146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_03427 on replicon BN001306
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001306  ANIA_03427  RNA binding protein Rnp24, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05840)  100 
 
 
357 aa  736    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.820047  normal  0.0382541 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33568  predicted protein  34.23 
 
 
387 aa  173  3.9999999999999995e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0922684  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06850  RNA-binding protein rnp24, putative  32.26 
 
 
449 aa  144  3e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  28.99 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01517  nucleic acid-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05260)  26.79 
 
 
450 aa  65.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000597445  normal  0.366843 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  25.65 
 
 
441 aa  63.9  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27365  predicted protein  30.51 
 
 
288 aa  60.5  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.60406  normal  0.0267412 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  25.48 
 
 
524 aa  59.7  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.046271 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06501  splicing factor 3b subunit 4 (AFU_orthologue; AFUA_6G05180)  27.71 
 
 
352 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  50 
 
 
76 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44442  predicted protein  25.43 
 
 
269 aa  58.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00448439  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  26.78 
 
 
632 aa  57.4  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  39.06 
 
 
455 aa  55.1  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  44.29 
 
 
122 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  27.32 
 
 
477 aa  54.3  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  27.64 
 
 
572 aa  54.3  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68431  predicted protein  18.56 
 
 
481 aa  53.1  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.326918  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  37.1 
 
 
86 aa  53.1  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_25920  predicted protein  25.12 
 
 
424 aa  53.1  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0604247  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10941  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein HRP1 (AFU_orthologue; AFUA_2G06090)  22.81 
 
 
559 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210274  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2631  RNA-binding region RNP-1  40.68 
 
 
134 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000024713  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  42.11 
 
 
83 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21039  predicted protein  41.54 
 
 
246 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  24.85 
 
 
552 aa  50.8  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0967  RNP-1 like RNA-binding protein  41.07 
 
 
221 aa  50.4  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191765  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01940  conserved hypothetical protein  23.24 
 
 
480 aa  50.4  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84754  predicted protein  27.49 
 
 
246 aa  50.4  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.345333 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15612  predicted protein  26.95 
 
 
303 aa  50.4  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0944  RNP-1 like RNA-binding protein  50 
 
 
117 aa  50.1  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  42.31 
 
 
146 aa  50.1  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  39.29 
 
 
97 aa  50.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50467  predicted protein  33.9 
 
 
217 aa  50.1  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.446358  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  36.67 
 
 
88 aa  49.7  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  40.82 
 
 
98 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.319676 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01340  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09490)  36 
 
 
187 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.575535  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04570  poly(A) binding protein, putative  34.48 
 
 
210 aa  48.9  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0559902  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06110  rRNA primary transcript binding protein, putative  40.68 
 
 
769 aa  48.9  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  38.33 
 
 
148 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  38.6 
 
 
104 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45495  predicted protein  41.07 
 
 
155 aa  48.9  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal  0.923833 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04330  ribosome biogenesis (Nop4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06250)  34.67 
 
 
724 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07350  translation initiation factor 4B (AFU_orthologue; AFUA_2G16400)  34.23 
 
 
497 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628412  normal  0.665628 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00421  Multiple RNA-binding domain-containing protein 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGA9]  42.62 
 
 
819 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.857696  normal  0.9634 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04870  conserved hypothetical protein  33.67 
 
 
504 aa  48.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.393554  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  35.82 
 
 
88 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44395  predicted protein  34.43 
 
 
313 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00014935  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0352  RNP-1 like RNA-binding protein  42.31 
 
 
109 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0296626  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04748  RNA binding protein (AFU_orthologue; AFUA_3G06310)  29.31 
 
 
339 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.311535  normal  0.626958 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  35 
 
 
88 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  42.86 
 
 
85 aa  47.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38809  predicted protein  24.55 
 
 
319 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000594517  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  38.33 
 
 
176 aa  47.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
91 aa  47.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  40.43 
 
 
102 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  39.58 
 
 
94 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  36.67 
 
 
150 aa  47  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  42.59 
 
 
149 aa  47.4  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20857  predicted protein  23.08 
 
 
687 aa  47.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.821409  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  39.58 
 
 
94 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46145  predicted protein  23.78 
 
 
393 aa  47.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0356931  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13095  predicted protein  39.29 
 
 
97 aa  47  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  37.29 
 
 
87 aa  47.4  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  39.62 
 
 
88 aa  47  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04610  conserved hypothetical protein  27.38 
 
 
304 aa  47  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  37.5 
 
 
99 aa  47  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
101 aa  47  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  42.59 
 
 
155 aa  46.6  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  37.7 
 
 
196 aa  47  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  36.67 
 
 
151 aa  47  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84007  predicted protein  33.33 
 
 
439 aa  47  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_5724  predicted protein  21.84 
 
 
291 aa  46.6  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181544  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  38.3 
 
 
99 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0401  RNP-1 like RNA-binding protein  40.35 
 
 
92 aa  46.6  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000557638  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07706  RNA binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08310)  38.6 
 
 
328 aa  46.6  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  33.7 
 
 
90 aa  46.6  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  41.67 
 
 
89 aa  46.6  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  36.67 
 
 
152 aa  46.6  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  38.71 
 
 
102 aa  46.2  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  36.67 
 
 
107 aa  46.2  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  38.71 
 
 
102 aa  46.2  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3960  RNP-1 like RNA-binding protein  41.38 
 
 
195 aa  46.2  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000285938  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1324  RNA-binding protein  40.68 
 
 
107 aa  46.2  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  39.29 
 
 
109 aa  46.2  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12693  predicted protein  23.21 
 
 
151 aa  46.2  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689101  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01250  rRNA primary transcript binding protein, putative  24.06 
 
 
651 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  36.17 
 
 
111 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4045  RNP-1 like RNA-binding protein  41.38 
 
 
196 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.847138 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  40.82 
 
 
173 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  36.73 
 
 
95 aa  45.8  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  33.33 
 
 
116 aa  46.2  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_8269  predicted protein  44.44 
 
 
77 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3309  RNP-1 like RNA-binding protein  38.46 
 
 
82 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788689  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03760  hypothetical protein  26.32 
 
 
1121 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04060  conserved hypothetical protein  25.3 
 
 
615 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.639663  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  35.71 
 
 
90 aa  45.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  36.67 
 
 
176 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  40.74 
 
 
132 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4357  RNP-1 like RNA-binding protein  39.58 
 
 
97 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86797  predicted protein  36 
 
 
838 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_710  predicted protein  23.04 
 
 
874 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000103935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>