222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_5724 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009357  OSTLU_5724  predicted protein  100 
 
 
291 aa  590  1e-168  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181544  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11145  predicted protein  39.31 
 
 
325 aa  189  2.9999999999999997e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.860159  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01250  rRNA primary transcript binding protein, putative  37.16 
 
 
651 aa  181  1e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06681  splicing factor u2af large subunit (AFU_orthologue; AFUA_7G05310)  31.56 
 
 
547 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.502661 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  41.38 
 
 
373 aa  70.1  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04665  hypothetical protein  44.44 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0330259  normal  0.410978 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38809  predicted protein  27.32 
 
 
319 aa  63.5  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000594517  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  37.66 
 
 
143 aa  63.2  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  39.47 
 
 
114 aa  62.4  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0300  RNA-binding region RNP-1  33.64 
 
 
145 aa  62  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_7602  predicted protein  27.46 
 
 
161 aa  62  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4708  RNP-1 like RNA-binding protein  35 
 
 
156 aa  61.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000908664  normal  0.0456447 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0140  RNP-1-like RNA-binding protein  35 
 
 
152 aa  61.2  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000056681  normal  0.0664394 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2393  RNA recognition motif-containing protein  35.05 
 
 
143 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  37.97 
 
 
86 aa  61.6  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0233  RNA-binding protein  36.71 
 
 
149 aa  60.8  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540695  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4336  RNP-1-like RNA-binding protein  35 
 
 
155 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000106713  hitchhiker  0.0000013394 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  24.91 
 
 
572 aa  61.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3508  RNP-1 like RNA-binding protein  35.63 
 
 
153 aa  60.1  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482673  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  37.33 
 
 
114 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  33.33 
 
 
116 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
88 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  37.33 
 
 
82 aa  58.9  0.00000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8830  predicted protein  34.62 
 
 
122 aa  58.9  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0913376 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4176  RNP-1 like RNA-binding protein  34.48 
 
 
154 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433028  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04610  conserved hypothetical protein  26.23 
 
 
304 aa  58.9  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0182  RNP-1 like RNA-binding protein  34.48 
 
 
154 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000432928  hitchhiker  0.00837192 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0166  RNP-1 like RNA-binding protein  33.75 
 
 
151 aa  58.5  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000221523  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  32.22 
 
 
115 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0178  RNP-1 like RNA-binding protein  34.48 
 
 
154 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000203464  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 
104 aa  58.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4074  RNP-1 like RNA-binding protein  34.48 
 
 
154 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000591995  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0195  RNA-binding protein  36.71 
 
 
151 aa  58.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237988  normal  0.0118199 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07456  pre-mRNA branch site protein p14, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05960)  38.04 
 
 
172 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0991569 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0208  RNA-binding protein  33.33 
 
 
154 aa  57.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0180  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
154 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000725181  normal  0.749946 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0175  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
154 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000046912  hitchhiker  0.00946838 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  33.75 
 
 
147 aa  57.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000340315  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0181  RNP-1-like RNA-binding protein  33.33 
 
 
154 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814275  normal  0.581259 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  35.71 
 
 
87 aa  57.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84754  predicted protein  26.95 
 
 
246 aa  57  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.345333 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  24.05 
 
 
441 aa  57  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34965  predicted protein  22.79 
 
 
194 aa  57  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.89638 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  36.11 
 
 
88 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 
88 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0338  RNA-binding protein  35.44 
 
 
160 aa  55.8  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1603  RNP-1 like RNA-binding protein  31.76 
 
 
103 aa  55.8  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  27.85 
 
 
125 aa  55.8  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  30.77 
 
 
134 aa  55.8  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  24.39 
 
 
552 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3413  hypothetical protein  35.8 
 
 
83 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.212369  normal  0.0411196 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 
88 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00255  RNA binding protein  32.56 
 
 
226 aa  54.7  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12693  predicted protein  27.39 
 
 
151 aa  54.7  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689101  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2340  RNA-binding protein  37.33 
 
 
152 aa  54.3  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000791168  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2883  putative RNA binding protein  31.4 
 
 
161 aa  54.3  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000182039  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  30.68 
 
 
157 aa  53.9  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_7586  predicted protein  30.56 
 
 
150 aa  54.3  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.561304  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42828  predicted protein  33.78 
 
 
499 aa  53.5  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  28.21 
 
 
148 aa  53.5  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  28.21 
 
 
150 aa  53.5  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21039  predicted protein  29.87 
 
 
246 aa  53.1  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  29.49 
 
 
176 aa  53.1  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_27034  predicted protein  36.07 
 
 
252 aa  53.1  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.64186  normal  0.132821 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20857  predicted protein  23.45 
 
 
687 aa  53.1  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.821409  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4015  RNA-binding region RNP-1  33.33 
 
 
151 aa  53.1  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000301969  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  28.21 
 
 
132 aa  53.1  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46145  predicted protein  34.48 
 
 
393 aa  52.8  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0356931  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2264  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
101 aa  52.8  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683035  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9701  predicted protein  29.63 
 
 
125 aa  52.4  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6046  RNP-1 like RNA-binding protein  29.87 
 
 
124 aa  52.4  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35961  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23959  predicted protein  24.68 
 
 
605 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86797  predicted protein  27.75 
 
 
838 aa  51.6  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 
88 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  33.77 
 
 
107 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51283  predicted protein  26.19 
 
 
328 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9806  predicted protein  30.56 
 
 
195 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.178893  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26631  RNA recognition motif-containing protein  30.86 
 
 
147 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 
95 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1536  RNP-1 like RNA-binding protein  34.18 
 
 
104 aa  50.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.217942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2980  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0728065  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04060  conserved hypothetical protein  23.58 
 
 
615 aa  51.2  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.639663  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  34.67 
 
 
86 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33658  predicted protein  25.74 
 
 
380 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.216905  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  27.27 
 
 
155 aa  51.2  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1009  glycine-rich RNA binding protein  34.78 
 
 
128 aa  51.2  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000973374  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  27.27 
 
 
149 aa  51.2  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  26.92 
 
 
175 aa  50.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
90 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1139  RNA binding protein  34.78 
 
 
129 aa  50.8  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000522116  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  25 
 
 
477 aa  50.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2964  RNP-1 like RNA-binding protein  34.57 
 
 
88 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  26.92 
 
 
181 aa  50.4  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  34.67 
 
 
146 aa  50.4  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80765  predicted protein  37.8 
 
 
271 aa  50.8  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.547807  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  26.92 
 
 
176 aa  50.4  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  26.92 
 
 
152 aa  50.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  32 
 
 
108 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.200874 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  28.57 
 
 
121 aa  50.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1038  RNP-1 like RNA-binding protein  31.4 
 
 
98 aa  50.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>