126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_26255 on replicon NC_009364
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009364  OSTLU_26255  predicted protein  100 
 
 
870 aa  1763    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04330  ribosome biogenesis (Nop4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06250)  29.97 
 
 
724 aa  124  9e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01920  hypothetical protein  28.34 
 
 
999 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.446711  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90702  RNA recognition motif-containing protein  29.79 
 
 
694 aa  117  1.0000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  36.67 
 
 
524 aa  63.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.046271 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00421  Multiple RNA-binding domain-containing protein 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGA9]  25 
 
 
819 aa  63.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.857696  normal  0.9634 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86797  predicted protein  24.72 
 
 
838 aa  61.6  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_9858  predicted protein  41.33 
 
 
92 aa  61.2  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0809817  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  26.86 
 
 
441 aa  60.1  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06110  rRNA primary transcript binding protein, putative  28.48 
 
 
769 aa  58.9  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  26.97 
 
 
572 aa  56.6  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04000  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein)(PABP)(Polyadenylate tail-binding protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B630]  23.19 
 
 
732 aa  55.8  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.175791 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_710  predicted protein  22.87 
 
 
874 aa  55.8  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23959  predicted protein  24.57 
 
 
605 aa  55.5  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01160  polyadenylate-binding protein, putative  22.26 
 
 
673 aa  55.1  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2264  RNP-1 like RNA-binding protein  35.9 
 
 
101 aa  55.1  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683035  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20740  predicted protein  36.11 
 
 
837 aa  54.3  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478562  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
207 aa  53.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  38.36 
 
 
125 aa  52.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  32.93 
 
 
115 aa  52.8  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  30.77 
 
 
173 aa  52.4  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  37.5 
 
 
95 aa  51.6  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11941  peptidylprolyl isomerase  37.33 
 
 
97 aa  51.2  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  normal  0.27768 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  34.25 
 
 
90 aa  50.8  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  30.77 
 
 
196 aa  50.8  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  32.05 
 
 
202 aa  50.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12366  predicted protein  29.17 
 
 
106 aa  50.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  35.44 
 
 
250 aa  50.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  35.8 
 
 
90 aa  50.1  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  31.63 
 
 
102 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  35.44 
 
 
250 aa  50.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2194  RNP-1 like RNA-binding protein  27.85 
 
 
101 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31221  predicted protein  38.1 
 
 
727 aa  49.7  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.005519  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  34.25 
 
 
104 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0944  RNP-1 like RNA-binding protein  39.51 
 
 
117 aa  50.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06030  protein-nucleus import-related protein, putative  42.62 
 
 
563 aa  49.3  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  34.25 
 
 
90 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  38.36 
 
 
119 aa  49.3  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  35.44 
 
 
116 aa  49.7  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  34.25 
 
 
114 aa  48.9  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1139  RNA binding protein  27.45 
 
 
129 aa  48.9  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000522116  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  36 
 
 
89 aa  48.5  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  33.78 
 
 
122 aa  48.5  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85825  predicted protein  32.56 
 
 
271 aa  48.5  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.312279  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_8174  predicted protein  34.83 
 
 
98 aa  48.1  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.184967 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  28.21 
 
 
245 aa  48.5  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_8457  predicted protein  40.68 
 
 
59 aa  48.1  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  32 
 
 
97 aa  48.1  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  32.1 
 
 
90 aa  48.1  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  38.81 
 
 
88 aa  48.1  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  34.94 
 
 
632 aa  47.8  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0802  RNP-1 like RNA-binding protein  36.78 
 
 
89 aa  47.8  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209156 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  34.67 
 
 
76 aa  47.8  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03072  RNA binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09620)  24.34 
 
 
856 aa  47.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.285465 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  30.77 
 
 
90 aa  47  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  33.33 
 
 
114 aa  47.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 
88 aa  47.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46145  predicted protein  31.46 
 
 
393 aa  47.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0356931  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 
148 aa  47.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 
150 aa  47.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  40.32 
 
 
86 aa  47.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34381  predicted protein  24.35 
 
 
319 aa  47.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.693095  normal  0.168449 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  32.79 
 
 
89 aa  47.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10941  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein HRP1 (AFU_orthologue; AFUA_2G06090)  34.43 
 
 
559 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210274  normal  0.500661 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  29.11 
 
 
552 aa  47  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0321  hypothetical protein  29.11 
 
 
91 aa  46.2  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04060  conserved hypothetical protein  23.33 
 
 
615 aa  46.2  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.639663  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  31.51 
 
 
109 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  29.63 
 
 
104 aa  46.6  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  39.47 
 
 
87 aa  47  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  30.67 
 
 
105 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  32.05 
 
 
143 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  32.05 
 
 
82 aa  46.6  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 
132 aa  46.6  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  31.51 
 
 
152 aa  46.6  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  31.51 
 
 
149 aa  46.6  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  34.57 
 
 
146 aa  46.6  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45495  predicted protein  26.39 
 
 
155 aa  46.2  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal  0.923833 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0140  RNP-1-like RNA-binding protein  33.77 
 
 
152 aa  46.6  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000056681  normal  0.0664394 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  28.57 
 
 
112 aa  46.6  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4336  RNP-1-like RNA-binding protein  32.5 
 
 
155 aa  47  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000106713  hitchhiker  0.0000013394 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1009  glycine-rich RNA binding protein  27.84 
 
 
128 aa  47  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000973374  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  28.57 
 
 
107 aa  46.6  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  30.34 
 
 
97 aa  46.2  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16633  predicted protein  31.94 
 
 
81 aa  46.2  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  33.33 
 
 
107 aa  45.8  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  31.25 
 
 
176 aa  46.2  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43898  predicted protein  32.47 
 
 
173 aa  46.2  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00800465  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  31.25 
 
 
176 aa  45.8  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0980  RNA-binding region RNP-1  30.86 
 
 
81 aa  45.8  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.000651233  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  32.89 
 
 
134 aa  45.4  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  30 
 
 
151 aa  45.4  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  31.25 
 
 
123 aa  45.4  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  34.33 
 
 
88 aa  45.8  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  31.11 
 
 
110 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  31.51 
 
 
155 aa  45.8  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  32.5 
 
 
121 aa  45.8  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  36.84 
 
 
182 aa  45.4  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  37.35 
 
 
103 aa  45.4  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2980  RNP-1 like RNA-binding protein  30.77 
 
 
241 aa  45.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0728065  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>