235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_9806 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_9806  predicted protein  100 
 
 
195 aa  395  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.178893  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_7191  predicted protein  41.41 
 
 
217 aa  132  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.421608  normal  0.373889 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06903  U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa (AFU_orthologue; AFUA_5G13480)  40.1 
 
 
373 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.1198  normal  0.976226 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01270  U1 snRNP 70K protein (short form), putative  53.76 
 
 
429 aa  96.3  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32340  predicted protein  32.32 
 
 
314 aa  93.2  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.46857  normal  0.27086 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  35 
 
 
116 aa  68.2  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  34.15 
 
 
477 aa  60.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  32.1 
 
 
107 aa  60.8  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  32.1 
 
 
112 aa  60.8  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  35.9 
 
 
245 aa  60.5  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  31.25 
 
 
455 aa  58.5  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16633  predicted protein  37.5 
 
 
81 aa  58.5  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  35.06 
 
 
114 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  30.77 
 
 
102 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  35.14 
 
 
98 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  34.62 
 
 
157 aa  56.6  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  32.47 
 
 
108 aa  56.6  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.200874 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  29.79 
 
 
115 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  30.77 
 
 
102 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01940  conserved hypothetical protein  37.5 
 
 
480 aa  56.2  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  36.49 
 
 
86 aa  56.2  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 
104 aa  56.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  33.33 
 
 
162 aa  55.8  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  32.43 
 
 
114 aa  55.5  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  32 
 
 
125 aa  55.1  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  33.77 
 
 
82 aa  55.1  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  31.58 
 
 
95 aa  54.7  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  32.47 
 
 
99 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8830  predicted protein  34.25 
 
 
122 aa  54.7  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0913376 
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  35.56 
 
 
97 aa  54.7  0.0000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_3507  predicted protein  35.9 
 
 
330 aa  54.7  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.22649 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  35.14 
 
 
111 aa  53.9  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  30.93 
 
 
119 aa  54.3  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  35.14 
 
 
101 aa  54.3  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1603  RNP-1 like RNA-binding protein  36.84 
 
 
103 aa  54.3  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.799719 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03953  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08040)  33.33 
 
 
353 aa  53.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.748027  normal  0.180065 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  33.78 
 
 
441 aa  53.1  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42828  predicted protein  40.68 
 
 
499 aa  53.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  35.14 
 
 
90 aa  53.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  33.78 
 
 
102 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86797  predicted protein  35.29 
 
 
838 aa  53.9  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  30.77 
 
 
155 aa  52.8  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01517  nucleic acid-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05260)  33.33 
 
 
450 aa  52.8  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000597445  normal  0.366843 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1324  RNA-binding protein  36.84 
 
 
107 aa  53.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  31.08 
 
 
88 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  36.49 
 
 
109 aa  53.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  35 
 
 
81 aa  53.1  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  33.78 
 
 
97 aa  52.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  30.77 
 
 
149 aa  53.1  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  33.78 
 
 
95 aa  53.1  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43898  predicted protein  33.75 
 
 
173 aa  52.4  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00800465  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  30.77 
 
 
176 aa  52.4  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1566  RNA recognition motif-containing protein  35.42 
 
 
184 aa  52.4  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.306612  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2673  RNP-1 like RNA-binding protein  33.78 
 
 
90 aa  52.4  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  30.77 
 
 
176 aa  52.4  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  34.25 
 
 
76 aa  52.4  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 
92 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 
92 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2194  RNP-1 like RNA-binding protein  43.06 
 
 
101 aa  52  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND05240  mRNA catabolism, nonsense-mediated-related protein, putative  31.51 
 
 
434 aa  52  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115659  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  29.73 
 
 
182 aa  52  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  32.43 
 
 
143 aa  52  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  29.49 
 
 
152 aa  52  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0401  RNP-1 like RNA-binding protein  35.14 
 
 
92 aa  51.6  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000557638  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  29.49 
 
 
121 aa  51.6  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0124  RNP-1 like RNA-binding protein  38.36 
 
 
94 aa  51.6  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000291811  decreased coverage  0.0000109119 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  32.43 
 
 
90 aa  51.6  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1009  glycine-rich RNA binding protein  32.91 
 
 
128 aa  51.6  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000973374  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  35.14 
 
 
90 aa  51.6  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9701  predicted protein  28.4 
 
 
125 aa  51.6  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0352  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
109 aa  51.2  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0296626  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1139  RNA binding protein  32.1 
 
 
129 aa  51.2  0.000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000522116  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  29.49 
 
 
151 aa  51.2  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  32.47 
 
 
89 aa  51.2  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4127  RNP-1 like RNA-binding protein  29.49 
 
 
121 aa  51.2  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  30.77 
 
 
175 aa  51.2  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55837  predicted protein  32.39 
 
 
453 aa  50.4  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.876442  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  35.14 
 
 
90 aa  50.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 
89 aa  50.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_5724  predicted protein  30.56 
 
 
291 aa  50.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181544  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  29.49 
 
 
148 aa  50.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  29.49 
 
 
150 aa  51.2  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  31.17 
 
 
110 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06501  splicing factor 3b subunit 4 (AFU_orthologue; AFUA_6G05180)  32.56 
 
 
352 aa  50.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  29.73 
 
 
85 aa  50.1  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  36.36 
 
 
94 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  30.77 
 
 
373 aa  50.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  29.49 
 
 
181 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  36.36 
 
 
94 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1038  RNP-1 like RNA-binding protein  31.17 
 
 
98 aa  49.7  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  35.14 
 
 
90 aa  50.4  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23959  predicted protein  31.13 
 
 
605 aa  50.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  28.21 
 
 
134 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13520  predicted protein  30.11 
 
 
127 aa  50.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00556924  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  28.21 
 
 
123 aa  50.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  29.49 
 
 
132 aa  50.1  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09095  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 4 (PPIase)(Rotamase)(EC 5.2.1.8) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ARI5]  29.52 
 
 
461 aa  49.7  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.844465 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03870  transformer-2-beta isoform 3, putative  33.33 
 
 
277 aa  49.3  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  28.38 
 
 
91 aa  49.3  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2518  RNP-1-like RNA-binding protein  33.78 
 
 
85 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0020786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>