71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_33658 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_33658  predicted protein  100 
 
 		 380 aa  793    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.216905  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  32.56 
 
 		 125 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  33.72 
 
 		 143 aa  54.7  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  33.75 
 
 		 115 aa  53.1  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_5724  predicted protein  26 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181544  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  30.95 
 
 		 373 aa  50.1  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46145  predicted protein  30.93 
 
 		 393 aa  49.7  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0356931  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1009  glycine-rich RNA binding protein  29.35 
 
 		 128 aa  48.9  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000973374  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3508  RNP-1 like RNA-binding protein  29.55 
 
 		 153 aa  48.9  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482673  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2980  RNP-1 like RNA-binding protein  30.95 
 
 		 241 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0728065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1139  RNA binding protein  29.35 
 
 		 129 aa  48.9  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000522116  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0208  RNA-binding protein  30.23 
 
 		 154 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  32.56 
 
 		 114 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  31.4 
 
 		 114 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3437  RNP-1 like RNA-binding protein  34.29 
 
 		 158 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369251 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  32.5 
 
 		 116 aa  47.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38809  predicted protein  30.69 
 
 		 319 aa  47.8  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000594517  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  31.76 
 
 		 552 aa  47.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.373895 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04665  hypothetical protein  32.14 
 
 		 279 aa  47.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0330259  normal  0.410978 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0233  RNA-binding protein  30.25 
 
 		 149 aa  47  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540695  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0175  RNP-1 like RNA-binding protein  32.29 
 
 		 154 aa  46.6  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000046912  hitchhiker  0.00946838 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0180  RNP-1 like RNA-binding protein  32.29 
 
 		 154 aa  46.6  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000725181  normal  0.749946 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0181  RNP-1-like RNA-binding protein  32.29 
 
 		 154 aa  46.6  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814275  normal  0.581259 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  32.1 
 
 		 122 aa  46.2  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4015  RNA-binding region RNP-1  28.57 
 
 		 151 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000301969  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  32.1 
 
 		 123 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  32.1 
 
 		 148 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  32.1 
 
 		 150 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0790  RNA-binding region RNP-1  30 
 
 		 142 aa  45.8  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.188882 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0182  RNP-1 like RNA-binding protein  31.25 
 
 		 154 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000432928  hitchhiker  0.00837192 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  26.83 
 
 		 250 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  29.55 
 
 		 157 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0178  RNP-1 like RNA-binding protein  31.25 
 
 		 154 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000203464  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  31.71 
 
 		 196 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4074  RNP-1 like RNA-binding protein  31.25 
 
 		 154 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000591995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4176  RNP-1 like RNA-binding protein  31.25 
 
 		 154 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433028  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  26.83 
 
 		 250 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  32.1 
 
 		 132 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  33.71 
 
 		 147 aa  45.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000340315  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  32.1 
 
 		 134 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  30.12 
 
 		 222 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  32.1 
 
 		 181 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  30.86 
 
 		 121 aa  44.3  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  32.1 
 
 		 152 aa  44.3  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  28.41 
 
 		 122 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0321  hypothetical protein  35.29 
 
 		 91 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  30.86 
 
 		 162 aa  44.3  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00121  RNA recognition motif-containing protein  30.12 
 
 		 217 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.044748  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13402  predicted protein  30.77 
 
 		 117 aa  43.9  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  30.12 
 
 		 222 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0195  RNA-binding protein  31.58 
 
 		 151 aa  43.9  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237988  normal  0.0118199 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  32.1 
 
 		 90 aa  43.9  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  28.92 
 
 		 146 aa  43.9  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  28.92 
 
 		 245 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3413  hypothetical protein  40.35 
 
 		 83 aa  43.9  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.212369  normal  0.0411196 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4127  RNP-1 like RNA-binding protein  30.86 
 
 		 121 aa  43.9  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  26.92 
 
 		 524 aa  43.5  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.046271 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  29.89 
 
 		 104 aa  43.5  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3300  RNA-binding region RNP-1  31.33 
 
 		 166 aa  43.5  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.181276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  32.1 
 
 		 151 aa  43.5  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_25920  predicted protein  26.05 
 
 		 424 aa  43.5  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0604247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49387  predicted protein  30.53 
 
 		 330 aa  43.5  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.452318  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  30.86 
 
 		 149 aa  43.5  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10941  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein HRP1 (AFU_orthologue; AFUA_2G06090)  32.35 
 
 		 559 aa  43.1  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210274  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12693  predicted protein  27.5 
 
 		 151 aa  43.1  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689101  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  35.37 
 
 		 88 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4264  RNP-1 like RNA-binding protein  29.41 
 
 		 155 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  29.63 
 
 		 176 aa  42.7  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  30.86 
 
 		 155 aa  42.7  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4324  RNP-1 like RNA-binding protein  29.41 
 
 		 155 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000014654  normal  0.0291528 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  28.4 
 
 		 176 aa  42.7  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>