99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_15612 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009359  OSTLU_15612  predicted protein  100 
 
 		 303 aa  611  9.999999999999999e-175  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44442  predicted protein  27.47 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00448439  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49387  predicted protein  24.22 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.452318  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  27.27 
 
 		 524 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.046271 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  26.55 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68431  predicted protein  29.61 
 
 		 481 aa  58.2  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.326918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33568  predicted protein  23.89 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0922684  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01517  nucleic acid-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05260)  26.4 
 
 		 450 aa  53.1  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000597445  normal  0.366843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  37.65 
 
 		 105 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_7602  predicted protein  27.63 
 
 		 161 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  39.74 
 
 		 82 aa  51.2  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  33.73 
 
 		 477 aa  50.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  38.82 
 
 		 101 aa  50.4  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  39.02 
 
 		 207 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.882388 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10941  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein HRP1 (AFU_orthologue; AFUA_2G06090)  26.11 
 
 		 559 aa  50.4  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210274  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  39.51 
 
 		 99 aa  49.7  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 		 111 aa  49.3  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_25920  predicted protein  24.38 
 
 		 424 aa  49.3  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0604247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 		 90 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  34.83 
 
 		 102 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2631  RNA-binding region RNP-1  34.09 
 
 		 134 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000024713  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03427  RNA binding protein Rnp24, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05840)  26.95 
 
 		 357 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.820047  normal  0.0382541 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  35.9 
 
 		 157 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  33.75 
 
 		 90 aa  48.5  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 		 86 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2264  RNP-1 like RNA-binding protein  34.62 
 
 		 101 aa  48.5  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683035  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31221  predicted protein  41.79 
 
 		 727 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.005519  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  30.59 
 
 		 89 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  33.71 
 
 		 90 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.05811 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01340  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09490)  36.99 
 
 		 187 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.575535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2498  RNA binding protein  36.21 
 
 		 107 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01940  conserved hypothetical protein  27.98 
 
 		 480 aa  47.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  38.96 
 
 		 103 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44395  predicted protein  33.8 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00014935  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  38.75 
 
 		 103 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04570  poly(A) binding protein, putative  34.25 
 
 		 210 aa  47  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0559902  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  33.98 
 
 		 98 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  33.98 
 
 		 98 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  38.75 
 
 		 99 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09671  RNA-binding protein RbpD  33.73 
 
 		 104 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 110 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0338  RNA-binding protein  36.84 
 
 		 160 aa  46.2  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  32.91 
 
 		 182 aa  46.6  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05240  mRNA catabolism, nonsense-mediated-related protein, putative  30.86 
 
 		 434 aa  46.6  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115659  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_5724  predicted protein  26.11 
 
 		 291 aa  46.2  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181544  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  32 
 
 		 176 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26255  predicted protein  29.87 
 
 		 870 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  25.93 
 
 		 552 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  31.51 
 
 		 152 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  34.41 
 
 		 97 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  32.5 
 
 		 162 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  34.44 
 
 		 89 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  35 
 
 		 102 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03072  RNA binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09620)  26.83 
 
 		 856 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.285465 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  41.18 
 
 		 76 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 90 aa  44.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  37.97 
 
 		 88 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34965  predicted protein  27.68 
 
 		 194 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.89638 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06850  RNA-binding protein rnp24, putative  22.36 
 
 		 449 aa  44.3  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  38.16 
 
 		 95 aa  44.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46145  predicted protein  32.93 
 
 		 393 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0356931  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  33.33 
 
 		 107 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3960  RNP-1 like RNA-binding protein  32.1 
 
 		 195 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000285938  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21039  predicted protein  25.1 
 
 		 246 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  28.77 
 
 		 132 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  32 
 
 		 149 aa  44.3  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  35.44 
 
 		 88 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  34.62 
 
 		 116 aa  44.3  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  29.33 
 
 		 150 aa  43.9  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  32.89 
 
 		 455 aa  43.5  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  29.17 
 
 		 134 aa  43.9  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  30.14 
 
 		 176 aa  43.5  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04346  ribosomal biogenesis protein Gar2 (AFU_orthologue; AFUA_4G06350)  27.62 
 
 		 445 aa  43.9  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.122582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  31.51 
 
 		 155 aa  43.9  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02130  single-stranded nucleic acid binding protein, putative  34.57 
 
 		 223 aa  43.5  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  31.46 
 
 		 245 aa  43.9  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  36.71 
 
 		 114 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_7191  predicted protein  46.43 
 
 		 217 aa  43.5  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.421608  normal  0.373889 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6046  RNP-1 like RNA-binding protein  32.56 
 
 		 124 aa  43.9  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  31.03 
 
 		 122 aa  43.5  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  33.33 
 
 		 109 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01160  polyadenylate-binding protein, putative  32 
 
 		 673 aa  43.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1139  RNA binding protein  30.3 
 
 		 129 aa  43.1  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000522116  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13095  predicted protein  35.14 
 
 		 97 aa  43.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  31.03 
 
 		 121 aa  42.7  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66642  negative growth regulatory protein  29.41 
 
 		 690 aa  42.7  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  37.04 
 
 		 94 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1009  glycine-rich RNA binding protein  30.3 
 
 		 128 aa  42.7  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000973374  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  37.04 
 
 		 94 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  28.77 
 
 		 151 aa  42.7  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4127  RNP-1 like RNA-binding protein  31.03 
 
 		 121 aa  42.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  34.18 
 
 		 87 aa  42.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  36.84 
 
 		 103 aa  42.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  31.25 
 
 		 115 aa  42.4  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4045  RNP-1 like RNA-binding protein  30.86 
 
 		 196 aa  42.4  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.847138 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  35.37 
 
 		 92 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84007  predicted protein  30.14 
 
 		 439 aa  42.4  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  35.37 
 
 		 92 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1645  RNA recognition motif-containing protein  32.05 
 
 		 95 aa  42.4  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>