292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI03180 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  100 
 
 
373 aa  735    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04665  hypothetical protein  66.36 
 
 
279 aa  166  6.9999999999999995e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0330259  normal  0.410978 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8830  predicted protein  55.93 
 
 
122 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0913376 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9701  predicted protein  59.65 
 
 
125 aa  145  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48043  predicted protein  49.17 
 
 
233 aa  129  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111526  normal  0.12113 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  42.67 
 
 
143 aa  71.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  42.11 
 
 
108 aa  70.1  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.200874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  37.36 
 
 
99 aa  70.1  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_5724  predicted protein  41.38 
 
 
291 aa  68.9  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181544  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  43.84 
 
 
88 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  43.42 
 
 
85 aa  68.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  44.74 
 
 
86 aa  67.4  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  34.25 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00121  RNA recognition motif-containing protein  35.62 
 
 
217 aa  67  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.044748  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  43.42 
 
 
87 aa  67  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  34.25 
 
 
222 aa  67  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42828  predicted protein  38.46 
 
 
499 aa  66.6  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 
89 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  42.11 
 
 
88 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  34.25 
 
 
173 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  40.79 
 
 
104 aa  65.1  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
114 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  32.88 
 
 
245 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00121  RNA recognition motif-containing protein  34.25 
 
 
203 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.3683  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  44 
 
 
91 aa  64.7  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  32.88 
 
 
250 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  39.47 
 
 
94 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  42.11 
 
 
88 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  39.47 
 
 
94 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1118  RNP-1 like RNA-binding protein  39.73 
 
 
101 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.761285  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  32.88 
 
 
250 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  40.79 
 
 
82 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  32 
 
 
202 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  40.96 
 
 
83 aa  63.9  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 
99 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  40.79 
 
 
112 aa  63.9  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68431  predicted protein  39.71 
 
 
481 aa  63.9  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.326918  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  40.79 
 
 
107 aa  63.9  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01910  conserved hypothetical protein  36.84 
 
 
253 aa  63.9  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  36.84 
 
 
90 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  41.1 
 
 
87 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  36.84 
 
 
98 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  35.37 
 
 
89 aa  63.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  37.33 
 
 
86 aa  63.5  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  32 
 
 
196 aa  63.2  0.000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  38.67 
 
 
90 aa  63.2  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  37.33 
 
 
90 aa  62.8  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 
89 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  36.84 
 
 
92 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2673  RNP-1 like RNA-binding protein  41.1 
 
 
90 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  36.84 
 
 
92 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  36.84 
 
 
109 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 
101 aa  62.4  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  42.47 
 
 
89 aa  62.8  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  44.74 
 
 
146 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20857  predicted protein  34.72 
 
 
687 aa  62.4  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.821409  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0093  RNP-1 like RNA-binding protein  41.1 
 
 
90 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  40.79 
 
 
98 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  38.1 
 
 
99 aa  62  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  40.79 
 
 
98 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  36.84 
 
 
104 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 
90 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 
96 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  41.03 
 
 
88 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 
90 aa  60.5  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2980  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 
241 aa  60.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0728065  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  36.84 
 
 
107 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  35.53 
 
 
97 aa  60.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  35.53 
 
 
102 aa  60.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2264  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 
101 aa  60.5  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683035  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 
102 aa  60.5  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0321  hypothetical protein  45.83 
 
 
91 aa  60.5  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2518  RNP-1-like RNA-binding protein  36.47 
 
 
85 aa  60.1  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0020786  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10941  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein HRP1 (AFU_orthologue; AFUA_2G06090)  35 
 
 
559 aa  60.1  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210274  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  32 
 
 
441 aa  60.1  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  36.84 
 
 
90 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_27034  predicted protein  35.62 
 
 
252 aa  60.1  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.64186  normal  0.132821 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  41.1 
 
 
88 aa  60.1  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  38.67 
 
 
76 aa  59.7  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  40.28 
 
 
552 aa  59.7  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  39.29 
 
 
88 aa  59.7  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 
115 aa  59.7  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 
105 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0191  RNP-1 like RNA-binding protein  36.84 
 
 
87 aa  58.9  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000794742  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  38.46 
 
 
110 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 
175 aa  58.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_41450  predicted protein  48.15 
 
 
291 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  36.84 
 
 
90 aa  59.3  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  40.26 
 
 
94 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2340  RNA-binding protein  40.28 
 
 
152 aa  58.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000791168  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  36.49 
 
 
182 aa  58.2  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  38.96 
 
 
103 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2964  RNP-1 like RNA-binding protein  39.73 
 
 
88 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0679  RNA-binding region RNP-1  38.16 
 
 
107 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0790  RNA-binding region RNP-1  35.44 
 
 
142 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.188882 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  38.16 
 
 
95 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 
95 aa  58.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  36.84 
 
 
176 aa  58.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  38.96 
 
 
103 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  40.26 
 
 
103 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>