126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49387 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_49387  predicted protein  100 
 
 		 330 aa  673    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.452318  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92667  predicted protein  35.27 
 
 		 284 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000121698  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48602  predicted protein  39.58 
 
 		 582 aa  82  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  27.44 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  27.31 
 
 		 524 aa  68.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.046271 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  28.8 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15612  predicted protein  24.22 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  39.74 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  38.46 
 
 		 250 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2631  RNA-binding region RNP-1  37.66 
 
 		 134 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000024713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  38.46 
 
 		 250 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33568  predicted protein  25.24 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0922684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  39.74 
 
 		 88 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0124  RNP-1 like RNA-binding protein  38.27 
 
 		 94 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000291811  decreased coverage  0.0000109119 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  39.74 
 
 		 109 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  38.46 
 
 		 222 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 		 89 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 		 88 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  37.97 
 
 		 114 aa  53.9  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00121  RNA recognition motif-containing protein  37.18 
 
 		 217 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.044748  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  36.99 
 
 		 143 aa  53.1  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  38.46 
 
 		 222 aa  53.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1603  RNP-1 like RNA-binding protein  37.18 
 
 		 103 aa  53.1  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  39.74 
 
 		 202 aa  53.1  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  37.21 
 
 		 140 aa  52.8  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  22.99 
 
 		 552 aa  52.8  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  38.36 
 
 		 103 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  36.36 
 
 		 90 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  34.57 
 
 		 88 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  38.46 
 
 		 99 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  41.03 
 
 		 173 aa  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  36.73 
 
 		 101 aa  52  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00121  RNA recognition motif-containing protein  37.33 
 
 		 203 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.3683  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  33.75 
 
 		 115 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  39.74 
 
 		 146 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  39.74 
 
 		 96 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  37.66 
 
 		 81 aa  50.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  36.05 
 
 		 134 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  38.46 
 
 		 102 aa  50.8  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  34.12 
 
 		 116 aa  50.8  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  35.63 
 
 		 149 aa  51.2  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  39.19 
 
 		 89 aa  50.8  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  35.44 
 
 		 88 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05240  mRNA catabolism, nonsense-mediated-related protein, putative  28.21 
 
 		 434 aa  50.4  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115659  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  35.63 
 
 		 155 aa  50.1  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  37.18 
 
 		 92 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  41.03 
 
 		 99 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  37.18 
 
 		 92 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  35.62 
 
 		 111 aa  49.7  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  36.05 
 
 		 132 aa  49.7  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12693  predicted protein  31.46 
 
 		 151 aa  49.7  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689101  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  36.05 
 
 		 137 aa  49.3  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  37.93 
 
 		 181 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  34.67 
 
 		 373 aa  48.9  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  32.05 
 
 		 196 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55837  predicted protein  24.61 
 
 		 453 aa  48.9  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.876442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  36 
 
 		 76 aa  48.5  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4357  RNP-1 like RNA-binding protein  39.74 
 
 		 97 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  37.18 
 
 		 103 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  36.78 
 
 		 176 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  38.46 
 
 		 83 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  35.9 
 
 		 94 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04665  hypothetical protein  33.78 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0330259  normal  0.410978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  37.04 
 
 		 94 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  34.57 
 
 		 82 aa  47.8  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  34.88 
 
 		 148 aa  47.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  34.88 
 
 		 150 aa  47.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  33.33 
 
 		 162 aa  47.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 		 125 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38809  predicted protein  24.61 
 
 		 319 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000594517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 		 104 aa  47.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  35.9 
 
 		 94 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  30.77 
 
 		 110 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0338  RNA-binding protein  33.33 
 
 		 160 aa  47  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  39.24 
 
 		 86 aa  47  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 		 122 aa  47  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  35.63 
 
 		 176 aa  47.4  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  34.48 
 
 		 151 aa  47  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  33.33 
 
 		 97 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  36.71 
 
 		 97 aa  46.6  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  34.48 
 
 		 152 aa  46.6  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45495  predicted protein  36.99 
 
 		 155 aa  46.6  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal  0.923833 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3437  RNP-1 like RNA-binding protein  34.57 
 
 		 158 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369251 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  35.8 
 
 		 104 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  26.74 
 
 		 112 aa  46.2  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3960  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 		 195 aa  46.6  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000285938  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  39.74 
 
 		 98 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4045  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 		 196 aa  45.8  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.847138 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  33.77 
 
 		 87 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  34.48 
 
 		 175 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44442  predicted protein  21.65 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00448439  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 105 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2964  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 88 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 		 87 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  32.91 
 
 		 114 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0679  RNA-binding region RNP-1  35.9 
 
 		 107 aa  44.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  41.03 
 
 		 89 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  29.63 
 
 		 207 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  33.77 
 
 		 86 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1139  RNA binding protein  33.33 
 
 		 129 aa  44.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000522116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>