More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1525 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  100 
 
 
92 aa  190  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  100 
 
 
92 aa  190  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  76.6 
 
 
94 aa  141  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  76.6 
 
 
94 aa  141  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  68.09 
 
 
102 aa  135  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  74.39 
 
 
103 aa  131  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  74.39 
 
 
103 aa  131  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  73.17 
 
 
109 aa  131  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  73.17 
 
 
103 aa  131  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  66.32 
 
 
98 aa  130  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  66.32 
 
 
98 aa  130  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  73.17 
 
 
102 aa  130  6.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  71.95 
 
 
111 aa  129  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  71.76 
 
 
105 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  70.37 
 
 
97 aa  127  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  68.82 
 
 
99 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  70.93 
 
 
94 aa  126  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  65.96 
 
 
99 aa  125  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  68.54 
 
 
101 aa  125  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  67.07 
 
 
104 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  70.24 
 
 
99 aa  123  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  64.77 
 
 
89 aa  122  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4642  RNA-binding region RNP-1  72.62 
 
 
102 aa  120  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0167628  normal  0.0600558 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  61.22 
 
 
98 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  64.52 
 
 
96 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  67.09 
 
 
90 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  60.71 
 
 
110 aa  116  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0679  RNA-binding region RNP-1  74.07 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1118  RNP-1 like RNA-binding protein  66.67 
 
 
101 aa  114  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.761285  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4357  RNP-1 like RNA-binding protein  58.95 
 
 
97 aa  110  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  62.2 
 
 
95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09671  RNA-binding protein RbpD  55.42 
 
 
104 aa  103  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11941  peptidylprolyl isomerase  51.11 
 
 
97 aa  100  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  normal  0.27768 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2851  RNP-1 like RNA-binding protein  63.16 
 
 
97 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19341  hypothetical protein  54.88 
 
 
82 aa  100  9e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.39481  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1059  RNA recognition motif-containing protein  54.88 
 
 
82 aa  100  9e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1404  RNA-binding region RNP-1  55.7 
 
 
95 aa  97.8  5e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.187524  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1499  RNA-binding region RNP-1  46.67 
 
 
100 aa  97.1  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212691  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  55 
 
 
114 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1510  RNA recognition motif-containing protein  50 
 
 
81 aa  95.1  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.206818  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1645  RNA recognition motif-containing protein  54.43 
 
 
95 aa  95.1  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  52.5 
 
 
250 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  52.5 
 
 
250 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  53.75 
 
 
196 aa  92  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  53.16 
 
 
162 aa  91.7  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  48.31 
 
 
157 aa  91.7  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  51.25 
 
 
245 aa  91.7  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  52.5 
 
 
137 aa  90.9  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0980  RNA-binding region RNP-1  48.75 
 
 
81 aa  90.1  8e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.000651233  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  52.5 
 
 
222 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00121  RNA recognition motif-containing protein  52.5 
 
 
217 aa  89.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.044748  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  56.25 
 
 
95 aa  88.6  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  50.62 
 
 
82 aa  89  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  51.25 
 
 
202 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  52.5 
 
 
222 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00121  RNA recognition motif-containing protein  51.9 
 
 
203 aa  88.2  3e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.3683  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  50 
 
 
173 aa  88.6  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0944  RNP-1 like RNA-binding protein  54.43 
 
 
117 aa  87.8  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  53.75 
 
 
146 aa  87.4  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15501  RNA-binding protein RbpD  44.32 
 
 
96 aa  87.4  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  51.9 
 
 
102 aa  87  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  51.9 
 
 
102 aa  87  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  49.38 
 
 
89 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  49.38 
 
 
90 aa  86.3  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  52.5 
 
 
87 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  44.71 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.200874 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  52.44 
 
 
116 aa  85.9  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  52.44 
 
 
85 aa  85.5  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  51.9 
 
 
122 aa  85.5  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  48.75 
 
 
140 aa  84.3  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  48.1 
 
 
149 aa  84  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  51.9 
 
 
107 aa  84  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  48.1 
 
 
175 aa  84  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  53.16 
 
 
89 aa  84  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  48.1 
 
 
155 aa  84  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  48.1 
 
 
104 aa  83.6  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  48.1 
 
 
181 aa  83.6  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  49.37 
 
 
132 aa  83.6  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  49.37 
 
 
151 aa  83.6  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  48.75 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  48.75 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  53.16 
 
 
115 aa  83.6  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1038  RNP-1 like RNA-binding protein  49.46 
 
 
98 aa  83.2  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  49.37 
 
 
134 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  48.1 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  52.5 
 
 
87 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  50 
 
 
123 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6046  RNP-1 like RNA-binding protein  50.63 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35961  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  45.65 
 
 
114 aa  82.8  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  52.5 
 
 
88 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  51.95 
 
 
91 aa  82  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2631  RNA-binding region RNP-1  48.15 
 
 
134 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000024713  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  48.1 
 
 
176 aa  82  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  51.9 
 
 
86 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2264  RNP-1 like RNA-binding protein  47.56 
 
 
101 aa  81.3  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683035  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  53.16 
 
 
88 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  47.5 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4127  RNP-1 like RNA-binding protein  47.5 
 
 
121 aa  80.5  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  54.67 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  45.12 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>