33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND02550 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND02550  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  639    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04748  RNA binding protein (AFU_orthologue; AFUA_3G06310)  46.15 
 
 		 339 aa  97.4  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.311535  normal  0.626958 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32836  predicted protein  43.65 
 
 		 300 aa  89.4  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29641  predicted protein  40.52 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.143642 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_710  predicted protein  31.12 
 
 		 874 aa  60.5  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04570  poly(A) binding protein, putative  31.86 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0559902  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  35.06 
 
 		 107 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92667  predicted protein  34.94 
 
 		 284 aa  50.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000121698  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  34.15 
 
 		 245 aa  50.1  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06110  rRNA primary transcript binding protein, putative  35.82 
 
 		 769 aa  49.7  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  32.47 
 
 		 207 aa  49.7  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33568  predicted protein  36.56 
 
 		 387 aa  48.9  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0922684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  32.14 
 
 		 119 aa  48.5  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13095  predicted protein  35.53 
 
 		 97 aa  48.5  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  33.77 
 
 		 143 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01340  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09490)  33.33 
 
 		 187 aa  47.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.575535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  38.75 
 
 		 76 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4015  RNA-binding region RNP-1  34.62 
 
 		 151 aa  47  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000301969  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2980  RNP-1 like RNA-binding protein  30.28 
 
 		 241 aa  47  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0728065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 		 88 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_8269  predicted protein  34.21 
 
 		 77 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1761  RNP-1 like RNA-binding protein  36.84 
 
 		 96 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000106406  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_35048  predicted protein  30.38 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.541966  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  30.17 
 
 		 524 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.046271 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1038  RNP-1 like RNA-binding protein  31.17 
 
 		 98 aa  45.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  30.38 
 
 		 115 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2518  RNP-1-like RNA-binding protein  34.21 
 
 		 85 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0020786  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  30.26 
 
 		 85 aa  43.1  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13520  predicted protein  35.63 
 
 		 127 aa  42.7  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00556924  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 373 aa  42.7  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  29.87 
 
 		 250 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84007  predicted protein  29.63 
 
 		 439 aa  42.4  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  29.87 
 
 		 250 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>