281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0124 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0124  RNP-1 like RNA-binding protein  100 
 
 
94 aa  188  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000291811  decreased coverage  0.0000109119 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1603  RNP-1 like RNA-binding protein  66.67 
 
 
103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0191  RNP-1 like RNA-binding protein  55.56 
 
 
87 aa  90.9  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000794742  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2518  RNP-1-like RNA-binding protein  52.5 
 
 
85 aa  90.1  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0020786  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  53.16 
 
 
91 aa  90.1  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  58.11 
 
 
81 aa  89.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  53.49 
 
 
87 aa  89  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  50.6 
 
 
87 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  51.19 
 
 
88 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  50.6 
 
 
85 aa  87.4  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  47.13 
 
 
88 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0401  RNP-1 like RNA-binding protein  51.9 
 
 
92 aa  87  8e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000557638  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  53.01 
 
 
125 aa  85.9  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  48.81 
 
 
88 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  46.91 
 
 
88 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2964  RNP-1 like RNA-binding protein  50 
 
 
88 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2264  RNP-1 like RNA-binding protein  50.59 
 
 
101 aa  84.3  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683035  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  48.05 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  47.62 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3309  RNP-1 like RNA-binding protein  50.63 
 
 
82 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788689  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  47.56 
 
 
83 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1038  RNP-1 like RNA-binding protein  44.44 
 
 
98 aa  82.8  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1867  RNP1-like RNA-binding protein  47.13 
 
 
89 aa  82  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000148151  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  44.94 
 
 
90 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  47.62 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  47.44 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  54.43 
 
 
95 aa  78.6  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  48.91 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  44.58 
 
 
82 aa  77.4  0.00000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  43.96 
 
 
115 aa  77  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  45.16 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  51.32 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  51.32 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  46.81 
 
 
97 aa  75.5  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  49.4 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  47.62 
 
 
104 aa  75.5  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  51.32 
 
 
121 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4127  RNP-1 like RNA-binding protein  51.32 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  51.32 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  51.32 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  51.32 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  45.78 
 
 
86 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  51.32 
 
 
181 aa  73.9  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  51.32 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  50 
 
 
132 aa  73.6  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  51.32 
 
 
175 aa  73.6  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  50 
 
 
148 aa  73.6  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  51.32 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0338  RNA-binding protein  39.74 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  50 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  48.68 
 
 
134 aa  73.6  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  51.32 
 
 
151 aa  73.6  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  46.99 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  44.44 
 
 
114 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  42.7 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0614  RNP-1 like RNA-binding protein  46.15 
 
 
101 aa  72  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000129522  hitchhiker  0.00000043788 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  42.22 
 
 
101 aa  72.4  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  42.7 
 
 
116 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2194  RNP-1 like RNA-binding protein  43.37 
 
 
101 aa  71.6  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6046  RNP-1 like RNA-binding protein  48.19 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35961  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1761  RNP-1 like RNA-binding protein  41.98 
 
 
96 aa  71.2  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000106406  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  43.21 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0790  RNA-binding region RNP-1  39.36 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.188882 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  45 
 
 
108 aa  70.5  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.200874 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  50 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  49.38 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  41.86 
 
 
114 aa  69.7  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  41.3 
 
 
94 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  41.3 
 
 
94 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0637  RNP-1 like RNA-binding protein  38.55 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  42.68 
 
 
109 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  44.19 
 
 
94 aa  67.4  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  43.9 
 
 
122 aa  67.4  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  43.53 
 
 
207 aa  67  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  42.42 
 
 
99 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  41.49 
 
 
99 aa  67  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  43.53 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  43.53 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  43.9 
 
 
103 aa  66.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  42.5 
 
 
103 aa  66.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  40.86 
 
 
90 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
90 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  37.74 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  48.65 
 
 
441 aa  65.9  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  45.05 
 
 
92 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  42.68 
 
 
89 aa  65.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  42.68 
 
 
102 aa  65.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  45.05 
 
 
92 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  42.35 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  44.19 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  41.94 
 
 
90 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  43.9 
 
 
102 aa  65.5  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  38.46 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3413  hypothetical protein  38.27 
 
 
83 aa  64.7  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.212369  normal  0.0411196 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0195  RNA-binding protein  34.48 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237988  normal  0.0118199 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  43.16 
 
 
102 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  42.39 
 
 
99 aa  64.3  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  39.08 
 
 
96 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  43.16 
 
 
102 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  39.47 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>