255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_45495 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_45495  predicted protein  100 
 
 
155 aa  303  7e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal  0.923833 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50467  predicted protein  48.54 
 
 
217 aa  111  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.446358  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_7571  predicted protein  56.99 
 
 
144 aa  106  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.102168 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01340  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09490)  53.33 
 
 
187 aa  102  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.575535  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04570  poly(A) binding protein, putative  50 
 
 
210 aa  99.8  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0559902  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13095  predicted protein  51.16 
 
 
97 aa  96.3  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  42.47 
 
 
122 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0967  RNP-1 like RNA-binding protein  36.14 
 
 
221 aa  68.2  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191765  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  35.64 
 
 
102 aa  67.4  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  38.46 
 
 
101 aa  66.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1499  RNA-binding region RNP-1  35.23 
 
 
100 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212691  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
90 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  41.56 
 
 
110 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  41.89 
 
 
97 aa  65.1  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1615  RNP-1 like RNA-binding protein  40.96 
 
 
85 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00287143  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  34.04 
 
 
119 aa  64.3  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  37.84 
 
 
90 aa  64.3  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  41.56 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  43.24 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  36.96 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  36.36 
 
 
104 aa  60.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  36.49 
 
 
90 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  34.62 
 
 
107 aa  60.1  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01517  nucleic acid-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05260)  34.09 
 
 
450 aa  59.7  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000597445  normal  0.366843 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  36.59 
 
 
87 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  34.62 
 
 
112 aa  60.1  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  33.78 
 
 
90 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  36.49 
 
 
90 aa  60.1  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43898  predicted protein  34.15 
 
 
173 aa  59.3  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00800465  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  38.61 
 
 
98 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  37.66 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1404  RNA-binding region RNP-1  36.49 
 
 
95 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.187524  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1038  RNP-1 like RNA-binding protein  35.71 
 
 
98 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  38.96 
 
 
82 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  34.18 
 
 
104 aa  58.9  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  35.44 
 
 
146 aa  58.9  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  34.69 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  34.69 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 
105 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  35.62 
 
 
76 aa  58.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2673  RNP-1 like RNA-binding protein  33.78 
 
 
90 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09671  RNA-binding protein RbpD  35.14 
 
 
104 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  35 
 
 
207 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.882388 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07350  translation initiation factor 4B (AFU_orthologue; AFUA_2G16400)  36.49 
 
 
497 aa  58.2  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628412  normal  0.665628 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  37.84 
 
 
94 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 
115 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  32.05 
 
 
86 aa  57.8  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  39.19 
 
 
111 aa  57.4  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1645  RNA recognition motif-containing protein  36.49 
 
 
95 aa  57.4  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 
88 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  37.66 
 
 
114 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  34.12 
 
 
88 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  34.62 
 
 
86 aa  56.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  35.87 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  30.21 
 
 
441 aa  57  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 
99 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
83 aa  57  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10848  ribonucleoprotein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05810)  34.09 
 
 
340 aa  55.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  33.78 
 
 
95 aa  56.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  32.91 
 
 
95 aa  56.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  36.59 
 
 
88 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  30.34 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2264  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
101 aa  56.2  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683035  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  39.19 
 
 
103 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  33.78 
 
 
99 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  30.49 
 
 
88 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2631  RNA-binding region RNP-1  34.18 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000024713  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  33.78 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  33.33 
 
 
143 aa  55.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  32.43 
 
 
90 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  36.49 
 
 
99 aa  55.5  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1761  RNP-1 like RNA-binding protein  38.46 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000106406  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1324  RNA-binding protein  36.71 
 
 
107 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  33.78 
 
 
455 aa  55.1  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  30.49 
 
 
88 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51283  predicted protein  35.44 
 
 
328 aa  54.7  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  37.66 
 
 
103 aa  54.7  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  31.25 
 
 
102 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  31.25 
 
 
102 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0093  RNP-1 like RNA-binding protein  32.43 
 
 
90 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10276  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07120)  34.02 
 
 
138 aa  54.3  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.012473  normal  0.330154 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4642  RNA-binding region RNP-1  37.66 
 
 
102 aa  54.3  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0167628  normal  0.0600558 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  29.73 
 
 
90 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  31.33 
 
 
122 aa  53.9  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_710  predicted protein  36.27 
 
 
874 aa  53.9  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11941  peptidylprolyl isomerase  35.14 
 
 
97 aa  53.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  normal  0.27768 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  33.78 
 
 
196 aa  53.9  0.0000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1573  RNA recognition motif-containing protein  31.76 
 
 
112 aa  53.9  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  30.12 
 
 
121 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20857  predicted protein  25.84 
 
 
687 aa  53.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.821409  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  35.62 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26750  predicted protein  31.65 
 
 
231 aa  53.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4357  RNP-1 like RNA-binding protein  36.36 
 
 
97 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  38.16 
 
 
116 aa  53.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  35.06 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>