181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB04570 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB04570  poly(A) binding protein, putative  100 
 
 
210 aa  432  1e-120  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0559902  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01340  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09490)  72 
 
 
187 aa  159  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.575535  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_7571  predicted protein  45.27 
 
 
144 aa  122  4e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.102168 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13095  predicted protein  61.18 
 
 
97 aa  120  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50467  predicted protein  41.55 
 
 
217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.446358  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45495  predicted protein  43.28 
 
 
155 aa  99.8  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal  0.923833 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 
90 aa  60.5  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07350  translation initiation factor 4B (AFU_orthologue; AFUA_2G16400)  35.87 
 
 
497 aa  57.4  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628412  normal  0.665628 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 
89 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_006686  CND02550  conserved hypothetical protein  30.97 
 
 
319 aa  56.2  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  37.18 
 
 
89 aa  55.5  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  29.27 
 
 
87 aa  55.5  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  32.47 
 
 
90 aa  54.7  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  34.25 
 
 
114 aa  53.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0338  RNA-binding protein  30.38 
 
 
160 aa  53.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2964  RNP-1 like RNA-binding protein  29.63 
 
 
88 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  32.98 
 
 
94 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  32.88 
 
 
97 aa  53.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 
90 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  32.98 
 
 
94 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  34.67 
 
 
90 aa  52.4  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  30.67 
 
 
90 aa  52.8  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4015  RNA-binding region RNP-1  35.71 
 
 
151 aa  52.4  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000301969  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04330  ribosome biogenesis (Nop4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06250)  29.46 
 
 
724 aa  52.4  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1038  RNP-1 like RNA-binding protein  29.81 
 
 
98 aa  52.4  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  32 
 
 
105 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  30.77 
 
 
146 aa  52  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  29.25 
 
 
119 aa  52  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  32 
 
 
88 aa  52  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0321  hypothetical protein  29.63 
 
 
91 aa  51.6  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  31.65 
 
 
86 aa  51.6  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  29.87 
 
 
102 aa  51.6  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  29.63 
 
 
90 aa  51.6  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  30.86 
 
 
88 aa  51.6  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2901  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
102 aa  50.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  27.27 
 
 
90 aa  50.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84007  predicted protein  36.99 
 
 
439 aa  51.2  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  27.1 
 
 
115 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  30.77 
 
 
99 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  29.87 
 
 
90 aa  50.1  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  32.47 
 
 
114 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  29.63 
 
 
88 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  29.87 
 
 
90 aa  50.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_710  predicted protein  31.97 
 
 
874 aa  50.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1615  RNP-1 like RNA-binding protein  36.59 
 
 
85 aa  49.7  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00287143  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21039  predicted protein  30.59 
 
 
246 aa  49.7  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03427  RNA binding protein Rnp24, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05840)  34.48 
 
 
357 aa  49.7  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.820047  normal  0.0382541 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  32.47 
 
 
109 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  29.49 
 
 
81 aa  49.7  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  32.47 
 
 
104 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10574  pre-mRNA splicing factor (Prp24), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01820)  30.65 
 
 
1290 aa  49.3  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314247  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  29.17 
 
 
99 aa  49.7  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0401  RNP-1 like RNA-binding protein  29.87 
 
 
92 aa  49.3  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000557638  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  29.33 
 
 
87 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  31.51 
 
 
143 aa  49.7  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0967  RNP-1 like RNA-binding protein  31.65 
 
 
221 aa  49.3  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191765  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  25.93 
 
 
88 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  33.33 
 
 
76 aa  48.9  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  31.17 
 
 
92 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  32.88 
 
 
94 aa  48.5  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  31.17 
 
 
92 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2264  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 
101 aa  48.1  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683035  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1867  RNP1-like RNA-binding protein  29.49 
 
 
89 aa  48.5  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000148151  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  33.33 
 
 
86 aa  48.5  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  25.93 
 
 
89 aa  48.1  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  28.75 
 
 
90 aa  47.4  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  29.87 
 
 
95 aa  48.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2673  RNP-1 like RNA-binding protein  27.4 
 
 
90 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20857  predicted protein  26.21 
 
 
687 aa  47.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.821409  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86797  predicted protein  28.1 
 
 
838 aa  47.8  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46145  predicted protein  37.97 
 
 
393 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0356931  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06110  rRNA primary transcript binding protein, putative  26.77 
 
 
769 aa  47.4  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  31.68 
 
 
98 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4642  RNA-binding region RNP-1  38.3 
 
 
102 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0167628  normal  0.0600558 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  31.65 
 
 
107 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0944  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 
117 aa  47  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3508  RNP-1 like RNA-binding protein  35.44 
 
 
153 aa  47  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482673  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  31.68 
 
 
98 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1761  RNP-1 like RNA-binding protein  32.05 
 
 
96 aa  47  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000106406  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15612  predicted protein  31.63 
 
 
303 aa  47  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0178  RNP-1 like RNA-binding protein  35.44 
 
 
154 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000203464  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  28.4 
 
 
101 aa  46.6  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0166  RNP-1 like RNA-binding protein  31.17 
 
 
151 aa  46.6  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000221523  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0208  RNA-binding protein  34.18 
 
 
154 aa  46.2  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  30.77 
 
 
83 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4074  RNP-1 like RNA-binding protein  35.44 
 
 
154 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000591995  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42846  predicted protein  34.21 
 
 
516 aa  46.6  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.54724 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4176  RNP-1 like RNA-binding protein  35.44 
 
 
154 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0182  RNP-1 like RNA-binding protein  35.44 
 
 
154 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000432928  hitchhiker  0.00837192 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10941  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein HRP1 (AFU_orthologue; AFUA_2G06090)  23.08 
 
 
559 aa  45.8  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210274  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  32.93 
 
 
88 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  28.57 
 
 
207 aa  45.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  30.26 
 
 
134 aa  46.2  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0180  RNP-1 like RNA-binding protein  30.77 
 
 
154 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000725181  normal  0.749946 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0175  RNP-1 like RNA-binding protein  30.77 
 
 
154 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000046912  hitchhiker  0.00946838 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  28.95 
 
 
122 aa  45.8  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0181  RNP-1-like RNA-binding protein  30.77 
 
 
154 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814275  normal  0.581259 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  28.57 
 
 
95 aa  45.8  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  30.14 
 
 
99 aa  46.2  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0093  RNP-1 like RNA-binding protein  27.4 
 
 
90 aa  46.2  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>