235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0503 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0503  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 429 aa  886    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.369072  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1227  Extracellular ligand-binding receptor  27.12 
 
 		 424 aa  90.1  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229602 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0957  Extracellular ligand-binding receptor  26.01 
 
 		 415 aa  88.6  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1154  extracellular ligand-binding receptor  27.93 
 
 		 449 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443442  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  25.06 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2411  extracellular ligand-binding receptor  26.77 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.32979  normal  0.572085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29060  amino acid-binding protein  25.88 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.987763  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1925  extracellular ligand-binding receptor  26.06 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0315464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1186  branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  26.09 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.62825  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0371  extracellular ligand-binding receptor  26.9 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2166  extracellular ligand-binding receptor  25.54 
 
 		 376 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.0643115 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2197  extracellular ligand-binding receptor  26.63 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.974618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0868  Extracellular ligand-binding receptor  23.49 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1728  Extracellular ligand-binding receptor  27.05 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3839  extracellular ligand-binding receptor  26.1 
 
 		 405 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2113  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.19 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4919  extracellular ligand-binding receptor  24.24 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3964  Extracellular ligand-binding receptor  25.76 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  26.06 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1830  Extracellular ligand-binding receptor  25.73 
 
 		 375 aa  65.5  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.290342  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4914  extracellular ligand-binding receptor  24.24 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.113346  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0603  Extracellular ligand-binding receptor  25.63 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2915  Extracellular ligand-binding receptor  23.99 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000111325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3206  Extracellular ligand-binding receptor  23.99 
 
 		 440 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  24.62 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2119  extracellular ligand-binding receptor  23.79 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00221988  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1940  putative secreted substrate binding protein  23.44 
 
 		 375 aa  62.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15659  normal  0.0532415 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  22.61 
 
 		 378 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2733  Extracellular ligand-binding receptor  24.1 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4471  extracellular ligand-binding receptor  25.96 
 
 		 373 aa  62  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.89 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2101  Extracellular ligand-binding receptor  24.28 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5197  extracellular ligand-binding receptor  24 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308157  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4669  extracellular ligand-binding receptor  24 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1977  periplasmic binding protein  24.51 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.343651  normal  0.981595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1548  Extracellular ligand-binding receptor  26.7 
 
 		 405 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.348636  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0360  extracellular ligand-binding receptor  21.09 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  24.41 
 
 		 390 aa  59.3  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3159  extracellular ligand-binding receptor  25.15 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3401  extracellular ligand-binding receptor  24.44 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388266 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1378  Extracellular ligand-binding receptor  26.01 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0258  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  24.32 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3970  Extracellular ligand-binding receptor  25.34 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1761  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.88 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6118  branched chain amino-acid ABC transporter substrate-binding protein  22.37 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.147292 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0472  Extracellular ligand-binding receptor  25.23 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.538302  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1959  extracellular ligand-binding receptor  23.79 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1183  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  32.91 
 
 		 448 aa  57.4  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4960  extracellular ligand-binding receptor  23.71 
 
 		 392 aa  57  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971777 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1866  extracellular ligand-binding receptor  23.89 
 
 		 373 aa  57  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6587  Extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3414  extracellular ligand-binding receptor  23.43 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0938732  normal  0.686919 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3058  extracellular ligand-binding receptor  23.43 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5309  extracellular ligand-binding receptor  23.43 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0404  extracellular ligand-binding receptor  23.76 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0168747  normal  0.259327 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2807  putative periplasmic substrate-binding protein  24.19 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6489  extracellular ligand-binding receptor  24.4 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225285  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2750  Extracellular ligand-binding receptor  23.84 
 
 		 375 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0572  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.19 
 
 		 382 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1756  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.19 
 
 		 382 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0548138  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2846  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.19 
 
 		 382 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2747  putative periplasmic substrate-binding protein  24.19 
 
 		 382 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312608  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6241  extracellular ligand-binding receptor  25.15 
 
 		 366 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  24.31 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2140  extracellular ligand-binding receptor  23.72 
 
 		 382 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3084  extracellular ligand-binding receptor  23.97 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0552294  normal  0.474312 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2434  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.19 
 
 		 382 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00891241  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  24.27 
 
 		 382 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2389  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.6 
 
 		 382 aa  55.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.520842  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  22.26 
 
 		 377 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0074  ABC branched-chain amino acid transporter substrate-binding protein  41.41 
 
 		 394 aa  54.7  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  22.07 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0339  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.19 
 
 		 428 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.824912 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3417  extracellular ligand-binding receptor  22.91 
 
 		 409 aa  54.3  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.498074  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6410  extracellular ligand-binding receptor  25.45 
 
 		 366 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217978  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3392  extracellular ligand-binding receptor  25.45 
 
 		 366 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4810  extracellular ligand-binding receptor  24.69 
 
 		 422 aa  54.7  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.422272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6643  extracellular ligand-binding receptor  25.45 
 
 		 366 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3860  extracellular ligand-binding receptor  24.05 
 
 		 381 aa  53.9  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6002  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  21.56 
 
 		 389 aa  53.1  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.0284097 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2866  periplasmic ligand binding lipoprotein  23.99 
 
 		 662 aa  53.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.691628  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  23.21 
 
 		 460 aa  53.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4793  extracellular ligand-binding receptor  23.27 
 
 		 441 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3728  extracellular ligand-binding receptor  23.44 
 
 		 392 aa  53.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172455  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0611  Extracellular ligand-binding receptor  24.46 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01985  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  22.52 
 
 		 386 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4261  extracellular ligand-binding receptor  23.03 
 
 		 373 aa  52.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1741  Extracellular ligand-binding receptor  25.48 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4969  extracellular ligand-binding receptor  21.17 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.935688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1045  extracellular ligand-binding receptor  24.1 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1861  periplasmic binding protein of ABC transporter for natural amino acids  21.5 
 
 		 421 aa  51.6  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  24.01 
 
 		 399 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  23.21 
 
 		 376 aa  51.2  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5995  extracellular ligand-binding receptor  23.03 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.814001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2285  extracellular ligand-binding receptor  33.06 
 
 		 417 aa  51.2  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1592  leucine-specific binding precursor transmembrane protein  21.73 
 
 		 380 aa  51.2  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4242  extracellular ligand-binding receptor  21.84 
 
 		 373 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000000756343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1047  extracellular ligand-binding receptor  22.83 
 
 		 382 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.545009 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4758  extracellular ligand-binding receptor  24.27 
 
 		 382 aa  50.8  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4013  extracellular ligand-binding receptor  26.19 
 
 		 391 aa  51.2  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00118971  normal  0.173861 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>