127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_27034 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_27034  predicted protein  100 
 
 
252 aa  500  1e-140  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.64186  normal  0.132821 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04346  ribosomal biogenesis protein Gar2 (AFU_orthologue; AFUA_4G06350)  45.33 
 
 
445 aa  157  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.122582  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05560  ribosomal large subunit biogenesis-related protein, putative  40.28 
 
 
479 aa  138  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_7586  predicted protein  40.85 
 
 
150 aa  122  8e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.561304  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45356  predicted protein  31.12 
 
 
479 aa  69.7  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.486955  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  35.62 
 
 
373 aa  60.5  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04665  hypothetical protein  27.78 
 
 
279 aa  59.7  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0330259  normal  0.410978 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
88 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  34.72 
 
 
88 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_5724  predicted protein  35.48 
 
 
291 aa  52.4  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181544  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1139  RNA binding protein  44.68 
 
 
129 aa  52.8  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000522116  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1009  glycine-rich RNA binding protein  44.68 
 
 
128 aa  52.8  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000973374  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  31.65 
 
 
86 aa  52  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  37.5 
 
 
82 aa  51.6  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68431  predicted protein  36.14 
 
 
481 aa  51.6  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.326918  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  32.86 
 
 
176 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  34.72 
 
 
88 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  37.1 
 
 
90 aa  50.8  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  32.35 
 
 
148 aa  49.7  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03577  RNA-binding protein  42.62 
 
 
154 aa  49.7  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000014599  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  36.07 
 
 
99 aa  49.7  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  32.35 
 
 
150 aa  49.7  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  38.33 
 
 
90 aa  49.7  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  40.98 
 
 
90 aa  48.9  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2673  RNP-1 like RNA-binding protein  37.1 
 
 
90 aa  48.9  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0166  RNP-1 like RNA-binding protein  43.48 
 
 
151 aa  48.9  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000221523  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  30.65 
 
 
115 aa  48.9  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0208  RNA-binding protein  41.3 
 
 
154 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  35.09 
 
 
89 aa  48.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  32.86 
 
 
137 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48043  predicted protein  23.29 
 
 
233 aa  48.1  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111526  normal  0.12113 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0140  RNP-1-like RNA-binding protein  37.31 
 
 
152 aa  48.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000056681  normal  0.0664394 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8830  predicted protein  23.91 
 
 
122 aa  48.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0913376 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  30 
 
 
114 aa  48.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2883  putative RNA binding protein  32.31 
 
 
161 aa  48.5  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000182039  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2964  RNP-1 like RNA-binding protein  31.94 
 
 
88 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  25.93 
 
 
441 aa  47.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0180  RNP-1 like RNA-binding protein  41.3 
 
 
154 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000725181  normal  0.749946 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0175  RNP-1 like RNA-binding protein  41.3 
 
 
154 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000046912  hitchhiker  0.00946838 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0181  RNP-1-like RNA-binding protein  41.3 
 
 
154 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814275  normal  0.581259 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  32.26 
 
 
116 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  39.13 
 
 
123 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  34.72 
 
 
88 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4176  RNP-1 like RNA-binding protein  41.3 
 
 
154 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433028  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3508  RNP-1 like RNA-binding protein  41.3 
 
 
153 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482673  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0178  RNP-1 like RNA-binding protein  41.3 
 
 
154 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000203464  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0182  RNP-1 like RNA-binding protein  41.3 
 
 
154 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000432928  hitchhiker  0.00837192 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
87 aa  47.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4074  RNP-1 like RNA-binding protein  41.3 
 
 
154 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000591995  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  33.33 
 
 
151 aa  47  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  30 
 
 
143 aa  47.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  32.26 
 
 
122 aa  47  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4336  RNP-1-like RNA-binding protein  41.3 
 
 
155 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000106713  hitchhiker  0.0000013394 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4708  RNP-1 like RNA-binding protein  41.3 
 
 
156 aa  47  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000908664  normal  0.0456447 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0093  RNP-1 like RNA-binding protein  37.1 
 
 
90 aa  47  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  36.07 
 
 
90 aa  47  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  31.94 
 
 
90 aa  47  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04870  conserved hypothetical protein  36.36 
 
 
504 aa  46.6  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.393554  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0233  RNA-binding protein  39.13 
 
 
149 aa  46.6  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540695  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  27.78 
 
 
89 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  32.35 
 
 
149 aa  46.6  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  28.57 
 
 
162 aa  46.2  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  37.7 
 
 
95 aa  46.2  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  32.26 
 
 
132 aa  46.2  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  32.26 
 
 
152 aa  46.2  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  39.13 
 
 
121 aa  46.2  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  32.26 
 
 
181 aa  46.2  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  29.58 
 
 
76 aa  46.2  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  26.39 
 
 
99 aa  45.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  39.13 
 
 
147 aa  45.8  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000340315  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0195  RNA-binding protein  36.96 
 
 
151 aa  45.8  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237988  normal  0.0118199 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4127  RNP-1 like RNA-binding protein  39.13 
 
 
121 aa  45.8  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9701  predicted protein  25.26 
 
 
125 aa  46.2  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  26.39 
 
 
90 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  30.88 
 
 
175 aa  45.8  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  33.87 
 
 
155 aa  45.8  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04610  conserved hypothetical protein  31.13 
 
 
304 aa  45.4  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  30.65 
 
 
146 aa  45.4  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  33.87 
 
 
134 aa  45.4  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  30.88 
 
 
176 aa  45.4  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_5424  predicted protein  34.57 
 
 
154 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6046  RNP-1 like RNA-binding protein  36.17 
 
 
124 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35961  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  29.31 
 
 
83 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  36.07 
 
 
90 aa  45.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42828  predicted protein  29.23 
 
 
499 aa  44.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  30.11 
 
 
552 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0338  RNA-binding protein  34.69 
 
 
160 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3437  RNP-1 like RNA-binding protein  31.08 
 
 
158 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369251 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  29.17 
 
 
85 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2393  RNA recognition motif-containing protein  30.14 
 
 
143 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_8445  predicted protein  23.81 
 
 
67 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2264  RNP-1 like RNA-binding protein  31.94 
 
 
101 aa  44.3  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683035  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  30.65 
 
 
140 aa  43.9  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0802  RNP-1 like RNA-binding protein  30.99 
 
 
89 aa  43.9  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209156 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44112  predicted protein  31.17 
 
 
234 aa  44.3  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.446358  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32340  predicted protein  41.67 
 
 
314 aa  44.3  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.46857  normal  0.27086 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38809  predicted protein  29.52 
 
 
319 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000594517  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2340  RNA-binding protein  31.15 
 
 
152 aa  44.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000791168  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  31.94 
 
 
90 aa  44.3  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  34.43 
 
 
89 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>