113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_42846 on replicon NC_009362
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009362  OSTLU_42846  predicted protein  100 
 
 
516 aa  1041    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.54724 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  32.85 
 
 
552 aa  190  5.999999999999999e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04060  conserved hypothetical protein  29.22 
 
 
615 aa  169  9e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.639663  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20857  predicted protein  30.12 
 
 
687 aa  138  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.821409  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  33.16 
 
 
441 aa  90.9  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  28.42 
 
 
245 aa  65.1  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10574  pre-mRNA splicing factor (Prp24), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01820)  28.02 
 
 
1290 aa  63.5  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314247  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  28.5 
 
 
524 aa  62.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.046271 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06681  splicing factor u2af large subunit (AFU_orthologue; AFUA_7G05310)  21.21 
 
 
547 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.502661 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  39.51 
 
 
143 aa  58.5  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29530  predicted protein  32.04 
 
 
333 aa  58.5  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.145211  normal  0.172268 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  25.97 
 
 
572 aa  57.8  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68431  predicted protein  27.71 
 
 
481 aa  56.6  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.326918  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34381  predicted protein  27.55 
 
 
319 aa  56.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.693095  normal  0.168449 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01188  nuclear mRNA splicing factor-associated protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10920)  35 
 
 
396 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  23.38 
 
 
477 aa  54.3  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  32.88 
 
 
104 aa  54.3  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31221  predicted protein  35.44 
 
 
727 aa  53.5  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.005519  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86797  predicted protein  25.11 
 
 
838 aa  53.1  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07350  translation initiation factor 4B (AFU_orthologue; AFUA_2G16400)  30.77 
 
 
497 aa  52.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628412  normal  0.665628 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07706  RNA binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08310)  32.18 
 
 
328 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01940  conserved hypothetical protein  30.77 
 
 
480 aa  52  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  37.84 
 
 
114 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21039  predicted protein  26.63 
 
 
246 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  35.8 
 
 
455 aa  52  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04330  ribosome biogenesis (Nop4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06250)  26 
 
 
724 aa  51.6  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45495  predicted protein  32.69 
 
 
155 aa  51.2  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal  0.923833 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  31.17 
 
 
250 aa  51.2  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  29.87 
 
 
173 aa  50.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  31.17 
 
 
250 aa  51.2  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11145  predicted protein  21.3 
 
 
325 aa  50.8  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.860159  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  38.67 
 
 
76 aa  50.1  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03490  splicing factor u2af-associated protein 2, putative  31.48 
 
 
489 aa  49.7  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57807  predicted protein  35.71 
 
 
383 aa  50.1  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0302105 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12693  predicted protein  28.16 
 
 
151 aa  50.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689101  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2980  RNP-1 like RNA-binding protein  36.84 
 
 
241 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0728065  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  22.7 
 
 
632 aa  49.3  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  35 
 
 
86 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1139  RNA binding protein  27.84 
 
 
129 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000522116  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1009  glycine-rich RNA binding protein  28.21 
 
 
128 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000973374  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1761  RNP-1 like RNA-binding protein  37.84 
 
 
96 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000106406  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42828  predicted protein  24.86 
 
 
499 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_51303  predicted protein  26.96 
 
 
222 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03953  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08040)  32.05 
 
 
353 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.748027  normal  0.180065 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01340  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09490)  33.71 
 
 
187 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.575535  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 
125 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  27.03 
 
 
373 aa  48.5  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  35.62 
 
 
82 aa  48.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  30.38 
 
 
88 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04570  poly(A) binding protein, putative  34.21 
 
 
210 aa  47.8  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0559902  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  31.17 
 
 
222 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  28.57 
 
 
245 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  28.57 
 
 
202 aa  47.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  32.88 
 
 
162 aa  47.8  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0352  RNP-1 like RNA-binding protein  35.44 
 
 
109 aa  47.8  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0296626  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01910  conserved hypothetical protein  29.79 
 
 
253 aa  47.4  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_710  predicted protein  43.14 
 
 
874 aa  47.4  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3309  RNP-1 like RNA-binding protein  32.05 
 
 
82 aa  47.4  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788689  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  32.88 
 
 
83 aa  47.4  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06501  splicing factor 3b subunit 4 (AFU_orthologue; AFUA_6G05180)  22.75 
 
 
352 aa  47  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  33.78 
 
 
97 aa  47  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_006686  CND05240  mRNA catabolism, nonsense-mediated-related protein, putative  26.7 
 
 
434 aa  47  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115659  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  28.57 
 
 
196 aa  47  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  33.33 
 
 
81 aa  47  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  36.99 
 
 
207 aa  47  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10029  predicted protein  26.67 
 
 
109 aa  47  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10941  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein HRP1 (AFU_orthologue; AFUA_2G06090)  24.08 
 
 
559 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210274  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  33.33 
 
 
107 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32340  predicted protein  40.54 
 
 
314 aa  46.6  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.46857  normal  0.27086 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_7571  predicted protein  33.75 
 
 
144 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.102168 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8830  predicted protein  35.21 
 
 
122 aa  47  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0913376 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1603  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
103 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  29.11 
 
 
108 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.200874 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04665  hypothetical protein  31.08 
 
 
279 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0330259  normal  0.410978 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09090  Putative RNA binding proteinPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARJ0]  22.77 
 
 
393 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461764  normal  0.414423 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00210  RNA-binding protein sce3, putative  29.81 
 
 
512 aa  45.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  28.57 
 
 
222 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0637  RNP-1 like RNA-binding protein  31.94 
 
 
160 aa  45.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00121  RNA recognition motif-containing protein  27.27 
 
 
203 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.3683  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84007  predicted protein  26.26 
 
 
439 aa  45.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  33.33 
 
 
112 aa  45.8  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  33.33 
 
 
107 aa  45.8  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1038  RNP-1 like RNA-binding protein  36.49 
 
 
98 aa  45.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0321  hypothetical protein  28.4 
 
 
91 aa  45.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  31.94 
 
 
122 aa  45.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  28 
 
 
102 aa  45.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  28 
 
 
102 aa  45.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23959  predicted protein  21.93 
 
 
605 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0338  RNA-binding protein  38.89 
 
 
160 aa  44.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0980  RNA-binding region RNP-1  31.17 
 
 
81 aa  44.7  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.000651233  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62299  predicted protein  21.58 
 
 
446 aa  44.7  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0191  RNP-1 like RNA-binding protein  33.78 
 
 
87 aa  45.1  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000794742  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04000  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein)(PABP)(Polyadenylate tail-binding protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B630]  24.16 
 
 
732 aa  44.3  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.175791 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55837  predicted protein  32.98 
 
 
453 aa  44.3  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.876442  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48043  predicted protein  30.36 
 
 
233 aa  44.3  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111526  normal  0.12113 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  30.26 
 
 
85 aa  44.3  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  30.14 
 
 
149 aa  44.3  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00121  RNA recognition motif-containing protein  27.27 
 
 
217 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.044748  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9701  predicted protein  31.94 
 
 
125 aa  44.3  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02550  conserved hypothetical protein  34.21 
 
 
319 aa  43.9  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>