145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_43898 on replicon NC_009374
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009374  OSTLU_43898  predicted protein  100 
 
 
173 aa  346  7e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00800465  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04290  20 kda nuclear cap binding protein (ncbp), putative  59.13 
 
 
195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00480591  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06142  small subunit of nuclear cap-binding protein complex (AFU_orthologue; AFUA_2G08570)  52.63 
 
 
185 aa  126  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.040408  normal  0.207556 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13520  predicted protein  48.03 
 
 
127 aa  126  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00556924  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37507  small subunit of the nuclear mRNA cap-binding protein complex CBC  43.52 
 
 
167 aa  97.8  7e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.201062  normal  0.0819638 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45495  predicted protein  35.14 
 
 
155 aa  58.5  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal  0.923833 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  33.33 
 
 
441 aa  57  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 
122 aa  55.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0944  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 
117 aa  53.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  36.36 
 
 
524 aa  53.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.046271 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  37.33 
 
 
207 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  36.49 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50467  predicted protein  28.74 
 
 
217 aa  52  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.446358  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9806  predicted protein  33.75 
 
 
195 aa  51.6  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.178893  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03760  hypothetical protein  33.33 
 
 
1121 aa  51.6  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38809  predicted protein  34.15 
 
 
319 aa  50.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000594517  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  36.84 
 
 
88 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04000  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein)(PABP)(Polyadenylate tail-binding protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B630]  34.44 
 
 
732 aa  49.7  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.175791 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  35.44 
 
 
477 aa  49.7  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2901  RNP-1 like RNA-binding protein  35.62 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0356  RNA recognition motif-containing protein  39.53 
 
 
103 aa  49.3  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0992503  normal  0.0823842 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  32 
 
 
572 aa  49.3  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  38.46 
 
 
88 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  31.08 
 
 
90 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02490  hypothetical protein  34.51 
 
 
287 aa  48.5  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.471511  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2980  RNP-1 like RNA-binding protein  28.32 
 
 
241 aa  48.5  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0728065  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01160  polyadenylate-binding protein, putative  32.22 
 
 
673 aa  48.5  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  27.38 
 
 
245 aa  48.5  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  28.09 
 
 
119 aa  48.1  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  27.03 
 
 
102 aa  48.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6420  predicted protein  32.53 
 
 
264 aa  48.1  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0177398  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  33.78 
 
 
94 aa  47.8  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  29.73 
 
 
104 aa  47.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3413  hypothetical protein  33.33 
 
 
83 aa  48.1  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.212369  normal  0.0411196 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  33.78 
 
 
87 aa  47.8  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  31.08 
 
 
109 aa  47.8  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1930  RNA-binding region RNP-1  33.33 
 
 
89 aa  47.8  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13095  predicted protein  28.05 
 
 
97 aa  47.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10276  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07120)  25.58 
 
 
138 aa  47  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.012473  normal  0.330154 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_8270  predicted protein  34.25 
 
 
84 aa  47.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 
91 aa  47.4  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2498  RNA binding protein  30.95 
 
 
107 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2883  putative RNA binding protein  30.77 
 
 
161 aa  47.4  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000182039  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39616  predicted protein  32.47 
 
 
269 aa  47  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.312591 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  32.43 
 
 
86 aa  47  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1615  RNP-1 like RNA-binding protein  34.72 
 
 
85 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00287143  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07350  translation initiation factor 4B (AFU_orthologue; AFUA_2G16400)  34.52 
 
 
497 aa  46.6  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628412  normal  0.665628 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  29.49 
 
 
182 aa  46.2  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2455  RNA recognition motif-containing protein  34.12 
 
 
105 aa  46.6  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0401  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 
92 aa  46.6  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000557638  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26255  predicted protein  32.47 
 
 
870 aa  46.2  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  29.73 
 
 
90 aa  46.2  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00421  Multiple RNA-binding domain-containing protein 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGA9]  30.59 
 
 
819 aa  45.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.857696  normal  0.9634 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51283  predicted protein  29.11 
 
 
328 aa  46.2  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06380  conserved hypothetical protein  29.59 
 
 
120 aa  45.8  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05240  mRNA catabolism, nonsense-mediated-related protein, putative  30.85 
 
 
434 aa  45.8  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115659  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  30.85 
 
 
101 aa  45.8  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  33.33 
 
 
82 aa  45.8  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  27.47 
 
 
632 aa  45.8  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1038  RNP-1 like RNA-binding protein  32.43 
 
 
98 aa  45.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  30.67 
 
 
104 aa  45.4  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  29.59 
 
 
102 aa  45.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  32.88 
 
 
95 aa  45.1  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 
89 aa  45.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  29.59 
 
 
102 aa  45.4  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  29.55 
 
 
115 aa  45.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  32.43 
 
 
99 aa  45.4  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03072  RNA binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09620)  29.73 
 
 
856 aa  45.1  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.285465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  32 
 
 
92 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  32 
 
 
92 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  31.08 
 
 
89 aa  45.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3920  RNA-binding protein  35.14 
 
 
78 aa  44.7  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256339  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  27.5 
 
 
455 aa  45.1  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23959  predicted protein  30.67 
 
 
605 aa  44.7  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1573  RNA recognition motif-containing protein  32.14 
 
 
112 aa  44.7  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55837  predicted protein  26.58 
 
 
453 aa  45.1  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.876442  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  28.38 
 
 
94 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1536  RNP-1 like RNA-binding protein  31.94 
 
 
104 aa  44.7  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.217942 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  28.38 
 
 
94 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  29.33 
 
 
95 aa  44.7  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04610  conserved hypothetical protein  30.67 
 
 
304 aa  44.7  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  25.68 
 
 
97 aa  44.7  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  29.73 
 
 
102 aa  44.7  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  34.25 
 
 
85 aa  44.3  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04505  RNA binding protein (Rbm8A), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03260)  31.71 
 
 
158 aa  44.3  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0453998  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  25 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  29.87 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09671  RNA-binding protein RbpD  32.43 
 
 
104 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11941  peptidylprolyl isomerase  29.47 
 
 
97 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  normal  0.27768 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  28.21 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  25 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0967  RNP-1 like RNA-binding protein  30.56 
 
 
221 aa  43.9  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191765  normal  0.616153 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06681  splicing factor u2af large subunit (AFU_orthologue; AFUA_7G05310)  28.95 
 
 
547 aa  43.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.502661 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1404  RNA-binding region RNP-1  32.88 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.187524  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  28.38 
 
 
143 aa  43.5  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0802  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
89 aa  43.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209156 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  30 
 
 
176 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  29.73 
 
 
112 aa  43.5  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  30 
 
 
176 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>