157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_33568 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009047  PICST_33568  predicted protein  100 
 
 
387 aa  781    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0922684  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03427  RNA binding protein Rnp24, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05840)  35.04 
 
 
357 aa  173  5.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.820047  normal  0.0382541 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06850  RNA-binding protein rnp24, putative  33.16 
 
 
449 aa  135  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  26.59 
 
 
441 aa  77.8  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  26.39 
 
 
524 aa  66.2  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.046271 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  36.49 
 
 
76 aa  62.4  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  35.44 
 
 
196 aa  60.1  0.00000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  36.71 
 
 
173 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  35.9 
 
 
222 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  34.18 
 
 
202 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  35.44 
 
 
250 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  35.44 
 
 
250 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  34.62 
 
 
245 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44442  predicted protein  24.36 
 
 
269 aa  57  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00448439  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  28.1 
 
 
245 aa  57  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  29.27 
 
 
109 aa  56.6  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  34.62 
 
 
222 aa  56.2  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46145  predicted protein  36.25 
 
 
393 aa  56.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0356931  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49387  predicted protein  25.24 
 
 
330 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.452318  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  32.1 
 
 
101 aa  55.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  23.73 
 
 
552 aa  55.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  27.59 
 
 
97 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  30 
 
 
86 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00121  RNA recognition motif-containing protein  34.72 
 
 
203 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.3683  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  29.89 
 
 
89 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  31.25 
 
 
455 aa  53.9  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10941  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein HRP1 (AFU_orthologue; AFUA_2G06090)  22.22 
 
 
559 aa  53.5  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210274  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00121  RNA recognition motif-containing protein  34.62 
 
 
217 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.044748  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01940  conserved hypothetical protein  21.88 
 
 
480 aa  53.1  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  30.95 
 
 
89 aa  53.1  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04665  hypothetical protein  30.67 
 
 
279 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0330259  normal  0.410978 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  30.77 
 
 
114 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  29.17 
 
 
98 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  31.4 
 
 
88 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  25.93 
 
 
99 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  29.63 
 
 
103 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68431  predicted protein  34.78 
 
 
481 aa  51.2  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.326918  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 
373 aa  50.8  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15612  predicted protein  23.81 
 
 
303 aa  50.8  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01517  nucleic acid-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05260)  22.07 
 
 
450 aa  50.4  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000597445  normal  0.366843 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01340  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09490)  33.33 
 
 
187 aa  50.4  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.575535  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  30.12 
 
 
95 aa  50.4  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  27 
 
 
102 aa  50.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  31.71 
 
 
125 aa  50.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1867  RNP1-like RNA-binding protein  42.86 
 
 
89 aa  50.1  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000148151  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4357  RNP-1 like RNA-binding protein  29.27 
 
 
97 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02550  conserved hypothetical protein  36.56 
 
 
319 aa  49.7  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  32.86 
 
 
137 aa  49.7  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  29.89 
 
 
90 aa  49.7  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44395  predicted protein  34.92 
 
 
313 aa  49.7  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00014935  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27365  predicted protein  21.86 
 
 
288 aa  49.7  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.60406  normal  0.0267412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  31.43 
 
 
176 aa  49.7  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2264  RNP-1 like RNA-binding protein  29.03 
 
 
101 aa  49.3  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683035  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  27.63 
 
 
88 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  28.21 
 
 
103 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3309  RNP-1 like RNA-binding protein  35.85 
 
 
82 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788689  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20857  predicted protein  23.81 
 
 
687 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.821409  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  29.07 
 
 
90 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  29.49 
 
 
102 aa  49.3  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  29.76 
 
 
87 aa  49.3  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  34.25 
 
 
207 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13095  predicted protein  31.65 
 
 
97 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  32.2 
 
 
107 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21039  predicted protein  40 
 
 
246 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  30.56 
 
 
111 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  28.57 
 
 
162 aa  48.9  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50467  predicted protein  29.33 
 
 
217 aa  48.5  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.446358  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0967  RNP-1 like RNA-binding protein  35.21 
 
 
221 aa  48.9  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191765  normal  0.616153 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10574  pre-mRNA splicing factor (Prp24), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01820)  28.08 
 
 
1290 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314247  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  25.93 
 
 
90 aa  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1499  RNA-binding region RNP-1  28.24 
 
 
100 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212691  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  30.56 
 
 
82 aa  47.8  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  30 
 
 
104 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  26.74 
 
 
88 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  24.77 
 
 
632 aa  48.1  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06501  splicing factor 3b subunit 4 (AFU_orthologue; AFUA_6G05180)  27.78 
 
 
352 aa  47.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1603  RNP-1 like RNA-binding protein  28.92 
 
 
103 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  30.77 
 
 
94 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  25.61 
 
 
94 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  25.61 
 
 
94 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  31.43 
 
 
146 aa  47  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6420  predicted protein  35.53 
 
 
264 aa  47  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0177398  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  30.56 
 
 
90 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  22.62 
 
 
110 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04570  poly(A) binding protein, putative  31.37 
 
 
210 aa  46.6  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0559902  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  25.93 
 
 
103 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  26.83 
 
 
99 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48462  predicted protein  31.94 
 
 
372 aa  46.6  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.237219  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1761  RNP-1 like RNA-binding protein  40.74 
 
 
96 aa  46.6  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000106406  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  27.16 
 
 
90 aa  46.6  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_9858  predicted protein  26.44 
 
 
92 aa  46.6  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0809817  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8830  predicted protein  24.14 
 
 
122 aa  46.6  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0913376 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9701  predicted protein  31.52 
 
 
125 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  28.21 
 
 
92 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  41.18 
 
 
81 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  27.94 
 
 
151 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  28.57 
 
 
176 aa  46.2  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  26.39 
 
 
148 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  27.14 
 
 
150 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_7191  predicted protein  28.21 
 
 
217 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.421608  normal  0.373889 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>