11869  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  34.04 
 
 
781 aa  157  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1876  histidine kinase  25.53 
 
 
979 aa  156  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0246829  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2985  fused histidine kinase sensor/response regulator  30.24 
 
 
1121 aa  156  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.446873 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  31.76 
 
 
2051 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4079  sensor histidine kinase/response regulator  28.66 
 
 
1161 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  32.69 
 
 
1407 aa  153  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  29.05 
 
 
937 aa  153  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0653  sensor histidine kinase  33.03 
 
 
1124 aa  153  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.450749  normal  0.469118 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6478  histidine kinase  27.33 
 
 
780 aa  152  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.360595  normal  0.0849946 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 
841 aa  151  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.56 
 
 
977 aa  150  6e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  29.76 
 
 
543 aa  151  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  30.81 
 
 
970 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5513  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 
1124 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168644  normal  0.269782 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  24.83 
 
 
795 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 
687 aa  150  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.37 
 
 
1127 aa  150  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1730  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 
1195 aa  150  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479441  normal  0.752594 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 
1578 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2513  ATP-binding region, ATPase-like  26.76 
 
 
945 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.543755  normal  0.160676 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  31.05 
 
 
1135 aa  149  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 
1611 aa  149  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.68 
 
 
916 aa  148  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3463  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.94 
 
 
1333 aa  148  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.245922 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0542  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.1 
 
 
1302 aa  147  6e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  28.77 
 
 
914 aa  147  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 
1691 aa  147  8.000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.19 
 
 
862 aa  146  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 
784 aa  147  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0592  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 
1113 aa  146  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0114606 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.16 
 
 
1068 aa  145  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.13 
 
 
1323 aa  145  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  29.62 
 
 
2035 aa  146  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1353  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.85 
 
 
1197 aa  146  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.89 
 
 
1055 aa  146  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3146  histidine kinase  34.67 
 
 
1140 aa  146  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.353593  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  31.78 
 
 
982 aa  145  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3731  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.59 
 
 
1140 aa  145  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4637  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.59 
 
 
1140 aa  145  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.619414  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.35 
 
 
977 aa  145  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5667  histidine kinase  31.32 
 
 
1140 aa  144  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.42 
 
 
922 aa  144  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3766  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.46 
 
 
802 aa  144  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0676736 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  32.89 
 
 
793 aa  144  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.57 
 
 
1069 aa  144  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2693  histidine kinase  28.33 
 
 
782 aa  144  7e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.145264  normal  0.474998 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.34 
 
 
1146 aa  144  8e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4154  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 
750 aa  143  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.22479  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2976  two-component hybrid sensor and regulator  28.53 
 
 
1132 aa  142  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.210238 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5710  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase (bvgS-like)  28.84 
 
 
1040 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0808  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 
929 aa  142  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0961  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
1154 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.544458  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.05 
 
 
1350 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.96 
 
 
1659 aa  142  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0975  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.38 
 
 
1130 aa  142  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.537982 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 
1223 aa  142  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4944  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.44 
 
 
782 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.947631  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 
1127 aa  141  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 
816 aa  141  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3586  sensor histidine kinase/response regulator  32.87 
 
 
1153 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.79 
 
 
1433 aa  141  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3573  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.47 
 
 
1120 aa  141  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3382  ATPase domain-containing protein  31.21 
 
 
1071 aa  141  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525319  normal  0.740946 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4574  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.48 
 
 
729 aa  141  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.543152  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.48 
 
 
1410 aa  141  6e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.24 
 
 
1369 aa  141  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  33.62 
 
 
810 aa  141  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1746  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.55 
 
 
903 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1948  aerobic respiration control sensor protein ArcB  29.53 
 
 
785 aa  140  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000151303  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5844  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.75 
 
 
948 aa  140  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2001  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.3 
 
 
1121 aa  140  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.57 
 
 
791 aa  140  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.19 
 
 
1287 aa  140  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.51 
 
 
1245 aa  140  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  33.42 
 
 
977 aa  140  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  30.31 
 
 
1188 aa  139  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 
1236 aa  139  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>