More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5987 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  72 
 
 
777 aa  1115    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0739074  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6478  histidine kinase  96.15 
 
 
780 aa  1446    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.360595  normal  0.0849946 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7378  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  78.87 
 
 
782 aa  1190    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.875574  normal  0.554031 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5622  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
780 aa  1570    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0297293  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6197  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  74.43 
 
 
782 aa  1110    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350252  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5987  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
780 aa  1570    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46293  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.36 
 
 
773 aa  619  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.28125 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41190  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  27.4 
 
 
796 aa  159  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0501  histidine kinase  26.97 
 
 
955 aa  154  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.02 
 
 
841 aa  144  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0500  histidine kinase  36.29 
 
 
940 aa  144  8e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 
770 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  37.74 
 
 
1323 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
1452 aa  140  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.72 
 
 
791 aa  139  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.42 
 
 
1410 aa  139  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3645  aerobic respiration control sensor protein ArcB  35.37 
 
 
777 aa  139  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0208563  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3519  aerobic respiration control sensor protein ArcB  34.94 
 
 
778 aa  138  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3590  aerobic respiration control sensor protein ArcB  34.94 
 
 
778 aa  138  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.571349  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3626  aerobic respiration control sensor protein ArcB  34.94 
 
 
778 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.10996  normal  0.809738 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.39 
 
 
790 aa  138  5e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  38.49 
 
 
781 aa  137  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  33.45 
 
 
655 aa  137  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0522  two component sensor kinase/response regulator hybrid  34.08 
 
 
751 aa  136  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.65 
 
 
765 aa  137  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0507  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.5 
 
 
1045 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0066  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.84 
 
 
721 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00490  sensor protein BarA  25.16 
 
 
1042 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3521  aerobic respiration control sensor protein ArcB  34.54 
 
 
778 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2513  ATP-binding region, ATPase-like  26.2 
 
 
945 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.543755  normal  0.160676 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3688  aerobic respiration control sensor protein ArcB  34.54 
 
 
778 aa  136  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.739542  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.24 
 
 
1266 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0533  aerobic respiration control sensor protein ArcB  32.67 
 
 
778 aa  135  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0807351  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.73 
 
 
705 aa  135  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 
921 aa  135  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0469  aerobic respiration control sensor protein ArcB  32.67 
 
 
778 aa  135  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.55831  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.73 
 
 
1240 aa  134  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00475  two-component system sensor histidine kinase-response regulator hybridprotein  35.59 
 
 
1364 aa  134  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679058  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1126  aerobic respiration control sensor protein ArcB  32.67 
 
 
778 aa  134  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.56 
 
 
1691 aa  134  6.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4154  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 
750 aa  134  7.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.22479  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
927 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 
835 aa  133  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0298  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 
899 aa  133  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0542846  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.77 
 
 
989 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 
875 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03075  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ArcA  33.33 
 
 
778 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0497  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
778 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  36.91 
 
 
982 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03026  hypothetical protein  33.33 
 
 
778 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3560  aerobic respiration control sensor protein ArcB  33.33 
 
 
778 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3698  aerobic respiration control sensor protein ArcB  33.33 
 
 
778 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0490  aerobic respiration control sensor protein ArcB  33.33 
 
 
778 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.512879 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.41 
 
 
939 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3506  aerobic respiration control sensor protein ArcB  33.33 
 
 
778 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.648174  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 
1765 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4533  aerobic respiration control sensor protein ArcB  33.33 
 
 
778 aa  132  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3403  aerobic respiration control sensor protein ArcB  33.33 
 
 
778 aa  132  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3586  sensor histidine kinase/response regulator  32.76 
 
 
1153 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.3 
 
 
989 aa  131  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.36 
 
 
1310 aa  131  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
1350 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1250  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.2 
 
 
936 aa  130  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.63 
 
 
984 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.32 
 
 
1363 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 
721 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2480  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 
846 aa  130  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000921222 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000382  putative sensory box sensor histidine kinase/response regulator  34.22 
 
 
873 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 
784 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  34.51 
 
 
1763 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  25.7 
 
 
914 aa  129  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2375  histidine kinase  36.28 
 
 
806 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.824997  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.77 
 
 
1323 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  34.32 
 
 
970 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2560  aerobic respiration control sensor protein ArcB  30.62 
 
 
788 aa  129  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 
1768 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0229  histidine kinase  34 
 
 
724 aa  129  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0610831  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  33.21 
 
 
565 aa  128  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 
631 aa  129  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3416  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.23 
 
 
878 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.16 
 
 
1058 aa  128  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4954  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 
1016 aa  128  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0561599 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 
1643 aa  127  6e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.87 
 
 
1022 aa  127  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.13 
 
 
791 aa  127  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.22 
 
 
1168 aa  127  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01227  two-component hybrid sensor and regulator  34.38 
 
 
699 aa  127  8.000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 
1765 aa  127  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 
1603 aa  127  9e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2818  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.1 
 
 
720 aa  127  9e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.215558  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00931  aerobic respiration control sensor protein ArcB  31.82 
 
 
786 aa  127  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0968  histidine kinase  37.28 
 
 
318 aa  126  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148974  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3975  Cache sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 
811 aa  126  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000222358  hitchhiker  0.00723661 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3135  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.75 
 
 
1187 aa  126  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 
1202 aa  127  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1075 aa  127  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.94 
 
 
1767 aa  126  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.44 
 
 
1582 aa  126  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0996  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.68 
 
 
832 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 
724 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>