261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4324 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4324  RNP-1 like RNA-binding protein  100 
 
 		 155 aa  317  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000014654  normal  0.0291528 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4264  RNP-1 like RNA-binding protein  100 
 
 		 155 aa  317  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1013  RNP-1 like RNA-binding protein  68.67 
 
 		 164 aa  219  8e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000334324 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4552  RNP-1 like RNA-binding protein  50 
 
 		 165 aa  167  7e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3300  RNA-binding region RNP-1  51.48 
 
 		 166 aa  166  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.181276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4005  RNA-binding region RNP-1  53.46 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.776629  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3437  RNP-1 like RNA-binding protein  53.16 
 
 		 158 aa  147  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369251 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0790  RNA-binding region RNP-1  46.79 
 
 		 142 aa  130  5e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.188882 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26631  RNA recognition motif-containing protein  34 
 
 		 147 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2393  RNA recognition motif-containing protein  35.33 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01571  RNA recognition motif-containing protein  34.84 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0300  RNA-binding region RNP-1  35.06 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1508  RNA recognition motif-containing protein  33.77 
 
 		 143 aa  86.3  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02141  RNA recognition motif-containing protein  31.17 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0144  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  32.47 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01591  RNA recognition motif-containing protein  31.17 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0697874  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01611  RNA recognition motif-containing protein  31.17 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.950946  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  42.86 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01701  RNA recognition motif-containing protein  30.82 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.246938  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  42.5 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0338  RNA-binding protein  37.78 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2883  putative RNA binding protein  38.89 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000182039  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  37.35 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  39.08 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1761  RNP-1 like RNA-binding protein  40.51 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000106406  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  42.17 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  36.78 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  40 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  40.74 
 
 		 83 aa  63.9  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  40.74 
 
 		 222 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  42.5 
 
 		 81 aa  63.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0191  RNP-1 like RNA-binding protein  41.77 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000794742  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  37.04 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  39.76 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2340  RNA-binding protein  39.47 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000791168  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  44.3 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4357  RNP-1 like RNA-binding protein  40.51 
 
 		 97 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  40.51 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  41.25 
 
 		 90 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  39.02 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  39.02 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  40.24 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  39.02 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  37.8 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  38.27 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  34.94 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  39.02 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  39.02 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  38.27 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2518  RNP-1-like RNA-binding protein  40.96 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0020786  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  41.67 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  42.5 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  39.76 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  37.21 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  39.02 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  39.13 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  38.37 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  34.57 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12693  predicted protein  36.36 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689101  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  39.02 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03577  RNA-binding protein  42.11 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000014599  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  38.37 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  36.14 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  37.04 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  37.04 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00121  RNA recognition motif-containing protein  37.97 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.044748  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  37.8 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1867  RNP1-like RNA-binding protein  39.33 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000148151  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  38.27 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  38.27 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  37.97 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00121  RNA recognition motif-containing protein  37.18 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.3683  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  37.04 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  35.8 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  36.59 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1603  RNP-1 like RNA-binding protein  36.25 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2264  RNP-1 like RNA-binding protein  36.96 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683035  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  37.65 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  35.37 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3309  RNP-1 like RNA-binding protein  37.35 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  37.8 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0637  RNP-1 like RNA-binding protein  38.75 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  39.02 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  38.27 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  36.59 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  38.27 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  36.59 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  37.35 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  37.8 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  38.46 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  36.59 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  38.27 
 
 		 202 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  37.04 
 
 		 103 aa  57  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00255  RNA binding protein  40.79 
 
 		 226 aa  57  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  36.14 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2964  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 		 88 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  39.02 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  36.71 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4015  RNA-binding region RNP-1  40.79 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000301969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>